MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_004842	CGC	2	6	729377	729382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416912
14502	NC_004842	CTG	2	6	729416	729421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14503	NC_004842	TA	3	6	729446	729451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_004842	GGC	2	6	729478	729483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14505	NC_004842	TAC	2	6	729556	729561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14506	NC_004842	AT	3	6	729596	729601	50 %	50 %	0 %	0 %	161544986
14507	NC_004842	ATG	2	6	729609	729614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161544986
14508	NC_004842	GTGCTG	2	12	729617	729628	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	161544986
14509	NC_004842	AGGTG	2	10	729682	729691	20 %	20 %	60 %	0 %	161544986
14510	NC_004842	T	6	6	729762	729767	0 %	100 %	0 %	0 %	161544986
14511	NC_004842	TGGA	2	8	729899	729906	25 %	25 %	50 %	0 %	161544986
14512	NC_004842	GAC	2	6	730004	730009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161544986
14513	NC_004842	TCA	2	6	730099	730104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161544986
14514	NC_004842	AAT	2	6	730159	730164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161544986
14515	NC_004842	GCA	2	6	730330	730335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161544986
14516	NC_004842	ACT	2	6	730372	730377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161544986
14517	NC_004842	AT	3	6	730539	730544	50 %	50 %	0 %	0 %	161544986
14518	NC_004842	CG	3	6	730787	730792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14519	NC_004842	ACA	2	6	730882	730887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416914
14520	NC_004842	TGC	2	6	730923	730928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416914
14521	NC_004842	GGC	2	6	730940	730945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416914
14522	NC_004842	TCG	2	6	730951	730956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416914
14523	NC_004842	CG	3	6	730998	731003	0 %	0 %	50 %	50 %	56416914
14524	NC_004842	CAG	2	6	731213	731218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416914
14525	NC_004842	AGG	2	6	731223	731228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416914
14526	NC_004842	GCA	2	6	731367	731372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416914
14527	NC_004842	TGG	2	6	731610	731615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416914
14528	NC_004842	TGT	2	6	731617	731622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416914
14529	NC_004842	GCA	2	6	731634	731639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416914
14530	NC_004842	AGG	2	6	731799	731804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416914
14531	NC_004842	GCAG	2	8	731939	731946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14532	NC_004842	CCCA	2	8	731979	731986	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14533	NC_004842	CTG	2	6	732035	732040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_004842	ATT	2	6	732048	732053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_004842	TGG	2	6	732213	732218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416915
14536	NC_004842	TGC	2	6	732310	732315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416915
14537	NC_004842	TG	3	6	732329	732334	0 %	50 %	50 %	0 %	56416915
14538	NC_004842	G	6	6	732369	732374	0 %	0 %	100 %	0 %	56416915
14539	NC_004842	GTG	2	6	732383	732388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416915
14540	NC_004842	G	7	7	732517	732523	0 %	0 %	100 %	0 %	56416915
14541	NC_004842	GCAC	2	8	732546	732553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14542	NC_004842	GAC	2	6	732627	732632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416916
14543	NC_004842	CGAA	2	8	732650	732657	50 %	0 %	25 %	25 %	56416916
14544	NC_004842	TGA	2	6	732686	732691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416916
14545	NC_004842	TAC	2	6	732798	732803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416916
14546	NC_004842	GCTACC	2	12	732855	732866	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	56416916
14547	NC_004842	ATAG	2	8	732952	732959	50 %	25 %	25 %	0 %	56416916
14548	NC_004842	CAT	2	6	732977	732982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416916
14549	NC_004842	CAG	2	6	732984	732989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416916
14550	NC_004842	CCCT	2	8	733031	733038	0 %	25 %	0 %	75 %	56416916
14551	NC_004842	TTC	2	6	733053	733058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416916
14552	NC_004842	C	6	6	733064	733069	0 %	0 %	0 %	100 %	56416916
14553	NC_004842	GATC	2	8	733082	733089	25 %	25 %	25 %	25 %	56416916
14554	NC_004842	CAG	2	6	733106	733111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416916
14555	NC_004842	CTC	2	6	733170	733175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416916
14556	NC_004842	CAGCA	2	10	733326	733335	40 %	0 %	20 %	40 %	56416916
14557	NC_004842	GCG	2	6	733375	733380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416916
14558	NC_004842	A	6	6	733401	733406	100 %	0 %	0 %	0 %	56416916
14559	NC_004842	CAA	2	6	733511	733516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416916
14560	NC_004842	ATT	2	6	733566	733571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416916
14561	NC_004842	GTG	2	6	733636	733641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416916
14562	NC_004842	GC	3	6	733678	733683	0 %	0 %	50 %	50 %	56416916
14563	NC_004842	CAA	2	6	733862	733867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416916
14564	NC_004842	AT	3	6	733868	733873	50 %	50 %	0 %	0 %	56416916
14565	NC_004842	CAC	2	6	733975	733980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416916
14566	NC_004842	ACG	2	6	734027	734032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14567	NC_004842	GGC	2	6	734065	734070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14568	NC_004842	GC	3	6	734117	734122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14569	NC_004842	GCA	2	6	734147	734152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14570	NC_004842	CGC	2	6	734171	734176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14571	NC_004842	AAC	2	6	734223	734228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416917
14572	NC_004842	GGA	2	6	734268	734273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416917
14573	NC_004842	AGC	2	6	734317	734322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416917
14574	NC_004842	ACA	2	6	734368	734373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416917
14575	NC_004842	CAGTG	2	10	734388	734397	20 %	20 %	40 %	20 %	56416917
14576	NC_004842	CA	3	6	734419	734424	50 %	0 %	0 %	50 %	56416917
14577	NC_004842	GTC	2	6	734661	734666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416917
14578	NC_004842	CCA	2	6	734679	734684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416917
14579	NC_004842	ACCC	2	8	734848	734855	25 %	0 %	0 %	75 %	56416918
14580	NC_004842	CCT	2	6	734984	734989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416918
14581	NC_004842	CTC	2	6	734993	734998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416918
14582	NC_004842	CTG	3	9	734999	735007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416918
14583	NC_004842	CCA	2	6	735021	735026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416918
14584	NC_004842	CCA	2	6	735072	735077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416918
14585	NC_004842	CAT	2	6	735172	735177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14586	NC_004842	CTT	2	6	735250	735255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416918
14587	NC_004842	GCT	2	6	735259	735264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416918
14588	NC_004842	TTG	2	6	735274	735279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416918
14589	NC_004842	ATC	2	6	735284	735289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14590	NC_004842	CAT	2	6	735355	735360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14591	NC_004842	GGC	2	6	735383	735388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416918
14592	NC_004842	CTT	2	6	735400	735405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416918
14593	NC_004842	CTGC	2	8	735442	735449	0 %	25 %	25 %	50 %	56416918
14594	NC_004842	ATC	2	6	735458	735463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14595	NC_004842	CTT	2	6	735538	735543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416918
14596	NC_004842	CCG	2	6	735588	735593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416918
14597	NC_004842	TTC	2	6	735605	735610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416918
14598	NC_004842	CGT	2	6	735616	735621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416918
14599	NC_004842	CTT	2	6	735641	735646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416918
14600	NC_004842	T	6	6	735701	735706	0 %	100 %	0 %	0 %	56416918
14601	NC_004842	TCA	2	6	735726	735731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14602	NC_004842	TCA	2	6	735783	735788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14603	NC_004842	AAC	2	6	735806	735811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416918
14604	NC_004842	CCT	2	6	735937	735942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416918
14605	NC_004842	AGT	2	6	735968	735973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416918
14606	NC_004842	GCT	2	6	736038	736043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416918
14607	NC_004842	TCA	2	6	736086	736091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14608	NC_004842	GTC	2	6	736218	736223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416918
14609	NC_004842	C	8	8	736252	736259	0 %	0 %	0 %	100 %	56416918
14610	NC_004842	CTC	2	6	736337	736342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416918
14611	NC_004842	TGG	2	6	736346	736351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416918
14612	NC_004842	GCT	2	6	736390	736395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416918
14613	NC_004842	TCC	2	6	736443	736448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416918
14614	NC_004842	CAT	2	6	736495	736500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14615	NC_004842	TCA	2	6	736533	736538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14616	NC_004842	TCC	2	6	736553	736558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416918
14617	NC_004842	CAT	2	6	736612	736617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14618	NC_004842	CAA	2	6	736672	736677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416918
14619	NC_004842	TCTAT	2	10	736758	736767	20 %	60 %	0 %	20 %	56416918
14620	NC_004842	TCC	2	6	736782	736787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416918
14621	NC_004842	CTG	3	9	736884	736892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416918
14622	NC_004842	CAT	2	6	736948	736953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416918
14623	NC_004842	TGC	2	6	737033	737038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416918
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14653	NC_004842	GAGC	2	8	738308	738315	25 %	0 %	50 %	25 %	56416918
14654	NC_004842	CCAT	2	8	738380	738387	25 %	25 %	0 %	50 %	56416918
14655	NC_004842	GGTAA	2	10	738473	738482	40 %	20 %	40 %	0 %	56416918
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14741	NC_004842	TAC	2	6	742415	742420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416919
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14854	NC_004842	TTCT	2	8	746684	746691	0 %	75 %	0 %	25 %	56416920
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14857	NC_004842	CTT	2	6	746883	746888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416920
14858	NC_004842	TCAT	2	8	746895	746902	25 %	50 %	0 %	25 %	56416920
14859	NC_004842	TAC	2	6	746960	746965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416920
14860	NC_004842	ACG	2	6	746982	746987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416920
14861	NC_004842	AAT	2	6	747059	747064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14862	NC_004842	GAC	2	6	747112	747117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416921
14863	NC_004842	TAC	2	6	747152	747157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416921
14864	NC_004842	CCA	2	6	747193	747198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416921
14865	NC_004842	CCT	2	6	747211	747216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416921
14866	NC_004842	CAT	2	6	747231	747236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416921
14867	NC_004842	AAG	2	6	747400	747405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416921
14868	NC_004842	GCA	2	6	747457	747462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416921
14869	NC_004842	CATG	2	8	747540	747547	25 %	25 %	25 %	25 %	56416921
14870	NC_004842	CTG	2	6	747616	747621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416921
14871	NC_004842	GTC	2	6	747633	747638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416921
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14873	NC_004842	G	6	6	747803	747808	0 %	0 %	100 %	0 %	56416921
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14875	NC_004842	CAT	2	6	747885	747890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416921
14876	NC_004842	ACA	2	6	747907	747912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416921
14877	NC_004842	CAGT	2	8	747974	747981	25 %	25 %	25 %	25 %	56416921
14878	NC_004842	C	6	6	747999	748004	0 %	0 %	0 %	100 %	56416921
14879	NC_004842	CAT	2	6	748029	748034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416921
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14881	NC_004842	GGC	2	6	748125	748130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416921
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14885	NC_004842	AGT	2	6	748386	748391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416921
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14890	NC_004842	CAT	2	6	748760	748765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416921
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14893	NC_004842	T	6	6	748906	748911	0 %	100 %	0 %	0 %	56416921
14894	NC_004842	CTTG	2	8	749057	749064	0 %	50 %	25 %	25 %	56416921
14895	NC_004842	AC	3	6	749079	749084	50 %	0 %	0 %	50 %	56416921
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14910	NC_004842	CT	4	8	749956	749963	0 %	50 %	0 %	50 %	56416922
14911	NC_004842	TGTT	2	8	750031	750038	0 %	75 %	25 %	0 %	56416922
14912	NC_004842	ATCA	2	8	750166	750173	50 %	25 %	0 %	25 %	56416922
14913	NC_004842	ATT	2	6	750194	750199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416922
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14915	NC_004842	CAA	2	6	750247	750252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416922
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14920	NC_004842	CTTC	2	8	750456	750463	0 %	50 %	0 %	50 %	56416922
14921	NC_004842	CAT	2	6	750489	750494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416922
14922	NC_004842	TCCAT	2	10	750555	750564	20 %	40 %	0 %	40 %	56416922
14923	NC_004842	GTTCT	2	10	750572	750581	0 %	60 %	20 %	20 %	56416922
14924	NC_004842	TGA	2	6	750663	750668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416922
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14927	NC_004842	TCA	2	6	750744	750749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416922
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14929	NC_004842	TAT	2	6	750778	750783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416922
14930	NC_004842	GAA	3	9	750817	750825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416922
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14932	NC_004842	TC	3	6	751014	751019	0 %	50 %	0 %	50 %	56416922
14933	NC_004842	AG	3	6	751042	751047	50 %	0 %	50 %	0 %	56416922
14934	NC_004842	T	7	7	751091	751097	0 %	100 %	0 %	0 %	56416922
14935	NC_004842	CAT	2	6	751152	751157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416922
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14938	NC_004842	CAA	2	6	751392	751397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416922
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14940	NC_004842	CAC	2	6	751591	751596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416922
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14942	NC_004842	CTT	2	6	751666	751671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416922
14943	NC_004842	GAC	2	6	751729	751734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416922
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14946	NC_004842	TCA	2	6	751955	751960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416922
14947	NC_004842	CAA	2	6	752088	752093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416922
14948	NC_004842	C	6	6	752094	752099	0 %	0 %	0 %	100 %	56416922
14949	NC_004842	TCT	2	6	752100	752105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416922
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14951	NC_004842	TGC	2	6	752113	752118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416922
14952	NC_004842	ACATC	2	10	752145	752154	40 %	20 %	0 %	40 %	56416923
14953	NC_004842	TGC	2	6	752193	752198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416923
14954	NC_004842	TGA	2	6	752211	752216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416923
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14957	NC_004842	CAA	2	6	752484	752489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14958	NC_004842	A	6	6	752488	752493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14966	NC_004842	TCTT	2	8	752882	752889	0 %	75 %	0 %	25 %	56416924
14967	NC_004842	TAG	2	6	752949	752954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416924
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14970	NC_004842	AAAC	2	8	753161	753168	75 %	0 %	0 %	25 %	56416924
14971	NC_004842	A	6	6	753213	753218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14972	NC_004842	AAT	2	6	753223	753228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14973	NC_004842	GC	3	6	753274	753279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14974	NC_004842	ATGC	2	8	753290	753297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14975	NC_004842	GCG	2	6	753307	753312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14976	NC_004842	GGT	2	6	753364	753369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416925
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14979	NC_004842	GTTGG	2	10	753448	753457	0 %	40 %	60 %	0 %	56416925
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14982	NC_004842	TCA	2	6	753561	753566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416925
14983	NC_004842	A	6	6	753572	753577	100 %	0 %	0 %	0 %	56416925
14984	NC_004842	GCT	2	6	753583	753588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416925
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