MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 4258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003065	CCG	2	6	174100	174105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161992
3502	NC_003065	ATC	2	6	174165	174170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161992
3503	NC_003065	GA	3	6	174180	174185	50 %	0 %	50 %	0 %	159161992
3504	NC_003065	TCA	2	6	174193	174198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161992
3505	NC_003065	GACT	2	8	174236	174243	25 %	25 %	25 %	25 %	159161992
3506	NC_003065	CTT	2	6	174297	174302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161992
3507	NC_003065	ACCC	2	8	174342	174349	25 %	0 %	0 %	75 %	159161993
3508	NC_003065	CGA	2	6	174492	174497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161993
3509	NC_003065	CCG	2	6	174502	174507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161993
3510	NC_003065	CG	3	6	174515	174520	0 %	0 %	50 %	50 %	159161993
3511	NC_003065	TTC	2	6	174614	174619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161993
3512	NC_003065	TTC	2	6	174623	174628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161993
3513	NC_003065	GA	3	6	174694	174699	50 %	0 %	50 %	0 %	159161993
3514	NC_003065	TTC	2	6	174748	174753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161993
3515	NC_003065	TG	3	6	174777	174782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_003065	TGG	2	6	174830	174835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159161994
3517	NC_003065	CG	3	6	174985	174990	0 %	0 %	50 %	50 %	159161994
3518	NC_003065	CAG	2	6	175035	175040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161994
3519	NC_003065	CGAG	2	8	175043	175050	25 %	0 %	50 %	25 %	159161994
3520	NC_003065	TCG	2	6	175060	175065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161994
3521	NC_003065	GATG	2	8	175067	175074	25 %	25 %	50 %	0 %	159161994
3522	NC_003065	TCGG	2	8	175102	175109	0 %	25 %	50 %	25 %	159161994
3523	NC_003065	TCG	2	6	175189	175194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119973
3524	NC_003065	GAC	2	6	175218	175223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119973
3525	NC_003065	CGTC	2	8	175244	175251	0 %	25 %	25 %	50 %	16119973
3526	NC_003065	CGA	2	6	175283	175288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119973
3527	NC_003065	CGC	2	6	175310	175315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119973
3528	NC_003065	TCG	2	6	175319	175324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119973
3529	NC_003065	TCG	2	6	175328	175333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119973
3530	NC_003065	ACA	2	6	175379	175384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119973
3531	NC_003065	GAG	2	6	175421	175426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119973
3532	NC_003065	CCTG	2	8	175435	175442	0 %	25 %	25 %	50 %	16119973
3533	NC_003065	GGCA	2	8	175556	175563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_003065	GAG	2	6	175573	175578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_003065	TTTC	2	8	175659	175666	0 %	75 %	0 %	25 %	16119974
3536	NC_003065	CGA	2	6	175692	175697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119974
3537	NC_003065	AGC	2	6	175795	175800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119974
3538	NC_003065	CT	3	6	175820	175825	0 %	50 %	0 %	50 %	16119974
3539	NC_003065	CGAA	2	8	175844	175851	50 %	0 %	25 %	25 %	16119974
3540	NC_003065	GTGCGG	2	12	175963	175974	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3541	NC_003065	GC	3	6	175985	175990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_003065	GAT	2	6	176071	176076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161995
3543	NC_003065	CGT	2	6	176116	176121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161995
3544	NC_003065	GCCT	2	8	176155	176162	0 %	25 %	25 %	50 %	159161995
3545	NC_003065	CCT	2	6	176217	176222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159161995
3546	NC_003065	A	6	6	176319	176324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_003065	CTT	2	6	176425	176430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_003065	GGC	2	6	176587	176592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159162009
3549	NC_003065	AAT	2	6	176662	176667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159162009
3550	NC_003065	AAT	2	6	176691	176696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159162009
3551	NC_003065	GCA	2	6	176730	176735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159162009
3552	NC_003065	GAA	2	6	176862	176867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_003065	CGT	2	6	176891	176896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_003065	GCA	2	6	176935	176940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_003065	TGC	2	6	176955	176960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_003065	GCG	2	6	177119	177124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_003065	ATGA	2	8	177206	177213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_003065	CAGC	2	8	177263	177270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_003065	ACG	2	6	177285	177290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_003065	GCA	2	6	177303	177308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_003065	ACT	2	6	177406	177411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119976
3562	NC_003065	AGCG	2	8	177417	177424	25 %	0 %	50 %	25 %	16119976
3563	NC_003065	CAGCA	2	10	177500	177509	40 %	0 %	20 %	40 %	16119976
3564	NC_003065	GGC	2	6	177528	177533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119976
3565	NC_003065	AGAT	2	8	177614	177621	50 %	25 %	25 %	0 %	16119976
3566	NC_003065	CGC	2	6	177751	177756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119976
3567	NC_003065	TCG	2	6	177789	177794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119976
3568	NC_003065	AGT	2	6	177807	177812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119976
3569	NC_003065	ATC	2	6	177824	177829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119976
3570	NC_003065	GGCTT	2	10	177834	177843	0 %	40 %	40 %	20 %	16119976
3571	NC_003065	GCG	2	6	178080	178085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119976
3572	NC_003065	GC	3	6	178193	178198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_003065	AT	3	6	178208	178213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_003065	GCA	2	6	178221	178226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_003065	TTGC	2	8	178352	178359	0 %	50 %	25 %	25 %	159161996
3576	NC_003065	TGT	2	6	178370	178375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159161996
3577	NC_003065	TCC	2	6	178384	178389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159161996
3578	NC_003065	GCG	2	6	178524	178529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161996
3579	NC_003065	CG	3	6	178603	178608	0 %	0 %	50 %	50 %	159161996
3580	NC_003065	TCG	2	6	178696	178701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161996
3581	NC_003065	GCT	2	6	178711	178716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161996
3582	NC_003065	CAGG	2	8	178741	178748	25 %	0 %	50 %	25 %	159161996
3583	NC_003065	CGA	2	6	178850	178855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_003065	CAG	2	6	178870	178875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_003065	CTG	2	6	178927	178932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_003065	CTG	2	6	179070	179075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_003065	GCCG	2	8	179112	179119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_003065	GAAA	2	8	179129	179136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_003065	GC	3	6	179171	179176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_003065	CCGA	2	8	179201	179208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_003065	TGC	2	6	179209	179214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_003065	GCC	2	6	179215	179220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_003065	ATG	2	6	179246	179251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_003065	GCG	2	6	179254	179259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_003065	TCT	2	6	179311	179316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223351
3596	NC_003065	GCC	2	6	179396	179401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223351
3597	NC_003065	GC	3	6	179445	179450	0 %	0 %	50 %	50 %	41223351
3598	NC_003065	CTC	2	6	179529	179534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41223351
3599	NC_003065	CAA	2	6	179535	179540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41223351
3600	NC_003065	CGA	2	6	179758	179763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223351
3601	NC_003065	AT	3	6	179814	179819	50 %	50 %	0 %	0 %	41223351
3602	NC_003065	ACC	2	6	179905	179910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223351
3603	NC_003065	AGATG	2	10	179975	179984	40 %	20 %	40 %	0 %	41223351
3604	NC_003065	ATG	2	6	180059	180064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_003065	CTG	2	6	180099	180104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_003065	TCC	2	6	180185	180190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_003065	GAG	2	6	180200	180205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_003065	CG	3	6	180302	180307	0 %	0 %	50 %	50 %	159161997
3609	NC_003065	GAA	2	6	180378	180383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161997
3610	NC_003065	GGT	2	6	180471	180476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_003065	GCC	2	6	180514	180519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_003065	GCATA	2	10	180537	180546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3613	NC_003065	CGA	2	6	180590	180595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_003065	CG	3	6	180653	180658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_003065	AC	3	6	180724	180729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_003065	TTG	2	6	180741	180746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_003065	TGC	2	6	180908	180913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119781
3618	NC_003065	CG	3	6	181032	181037	0 %	0 %	50 %	50 %	16119781
3619	NC_003065	GTG	2	6	181047	181052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119781
3620	NC_003065	GAA	2	6	181094	181099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119781
3621	NC_003065	TC	3	6	181156	181161	0 %	50 %	0 %	50 %	16119781
3622	NC_003065	CGAC	2	8	181195	181202	25 %	0 %	25 %	50 %	16119781
3623	NC_003065	CG	3	6	181266	181271	0 %	0 %	50 %	50 %	16119781
3624	NC_003065	TTC	2	6	181279	181284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119781
3625	NC_003065	GTC	2	6	181292	181297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119781
3626	NC_003065	CGAA	2	8	181321	181328	50 %	0 %	25 %	25 %	16119781
3627	NC_003065	TGC	2	6	181342	181347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119781
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3632	NC_003065	G	6	6	181745	181750	0 %	0 %	100 %	0 %	16119781
3633	NC_003065	CGT	2	6	181762	181767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119781
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3645	NC_003065	TGG	2	6	182249	182254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119781
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3742	NC_003065	TGG	2	6	186540	186545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119786
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3746	NC_003065	CG	3	6	186673	186678	0 %	0 %	50 %	50 %	16119786
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3872	NC_003065	GTC	2	6	193729	193734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119794
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3999	NC_003065	TCT	2	6	200143	200148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223312
4000	NC_003065	GTC	2	6	200166	200171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223312

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