MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_004842	GCG	2	6	609610	609615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416832
12002	NC_004842	CGT	2	6	609620	609625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416832
12003	NC_004842	GAC	2	6	609648	609653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416832
12004	NC_004842	GAA	2	6	609668	609673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416832
12005	NC_004842	CA	3	6	609710	609715	50 %	0 %	0 %	50 %	56416832
12006	NC_004842	G	13	13	609750	609762	0 %	0 %	100 %	0 %	56416832
12007	NC_004842	TAA	2	6	609865	609870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416833
12008	NC_004842	CTG	2	6	609889	609894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416833
12009	NC_004842	GCA	2	6	609905	609910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416833
12010	NC_004842	TGC	2	6	610067	610072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416833
12011	NC_004842	CAG	2	6	610131	610136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416833
12012	NC_004842	GAG	2	6	610167	610172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416833
12013	NC_004842	TAG	2	6	610325	610330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416833
12014	NC_004842	TTA	2	6	610342	610347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416833
12015	NC_004842	AGC	2	6	610387	610392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416833
12016	NC_004842	ACT	2	6	610395	610400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416833
12017	NC_004842	GCT	2	6	610413	610418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416833
12018	NC_004842	GCA	2	6	610449	610454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416833
12019	NC_004842	GTAT	2	8	610473	610480	25 %	50 %	25 %	0 %	56416833
12020	NC_004842	TGA	2	6	610483	610488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416833
12021	NC_004842	ATA	2	6	610500	610505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416833
12022	NC_004842	AGC	2	6	610571	610576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416833
12023	NC_004842	GCAA	2	8	610634	610641	50 %	0 %	25 %	25 %	56416833
12024	NC_004842	GC	3	6	610651	610656	0 %	0 %	50 %	50 %	56416833
12025	NC_004842	C	6	6	610659	610664	0 %	0 %	0 %	100 %	56416833
12026	NC_004842	GATCC	2	10	610677	610686	20 %	20 %	20 %	40 %	56416833
12027	NC_004842	AAGG	2	8	610689	610696	50 %	0 %	50 %	0 %	56416833
12028	NC_004842	GCC	3	9	610701	610709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416833
12029	NC_004842	AG	3	6	610909	610914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_004842	CCT	2	6	610942	610947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12031	NC_004842	TGC	2	6	610965	610970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12032	NC_004842	TAA	2	6	611082	611087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_004842	GTT	2	6	611088	611093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_004842	TAC	2	6	611177	611182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12035	NC_004842	TAA	2	6	611270	611275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_004842	CAGG	2	8	611302	611309	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12037	NC_004842	G	12	12	611354	611365	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_004842	AC	3	6	611380	611385	50 %	0 %	0 %	50 %	56416834
12039	NC_004842	GCA	3	9	611415	611423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12040	NC_004842	TGA	2	6	611470	611475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416834
12041	NC_004842	TG	3	6	611518	611523	0 %	50 %	50 %	0 %	56416834
12042	NC_004842	TGT	2	6	611529	611534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416834
12043	NC_004842	AT	3	6	611549	611554	50 %	50 %	0 %	0 %	56416834
12044	NC_004842	GAA	2	6	611664	611669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416834
12045	NC_004842	GA	3	6	611727	611732	50 %	0 %	50 %	0 %	56416834
12046	NC_004842	GAA	2	6	611743	611748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416834
12047	NC_004842	GCT	2	6	611796	611801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12048	NC_004842	CTG	2	6	611815	611820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12049	NC_004842	TAA	2	6	611831	611836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416834
12050	NC_004842	TGG	2	6	611927	611932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416834
12051	NC_004842	GTGCTG	2	12	611959	611970	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56416834
12052	NC_004842	TGG	2	6	611975	611980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416834
12053	NC_004842	CTG	2	6	611992	611997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12054	NC_004842	TGC	2	6	612017	612022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12055	NC_004842	TGC	3	9	612071	612079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12056	NC_004842	TGTGCT	2	12	612081	612092	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56416834
12057	NC_004842	CCT	2	6	612118	612123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416834
12058	NC_004842	GCTGC	2	10	612124	612133	0 %	20 %	40 %	40 %	56416834
12059	NC_004842	TGT	2	6	612134	612139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416834
12060	NC_004842	TGTA	2	8	612149	612156	25 %	50 %	25 %	0 %	56416834
12061	NC_004842	CTG	2	6	612157	612162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12062	NC_004842	CTGTA	2	10	612173	612182	20 %	40 %	20 %	20 %	56416834
12063	NC_004842	GTA	2	6	612279	612284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416834
12064	NC_004842	TAC	2	6	612314	612319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416834
12065	NC_004842	ATG	2	6	612325	612330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416834
12066	NC_004842	AGA	2	6	612352	612357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416834
12067	NC_004842	CAG	2	6	612359	612364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12068	NC_004842	GCTC	2	8	612374	612381	0 %	25 %	25 %	50 %	56416834
12069	NC_004842	TGC	2	6	612465	612470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12070	NC_004842	GTG	2	6	612489	612494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416834
12071	NC_004842	CCG	2	6	612498	612503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416834
12072	NC_004842	TG	3	6	612513	612518	0 %	50 %	50 %	0 %	56416834
12073	NC_004842	TA	3	6	612562	612567	50 %	50 %	0 %	0 %	56416834
12074	NC_004842	AAC	2	6	612646	612651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416834
12075	NC_004842	GCA	2	6	612701	612706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12076	NC_004842	TGC	2	6	612776	612781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416834
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12078	NC_004842	TGC	2	6	612872	612877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12079	NC_004842	CTG	2	6	612901	612906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416834
12080	NC_004842	G	6	6	612968	612973	0 %	0 %	100 %	0 %	56416834
12081	NC_004842	TAG	2	6	613056	613061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12082	NC_004842	TAG	2	6	613101	613106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12083	NC_004842	GCT	2	6	613111	613116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12084	NC_004842	GA	3	6	613144	613149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12085	NC_004842	CTG	2	6	613293	613298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12086	NC_004842	ATTG	2	8	613354	613361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12087	NC_004842	TGC	3	9	613365	613373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12088	NC_004842	CTGA	2	8	613377	613384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12089	NC_004842	TTA	2	6	613433	613438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12090	NC_004842	TTAA	2	8	613446	613453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12091	NC_004842	AAT	2	6	613505	613510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12092	NC_004842	ATT	2	6	613517	613522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12093	NC_004842	CTT	2	6	613559	613564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12094	NC_004842	GTAT	2	8	613571	613578	25 %	50 %	25 %	0 %	56416835
12095	NC_004842	GT	3	6	613646	613651	0 %	50 %	50 %	0 %	56416835
12096	NC_004842	GC	3	6	613654	613659	0 %	0 %	50 %	50 %	56416835
12097	NC_004842	TGC	2	6	613734	613739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416835
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12100	NC_004842	CCT	2	6	613948	613953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416835
12101	NC_004842	GC	3	6	613977	613982	0 %	0 %	50 %	50 %	56416835
12102	NC_004842	GCA	2	6	613986	613991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416835
12103	NC_004842	CAG	2	6	614156	614161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416835
12104	NC_004842	AG	3	6	614193	614198	50 %	0 %	50 %	0 %	56416835
12105	NC_004842	CAG	2	6	614243	614248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416835
12106	NC_004842	GCT	2	6	614272	614277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416835
12107	NC_004842	AAC	2	6	614308	614313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416835
12108	NC_004842	GGC	3	9	614431	614439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416835
12109	NC_004842	ACT	2	6	614498	614503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416835
12110	NC_004842	AACCG	2	10	614520	614529	40 %	0 %	20 %	40 %	56416835
12111	NC_004842	GCG	2	6	614551	614556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416835
12112	NC_004842	ATA	2	6	614567	614572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416835
12113	NC_004842	TA	3	6	614662	614667	50 %	50 %	0 %	0 %	56416835
12114	NC_004842	GC	3	6	614713	614718	0 %	0 %	50 %	50 %	56416835
12115	NC_004842	AGT	2	6	614745	614750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416835
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12117	NC_004842	GCA	2	6	614762	614767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416835
12118	NC_004842	CTA	2	6	614881	614886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416835
12119	NC_004842	AGG	2	6	615014	615019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416835
12120	NC_004842	TAC	2	6	615083	615088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416835
12121	NC_004842	CTG	2	6	615166	615171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416835
12122	NC_004842	CTTA	2	8	615219	615226	25 %	50 %	0 %	25 %	56416835
12123	NC_004842	CAT	2	6	615231	615236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416835
12124	NC_004842	GT	3	6	615246	615251	0 %	50 %	50 %	0 %	56416835
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12231	NC_004842	TGC	2	6	620088	620093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416837
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12233	NC_004842	GCA	2	6	620222	620227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416837
12234	NC_004842	TA	3	6	620232	620237	50 %	50 %	0 %	0 %	56416837
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12236	NC_004842	TCT	2	6	620325	620330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416837
12237	NC_004842	CAAA	2	8	620355	620362	75 %	0 %	0 %	25 %	56416837
12238	NC_004842	TAC	2	6	620370	620375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416837
12239	NC_004842	TA	3	6	620416	620421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12240	NC_004842	CATA	2	8	620529	620536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12241	NC_004842	TA	3	6	620542	620547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12242	NC_004842	GCA	3	9	620568	620576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12243	NC_004842	AT	3	6	620649	620654	50 %	50 %	0 %	0 %	56416838
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12245	NC_004842	CTG	2	6	620710	620715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416838
12246	NC_004842	A	6	6	620769	620774	100 %	0 %	0 %	0 %	56416838
12247	NC_004842	CCAA	2	8	620827	620834	50 %	0 %	0 %	50 %	56416838
12248	NC_004842	ATC	2	6	620913	620918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416838
12249	NC_004842	CAT	2	6	620928	620933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416838
12250	NC_004842	TGC	2	6	620994	620999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416838
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12257	NC_004842	GCA	2	6	621492	621497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416839
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12302	NC_004842	ATA	2	6	623735	623740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12303	NC_004842	AT	4	8	623772	623779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12304	NC_004842	A	6	6	623790	623795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12305	NC_004842	AAT	2	6	623805	623810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12307	NC_004842	TTGA	2	8	623903	623910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12355	NC_004842	AGT	2	6	626880	626885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416842
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12360	NC_004842	ACA	2	6	627327	627332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12361	NC_004842	GTAAT	2	10	627338	627347	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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12369	NC_004842	AGC	2	6	627627	627632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416843
12370	NC_004842	TCC	3	9	627673	627681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416843
12371	NC_004842	AAG	2	6	627694	627699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416843
12372	NC_004842	GAT	2	6	627727	627732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416843
12373	NC_004842	GC	3	6	627787	627792	0 %	0 %	50 %	50 %	56416843
12374	NC_004842	AAT	2	6	627801	627806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416843
12375	NC_004842	A	6	6	627853	627858	100 %	0 %	0 %	0 %	56416843
12376	NC_004842	GCA	2	6	628057	628062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416843
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12388	NC_004842	TGT	2	6	628614	628619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229220790
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12396	NC_004842	ACAGC	2	10	628966	628975	40 %	0 %	20 %	40 %	56416845
12397	NC_004842	ACAGC	2	10	628981	628990	40 %	0 %	20 %	40 %	56416845
12398	NC_004842	ACAGC	2	10	628996	629005	40 %	0 %	20 %	40 %	56416845
12399	NC_004842	ACAGC	2	10	629011	629020	40 %	0 %	20 %	40 %	56416845
12400	NC_004842	ACAGC	2	10	629026	629035	40 %	0 %	20 %	40 %	56416845
12401	NC_004842	ACAGC	2	10	629041	629050	40 %	0 %	20 %	40 %	56416845
12402	NC_004842	CAA	2	6	629127	629132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12403	NC_004842	GTA	2	6	629138	629143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12406	NC_004842	CTAC	2	8	629173	629180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12407	NC_004842	TGCT	2	8	629359	629366	0 %	50 %	25 %	25 %	56416846
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12438	NC_004842	ATGC	2	8	631155	631162	25 %	25 %	25 %	25 %	56416846
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12441	NC_004842	GAT	2	6	631275	631280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416846
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12468	NC_004842	A	6	6	632302	632307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12469	NC_004842	AAGTG	2	10	632393	632402	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12470	NC_004842	CAA	2	6	632417	632422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12471	NC_004842	GGT	2	6	632423	632428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12472	NC_004842	CGG	2	6	632446	632451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12473	NC_004842	GTG	2	6	632480	632485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12475	NC_004842	CAA	2	6	632543	632548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12476	NC_004842	GGAAC	2	10	632579	632588	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12477	NC_004842	TGG	2	6	632621	632626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12478	NC_004842	GTG	2	6	632638	632643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12479	NC_004842	GCA	2	6	632661	632666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12480	NC_004842	CAA	2	6	632695	632700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12481	NC_004842	ATT	2	6	632724	632729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416847
12482	NC_004842	GCA	2	6	632762	632767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416847
12483	NC_004842	TACG	2	8	632860	632867	25 %	25 %	25 %	25 %	56416847
12484	NC_004842	CTG	2	6	632900	632905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416847
12485	NC_004842	TTTTC	2	10	632922	632931	0 %	80 %	0 %	20 %	56416847
12486	NC_004842	CAC	2	6	633025	633030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416847
12487	NC_004842	TTTA	2	8	633073	633080	25 %	75 %	0 %	0 %	56416847
12488	NC_004842	CCGC	2	8	633089	633096	0 %	0 %	25 %	75 %	56416847
12489	NC_004842	ATC	2	6	633157	633162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416847
12490	NC_004842	TGA	2	6	633208	633213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416847
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12492	NC_004842	AGC	2	6	633398	633403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416847
12493	NC_004842	AGC	2	6	633406	633411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416847
12494	NC_004842	ACG	2	6	633517	633522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416847
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