MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_004842	GCA	2	6	658294	658299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_004842	TGA	2	6	658318	658323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_004842	AGC	2	6	658331	658336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_004842	CAC	2	6	658346	658351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13005	NC_004842	TTA	2	6	658364	658369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_004842	ATG	2	6	658480	658485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_004842	GCAA	2	8	658543	658550	50 %	0 %	25 %	25 %	56416858
13008	NC_004842	A	6	6	658586	658591	100 %	0 %	0 %	0 %	56416858
13009	NC_004842	TAT	2	6	658643	658648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416858
13010	NC_004842	CGCAGG	2	12	658732	658743	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56416858
13011	NC_004842	GCT	2	6	658808	658813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416858
13012	NC_004842	TTGATG	2	12	658836	658847	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_004842	ACCTTA	2	12	658864	658875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_004842	GGC	2	6	658925	658930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_004842	CA	3	6	658970	658975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_004842	CT	3	6	659080	659085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13017	NC_004842	CAC	3	9	659088	659096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13018	NC_004842	ACG	2	6	659132	659137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_004842	CA	3	6	659186	659191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13020	NC_004842	AC	4	8	659216	659223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13021	NC_004842	ACC	2	6	659241	659246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13022	NC_004842	TGT	2	6	659280	659285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_004842	CA	3	6	659295	659300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13024	NC_004842	CAAC	2	8	659346	659353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13025	NC_004842	CT	3	6	659358	659363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13026	NC_004842	CAC	3	9	659365	659373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_004842	CAG	2	6	659377	659382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_004842	TGGC	2	8	659407	659414	0 %	25 %	50 %	25 %	56416859
13029	NC_004842	GCT	2	6	659420	659425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416859
13030	NC_004842	CTG	2	6	659431	659436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416859
13031	NC_004842	CAAC	2	8	659533	659540	50 %	0 %	0 %	50 %	56416859
13032	NC_004842	ATG	2	6	659610	659615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416859
13033	NC_004842	AAC	2	6	659657	659662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416859
13034	NC_004842	ATC	3	9	659672	659680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416859
13035	NC_004842	AGC	2	6	659684	659689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416859
13036	NC_004842	CAG	2	6	659698	659703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416859
13037	NC_004842	CAC	2	6	659771	659776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13038	NC_004842	ACC	2	6	659949	659954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13039	NC_004842	TGT	2	6	659958	659963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_004842	TCC	2	6	659986	659991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_004842	TAC	2	6	660047	660052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_004842	GAAG	2	8	660089	660096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_004842	TAG	2	6	660097	660102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_004842	GTA	2	6	660103	660108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_004842	TAG	2	6	660146	660151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_004842	AG	3	6	660150	660155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_004842	TGA	2	6	660200	660205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_004842	AGA	2	6	660236	660241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_004842	ACA	2	6	660254	660259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_004842	AGCAA	2	10	660266	660275	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13051	NC_004842	GTAA	2	8	660276	660283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_004842	GAG	2	6	660339	660344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_004842	CA	3	6	660368	660373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13054	NC_004842	GGA	2	6	660389	660394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_004842	GAA	2	6	660428	660433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_004842	GGA	2	6	660524	660529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_004842	GAA	3	9	660533	660541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_004842	AGC	2	6	660620	660625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_004842	AGG	2	6	660736	660741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_004842	CTGA	2	8	660750	660757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13061	NC_004842	CTG	2	6	660789	660794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_004842	ATT	2	6	660806	660811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_004842	AGG	2	6	660835	660840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_004842	AGG	2	6	660853	660858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_004842	CAA	2	6	660887	660892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_004842	AAG	2	6	660906	660911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_004842	AGG	2	6	660916	660921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_004842	GGGT	2	8	660940	660947	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_004842	AAG	2	6	660978	660983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_004842	AAG	2	6	660999	661004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_004842	GGTG	2	8	661016	661023	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_004842	AGA	2	6	661079	661084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_004842	AGC	2	6	661088	661093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_004842	GCT	2	6	661133	661138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_004842	CAG	2	6	661167	661172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_004842	AAT	2	6	661197	661202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_004842	AGA	2	6	661229	661234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_004842	AGA	2	6	661280	661285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_004842	GA	3	6	661284	661289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_004842	GA	3	6	661292	661297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_004842	TAG	2	6	661345	661350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_004842	AG	3	6	661355	661360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_004842	AGC	2	6	661426	661431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_004842	GGA	2	6	661448	661453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_004842	GAA	2	6	661457	661462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_004842	GGA	2	6	661523	661528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_004842	AAG	2	6	661548	661553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_004842	AAG	2	6	661560	661565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_004842	AGA	2	6	661582	661587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_004842	GAA	2	6	661679	661684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_004842	AGC	2	6	661744	661749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_004842	TGA	2	6	661765	661770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_004842	GCA	2	6	661773	661778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_004842	ATT	2	6	661822	661827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_004842	GA	3	6	661848	661853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_004842	TGC	2	6	661859	661864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_004842	AATT	2	8	661870	661877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_004842	GCT	2	6	661878	661883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_004842	TAA	2	6	661913	661918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_004842	TGA	2	6	661928	661933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_004842	ACA	2	6	661968	661973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_004842	CAC	2	6	661982	661987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_004842	TCAC	2	8	662002	662009	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13104	NC_004842	CAC	2	6	662028	662033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_004842	CAGC	2	8	662040	662047	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13106	NC_004842	CT	3	6	662048	662053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13107	NC_004842	CCA	2	6	662100	662105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13108	NC_004842	CATCT	2	10	662169	662178	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13109	NC_004842	CT	3	6	662213	662218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13110	NC_004842	CTT	2	6	662231	662236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_004842	CAC	2	6	662242	662247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_004842	CAC	2	6	662311	662316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_004842	CT	3	6	662319	662324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13114	NC_004842	CAA	2	6	662356	662361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_004842	TCC	2	6	662370	662375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13116	NC_004842	TTA	2	6	662385	662390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_004842	GT	3	6	662449	662454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_004842	TGG	3	9	662485	662493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_004842	GGT	2	6	662504	662509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_004842	CTT	2	6	662516	662521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_004842	CA	3	6	662548	662553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13122	NC_004842	CTT	2	6	662555	662560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_004842	TCA	2	6	662568	662573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_004842	TAG	2	6	662578	662583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_004842	CT	3	6	662595	662600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13126	NC_004842	CTT	2	6	662615	662620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_004842	TAA	2	6	662705	662710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_004842	CTT	2	6	662738	662743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_004842	TAA	2	6	662752	662757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_004842	CTACTT	2	12	662773	662784	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_004842	CTC	2	6	662794	662799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13132	NC_004842	TCA	2	6	662865	662870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416860
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13240	NC_004842	GCA	2	6	667882	667887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416863
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13249	NC_004842	AG	3	6	668269	668274	50 %	0 %	50 %	0 %	56416863
13250	NC_004842	GA	3	6	668283	668288	50 %	0 %	50 %	0 %	56416863
13251	NC_004842	TTGAG	2	10	668305	668314	20 %	40 %	40 %	0 %	56416863
13252	NC_004842	CGA	2	6	668330	668335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416863
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13258	NC_004842	A	6	6	668695	668700	100 %	0 %	0 %	0 %	56416863
13259	NC_004842	A	7	7	668725	668731	100 %	0 %	0 %	0 %	56416863
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13381	NC_004842	GCC	2	6	674789	674794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13472	NC_004842	GTT	2	6	679601	679606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416870
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13492	NC_004842	ACT	2	6	680411	680416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416870
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13498	NC_004842	TCG	4	12	680606	680617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416871
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