MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

< Previous12...3031323334353637383940...4849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_004842	T	7	7	852110	852116	0 %	100 %	0 %	0 %	56417020
17002	NC_004842	CGT	2	6	852331	852336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17003	NC_004842	GCAG	2	8	852451	852458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17004	NC_004842	CCG	2	6	852471	852476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17005	NC_004842	CTC	2	6	852482	852487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17006	NC_004842	TTC	2	6	852576	852581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417021
17007	NC_004842	GGC	2	6	852629	852634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417021
17008	NC_004842	TC	3	6	852682	852687	0 %	50 %	0 %	50 %	56417021
17009	NC_004842	AGG	2	6	852688	852693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417021
17010	NC_004842	CA	3	6	852742	852747	50 %	0 %	0 %	50 %	56417021
17011	NC_004842	ACGC	2	8	852781	852788	25 %	0 %	25 %	50 %	56417021
17012	NC_004842	ATG	2	6	852829	852834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417021
17013	NC_004842	GGGC	2	8	852836	852843	0 %	0 %	75 %	25 %	56417021
17014	NC_004842	ATC	2	6	852894	852899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417021
17015	NC_004842	TGG	2	6	852961	852966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417021
17016	NC_004842	TTG	2	6	852973	852978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417021
17017	NC_004842	AGC	2	6	853027	853032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417021
17018	NC_004842	CAT	2	6	853034	853039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417021
17019	NC_004842	A	6	6	853094	853099	100 %	0 %	0 %	0 %	56417021
17020	NC_004842	CGG	2	6	853204	853209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417021
17021	NC_004842	GGT	2	6	853363	853368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_004842	TG	3	6	853400	853405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_004842	CG	3	6	853411	853416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17024	NC_004842	GGC	2	6	853422	853427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17025	NC_004842	CA	3	6	853609	853614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17026	NC_004842	GC	3	6	853627	853632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17027	NC_004842	TGC	2	6	853697	853702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17028	NC_004842	GCTTT	2	10	853709	853718	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17029	NC_004842	TAG	2	6	853729	853734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_004842	TGC	2	6	853740	853745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17031	NC_004842	ACT	2	6	853848	853853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417022
17032	NC_004842	CAA	2	6	853923	853928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417022
17033	NC_004842	GACC	2	8	853933	853940	25 %	0 %	25 %	50 %	56417022
17034	NC_004842	AT	3	6	853960	853965	50 %	50 %	0 %	0 %	56417022
17035	NC_004842	ATT	2	6	853985	853990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417022
17036	NC_004842	GA	3	6	853991	853996	50 %	0 %	50 %	0 %	56417022
17037	NC_004842	ATC	2	6	853997	854002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417022
17038	NC_004842	GAAA	2	8	854005	854012	75 %	0 %	25 %	0 %	56417022
17039	NC_004842	G	6	6	854039	854044	0 %	0 %	100 %	0 %	56417022
17040	NC_004842	GGA	2	6	854146	854151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417022
17041	NC_004842	CCT	2	6	854277	854282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417022
17042	NC_004842	GGC	3	9	854300	854308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417022
17043	NC_004842	GC	3	6	854312	854317	0 %	0 %	50 %	50 %	56417022
17044	NC_004842	AAT	2	6	854395	854400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417022
17045	NC_004842	TTACG	2	10	854529	854538	20 %	40 %	20 %	20 %	56417022
17046	NC_004842	GAG	2	6	854543	854548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417022
17047	NC_004842	CGG	2	6	854605	854610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417022
17048	NC_004842	CAT	2	6	854805	854810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417022
17049	NC_004842	GTG	2	6	854831	854836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417022
17050	NC_004842	GGTC	2	8	854930	854937	0 %	25 %	50 %	25 %	56417022
17051	NC_004842	T	6	6	855002	855007	0 %	100 %	0 %	0 %	56417022
17052	NC_004842	CA	3	6	855016	855021	50 %	0 %	0 %	50 %	56417022
17053	NC_004842	CAG	2	6	855061	855066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417022
17054	NC_004842	TAG	2	6	855168	855173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417022
17055	NC_004842	CAAA	2	8	855209	855216	75 %	0 %	0 %	25 %	56417022
17056	NC_004842	GCT	2	6	855223	855228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417022
17057	NC_004842	ATA	2	6	855461	855466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417022
17058	NC_004842	CGC	2	6	855526	855531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417022
17059	NC_004842	ATC	2	6	855566	855571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417022
17060	NC_004842	CAT	2	6	855658	855663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417022
17061	NC_004842	TCGA	2	8	855788	855795	25 %	25 %	25 %	25 %	56417022
17062	NC_004842	AGC	2	6	855849	855854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417022
17063	NC_004842	G	7	7	855946	855952	0 %	0 %	100 %	0 %	56417022
17064	NC_004842	GTA	2	6	855965	855970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417022
17065	NC_004842	CGC	2	6	856060	856065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417022
17066	NC_004842	ACC	2	6	856174	856179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417022
17067	NC_004842	CAGG	2	8	856225	856232	25 %	0 %	50 %	25 %	56417022
17068	NC_004842	CTG	2	6	856301	856306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417022
17069	NC_004842	AGG	2	6	856455	856460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417022
17070	NC_004842	GAAAT	2	10	856511	856520	60 %	20 %	20 %	0 %	56417022
17071	NC_004842	GCG	2	6	856652	856657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417022
17072	NC_004842	T	6	6	856695	856700	0 %	100 %	0 %	0 %	56417022
17073	NC_004842	ACC	2	6	856703	856708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417022
17074	NC_004842	CAC	2	6	856744	856749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417022
17075	NC_004842	GAAG	2	8	856769	856776	50 %	0 %	50 %	0 %	56417022
17076	NC_004842	AAC	2	6	856799	856804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417022
17077	NC_004842	GGC	2	6	856964	856969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417022
17078	NC_004842	CAGTG	2	10	857031	857040	20 %	20 %	40 %	20 %	56417022
17079	NC_004842	TCG	2	6	857092	857097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17080	NC_004842	TGA	2	6	857127	857132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_004842	GGC	2	6	857148	857153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17082	NC_004842	CAGT	2	8	857279	857286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17083	NC_004842	CTT	2	6	857289	857294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17084	NC_004842	AAGG	2	8	857304	857311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17085	NC_004842	AAG	2	6	857337	857342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17086	NC_004842	GCTA	2	8	857363	857370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17087	NC_004842	CA	3	6	857373	857378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17088	NC_004842	ACG	2	6	857380	857385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17089	NC_004842	CCG	2	6	857445	857450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17090	NC_004842	GGGAT	2	10	857524	857533	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_004842	CCG	2	6	857555	857560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17092	NC_004842	CAGT	2	8	857604	857611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17093	NC_004842	CCA	2	6	857676	857681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17094	NC_004842	GAT	2	6	857769	857774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_004842	AGCA	2	8	857918	857925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17096	NC_004842	CACC	2	8	857935	857942	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17097	NC_004842	AC	3	6	858009	858014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17098	NC_004842	CCG	2	6	858031	858036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17099	NC_004842	CCA	2	6	858107	858112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17100	NC_004842	C	6	6	858139	858144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17101	NC_004842	CAG	3	9	858147	858155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17102	NC_004842	GGCT	2	8	858170	858177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17103	NC_004842	CGA	2	6	858192	858197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17104	NC_004842	CAA	2	6	858226	858231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17105	NC_004842	CACC	2	8	858294	858301	25 %	0 %	0 %	75 %	56417023
17106	NC_004842	CAG	2	6	858304	858309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417023
17107	NC_004842	AGA	2	6	858314	858319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417023
17108	NC_004842	GCA	2	6	858360	858365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417023
17109	NC_004842	CT	3	6	858399	858404	0 %	50 %	0 %	50 %	56417023
17110	NC_004842	CTT	2	6	858419	858424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417023
17111	NC_004842	AAT	2	6	858425	858430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417023
17112	NC_004842	TCT	2	6	858448	858453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417023
17113	NC_004842	CAG	2	6	858514	858519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417023
17114	NC_004842	CCT	2	6	858625	858630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417023
17115	NC_004842	TAA	2	6	858652	858657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417023
17116	NC_004842	CAGC	2	8	858762	858769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17117	NC_004842	GC	3	6	858768	858773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17118	NC_004842	GCCA	2	8	858807	858814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17119	NC_004842	CAC	2	6	858824	858829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17120	NC_004842	TCAG	2	8	858850	858857	25 %	25 %	25 %	25 %	56417024
17121	NC_004842	GA	3	6	858858	858863	50 %	0 %	50 %	0 %	56417024
17122	NC_004842	CTA	2	6	858906	858911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417024
17123	NC_004842	GCG	2	6	858977	858982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417024
17124	NC_004842	GA	3	6	859024	859029	50 %	0 %	50 %	0 %	56417024
17125	NC_004842	TCG	2	6	859086	859091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417024
17126	NC_004842	CAA	2	6	859114	859119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417024
17127	NC_004842	C	6	6	859189	859194	0 %	0 %	0 %	100 %	56417024
17128	NC_004842	GC	3	6	859227	859232	0 %	0 %	50 %	50 %	56417024
17129	NC_004842	GAC	2	6	859286	859291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417024
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17133	NC_004842	CAT	2	6	859425	859430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417024
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17238	NC_004842	GCGT	2	8	865085	865092	0 %	25 %	50 %	25 %	56417029
17239	NC_004842	CA	4	8	865107	865114	50 %	0 %	0 %	50 %	56417029
17240	NC_004842	CT	3	6	865151	865156	0 %	50 %	0 %	50 %	56417029
17241	NC_004842	GAGCA	2	10	865250	865259	40 %	0 %	40 %	20 %	56417029
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17245	NC_004842	TA	3	6	865540	865545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17246	NC_004842	A	6	6	865578	865583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17247	NC_004842	GGA	2	6	865589	865594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17248	NC_004842	GGA	2	6	865654	865659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161544983
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17250	NC_004842	AG	3	6	865854	865859	50 %	0 %	50 %	0 %	161544983
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17252	NC_004842	GGTTT	2	10	865896	865905	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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17373	NC_004842	GCG	2	6	872195	872200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417034
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17500	NC_004842	CTG	2	6	879192	879197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417040

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