MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_004842	CAG	2	6	680670	680675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416871
13502	NC_004842	TTC	2	6	680737	680742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416871
13503	NC_004842	TCT	2	6	680748	680753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416871
13504	NC_004842	TTA	2	6	680801	680806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416871
13505	NC_004842	TCT	2	6	680826	680831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416871
13506	NC_004842	GCA	2	6	680876	680881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416871
13507	NC_004842	T	6	6	680914	680919	0 %	100 %	0 %	0 %	56416871
13508	NC_004842	CCA	2	6	680937	680942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416871
13509	NC_004842	GCG	2	6	680943	680948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416871
13510	NC_004842	CTC	2	6	680959	680964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416871
13511	NC_004842	TTG	2	6	680966	680971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416871
13512	NC_004842	CCA	2	6	681035	681040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416871
13513	NC_004842	CCCT	2	8	681054	681061	0 %	25 %	0 %	75 %	56416871
13514	NC_004842	CCA	2	6	681080	681085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416871
13515	NC_004842	CGG	2	6	681147	681152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416871
13516	NC_004842	T	6	6	681154	681159	0 %	100 %	0 %	0 %	56416871
13517	NC_004842	GAA	3	9	681182	681190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416871
13518	NC_004842	TCC	2	6	681200	681205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416871
13519	NC_004842	GCA	2	6	681311	681316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416871
13520	NC_004842	AAG	2	6	681361	681366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416871
13521	NC_004842	CTCC	2	8	681507	681514	0 %	25 %	0 %	75 %	56416871
13522	NC_004842	ACC	2	6	681526	681531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416871
13523	NC_004842	CAA	2	6	681585	681590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416871
13524	NC_004842	GCT	2	6	681705	681710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416871
13525	NC_004842	TCCTCA	2	12	681737	681748	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	56416871
13526	NC_004842	GGA	2	6	681776	681781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416871
13527	NC_004842	AAC	2	6	681833	681838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416871
13528	NC_004842	CAA	2	6	681847	681852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416871
13529	NC_004842	AACC	2	8	681876	681883	50 %	0 %	0 %	50 %	56416871
13530	NC_004842	ACA	2	6	681896	681901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416871
13531	NC_004842	AC	3	6	681915	681920	50 %	0 %	0 %	50 %	56416871
13532	NC_004842	CAC	2	6	681922	681927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416871
13533	NC_004842	CG	3	6	681934	681939	0 %	0 %	50 %	50 %	56416871
13534	NC_004842	AC	3	6	681951	681956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13535	NC_004842	TACA	2	8	681979	681986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13536	NC_004842	TTA	2	6	681987	681992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_004842	GCA	3	9	681996	682004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_004842	ATA	2	6	682173	682178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416872
13539	NC_004842	GCA	2	6	682242	682247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416872
13540	NC_004842	CAC	2	6	682493	682498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416872
13541	NC_004842	A	6	6	682543	682548	100 %	0 %	0 %	0 %	56416872
13542	NC_004842	TAG	2	6	682588	682593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416872
13543	NC_004842	CT	3	6	682673	682678	0 %	50 %	0 %	50 %	56416872
13544	NC_004842	TGA	2	6	682816	682821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416872
13545	NC_004842	CT	3	6	682845	682850	0 %	50 %	0 %	50 %	56416872
13546	NC_004842	TTA	2	6	682885	682890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416872
13547	NC_004842	GCA	2	6	682959	682964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416872
13548	NC_004842	GCA	2	6	683037	683042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416872
13549	NC_004842	ACA	2	6	683052	683057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416872
13550	NC_004842	TCA	2	6	683139	683144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416872
13551	NC_004842	CT	3	6	683209	683214	0 %	50 %	0 %	50 %	56416872
13552	NC_004842	CAA	2	6	683328	683333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416873
13553	NC_004842	ACAA	2	8	683337	683344	75 %	0 %	0 %	25 %	56416873
13554	NC_004842	GTG	2	6	683367	683372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416873
13555	NC_004842	ACC	2	6	683419	683424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416873
13556	NC_004842	CA	4	8	683468	683475	50 %	0 %	0 %	50 %	56416873
13557	NC_004842	A	6	6	683535	683540	100 %	0 %	0 %	0 %	56416873
13558	NC_004842	CGG	2	6	683565	683570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416873
13559	NC_004842	GAC	2	6	683595	683600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416873
13560	NC_004842	TCA	2	6	683665	683670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416873
13561	NC_004842	GAG	2	6	683679	683684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416873
13562	NC_004842	A	6	6	683690	683695	100 %	0 %	0 %	0 %	56416873
13563	NC_004842	CGTGC	2	10	683751	683760	0 %	20 %	40 %	40 %	56416873
13564	NC_004842	ACC	2	6	683767	683772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416873
13565	NC_004842	GTAC	2	8	683777	683784	25 %	25 %	25 %	25 %	56416873
13566	NC_004842	CAA	2	6	683855	683860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416873
13567	NC_004842	CGGAAA	2	12	683873	683884	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56416873
13568	NC_004842	CAA	2	6	683927	683932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416873
13569	NC_004842	AGC	2	6	683941	683946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416873
13570	NC_004842	CGC	2	6	683952	683957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416873
13571	NC_004842	AAGA	2	8	683973	683980	75 %	0 %	25 %	0 %	56416873
13572	NC_004842	GCC	2	6	683989	683994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416873
13573	NC_004842	ATG	2	6	684187	684192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416873
13574	NC_004842	GAA	2	6	684216	684221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416873
13575	NC_004842	CG	3	6	684240	684245	0 %	0 %	50 %	50 %	56416873
13576	NC_004842	CA	3	6	684265	684270	50 %	0 %	0 %	50 %	56416873
13577	NC_004842	AAAG	3	12	684313	684324	75 %	0 %	25 %	0 %	56416873
13578	NC_004842	GCCT	2	8	684327	684334	0 %	25 %	25 %	50 %	56416873
13579	NC_004842	AGG	2	6	684418	684423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416873
13580	NC_004842	CTA	2	6	684446	684451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416873
13581	NC_004842	ACC	2	6	684539	684544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416873
13582	NC_004842	AG	3	6	684546	684551	50 %	0 %	50 %	0 %	56416873
13583	NC_004842	AAC	2	6	684552	684557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416873
13584	NC_004842	CAC	2	6	684558	684563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416873
13585	NC_004842	GC	3	6	684597	684602	0 %	0 %	50 %	50 %	56416873
13586	NC_004842	ATC	2	6	684631	684636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416873
13587	NC_004842	AGA	2	6	684646	684651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416873
13588	NC_004842	GCA	2	6	684662	684667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416873
13589	NC_004842	TC	3	6	684679	684684	0 %	50 %	0 %	50 %	56416873
13590	NC_004842	AAC	2	6	684884	684889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416874
13591	NC_004842	GCA	2	6	684915	684920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416874
13592	NC_004842	ACAA	2	8	684944	684951	75 %	0 %	0 %	25 %	56416874
13593	NC_004842	GAA	2	6	685043	685048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416874
13594	NC_004842	ATC	2	6	685053	685058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416874
13595	NC_004842	TA	3	6	685126	685131	50 %	50 %	0 %	0 %	56416874
13596	NC_004842	AC	3	6	685140	685145	50 %	0 %	0 %	50 %	56416874
13597	NC_004842	GCG	2	6	685155	685160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416874
13598	NC_004842	TTCA	2	8	685211	685218	25 %	50 %	0 %	25 %	56416874
13599	NC_004842	CAA	2	6	685237	685242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416874
13600	NC_004842	GGA	2	6	685259	685264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416874
13601	NC_004842	TTGCG	2	10	685287	685296	0 %	40 %	40 %	20 %	56416874
13602	NC_004842	ACTA	2	8	685367	685374	50 %	25 %	0 %	25 %	56416874
13603	NC_004842	CCA	2	6	685413	685418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416874
13604	NC_004842	AGC	2	6	685440	685445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416874
13605	NC_004842	GC	3	6	685474	685479	0 %	0 %	50 %	50 %	56416874
13606	NC_004842	ACC	2	6	685503	685508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416874
13607	NC_004842	CAA	2	6	685528	685533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416874
13608	NC_004842	CAT	2	6	685597	685602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416874
13609	NC_004842	GCC	2	6	685650	685655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416874
13610	NC_004842	GCTGTG	2	12	685671	685682	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56416874
13611	NC_004842	TA	3	6	685683	685688	50 %	50 %	0 %	0 %	56416874
13612	NC_004842	GCA	2	6	685701	685706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416874
13613	NC_004842	AAAAT	2	10	685773	685782	80 %	20 %	0 %	0 %	56416874
13614	NC_004842	TG	3	6	685797	685802	0 %	50 %	50 %	0 %	56416874
13615	NC_004842	ACA	2	6	685809	685814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416874
13616	NC_004842	CT	3	6	685824	685829	0 %	50 %	0 %	50 %	56416874
13617	NC_004842	AGC	2	6	685836	685841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416874
13618	NC_004842	A	6	6	685847	685852	100 %	0 %	0 %	0 %	56416874
13619	NC_004842	GGAA	2	8	685853	685860	50 %	0 %	50 %	0 %	56416874
13620	NC_004842	A	6	6	685891	685896	100 %	0 %	0 %	0 %	56416874
13621	NC_004842	A	6	6	685960	685965	100 %	0 %	0 %	0 %	56416874
13622	NC_004842	CCCA	2	8	685971	685978	25 %	0 %	0 %	75 %	56416874
13623	NC_004842	TCC	2	6	685994	685999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416874
13624	NC_004842	ACC	2	6	686046	686051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416874
13625	NC_004842	CGG	2	6	686065	686070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416874
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13723	NC_004842	AACC	2	8	690647	690654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13745	NC_004842	TGCT	2	8	692078	692085	0 %	50 %	25 %	25 %	56416880
13746	NC_004842	CT	3	6	692189	692194	0 %	50 %	0 %	50 %	56416880
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13991	NC_004842	T	6	6	704975	704980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13992	NC_004842	T	6	6	704999	705004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13996	NC_004842	GTA	2	6	705168	705173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416892
13997	NC_004842	ACC	2	6	705184	705189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416892
13998	NC_004842	CTG	2	6	705261	705266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416892
13999	NC_004842	GTT	2	6	705317	705322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416892
14000	NC_004842	TA	3	6	705401	705406	50 %	50 %	0 %	0 %	56416892

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