MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 4258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003065	AGC	2	6	25014	25019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161954
502	NC_003065	GCT	2	6	25070	25075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161954
503	NC_003065	AGCGC	2	10	25108	25117	20 %	0 %	40 %	40 %	159161954
504	NC_003065	TCA	2	6	25198	25203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161954
505	NC_003065	GAT	2	6	25225	25230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161954
506	NC_003065	GCA	2	6	25300	25305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161954
507	NC_003065	CGC	2	6	25342	25347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161954
508	NC_003065	AGC	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161954
509	NC_003065	CAG	3	9	25715	25723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161954
510	NC_003065	TCG	2	6	25840	25845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161954
511	NC_003065	TCT	2	6	25923	25928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161954
512	NC_003065	CAT	2	6	25988	25993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161954
513	NC_003065	TGA	2	6	26005	26010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161954
514	NC_003065	TTC	2	6	26185	26190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223317
515	NC_003065	CGC	2	6	26229	26234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223317
516	NC_003065	GCT	2	6	26261	26266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223317
517	NC_003065	CGA	2	6	26364	26369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223317
518	NC_003065	GAT	2	6	26375	26380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41223317
519	NC_003065	GACCG	2	10	26438	26447	20 %	0 %	40 %	40 %	41223317
520	NC_003065	CGT	2	6	26631	26636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223317
521	NC_003065	CCG	2	6	26757	26762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223317
522	NC_003065	AGA	2	6	26909	26914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41223317
523	NC_003065	AGC	2	6	27061	27066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223317
524	NC_003065	CGC	2	6	27124	27129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223317
525	NC_003065	CGAT	2	8	27141	27148	25 %	25 %	25 %	25 %	41223317
526	NC_003065	TCC	2	6	27180	27185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_003065	TGT	2	6	27260	27265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41223318
528	NC_003065	GCCG	2	8	27283	27290	0 %	0 %	50 %	50 %	41223318
529	NC_003065	GTGAC	2	10	27373	27382	20 %	20 %	40 %	20 %	41223318
530	NC_003065	ATG	2	6	27408	27413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41223318
531	NC_003065	CTG	2	6	27460	27465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223318
532	NC_003065	CT	3	6	27627	27632	0 %	50 %	0 %	50 %	41223318
533	NC_003065	CAT	2	6	27656	27661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223318
534	NC_003065	GCG	2	6	27694	27699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41223318
535	NC_003065	TAG	2	6	27729	27734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41223318
536	NC_003065	CAG	2	6	27868	27873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223318
537	NC_003065	CGC	2	6	27886	27891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223318
538	NC_003065	CCA	2	6	27961	27966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223318
539	NC_003065	TTC	2	6	27978	27983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223318
540	NC_003065	CAGCC	2	10	28048	28057	20 %	0 %	20 %	60 %	41223318
541	NC_003065	CTG	2	6	28309	28314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119831
542	NC_003065	CGG	2	6	28380	28385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119831
543	NC_003065	GACT	2	8	28396	28403	25 %	25 %	25 %	25 %	16119831
544	NC_003065	CG	4	8	28459	28466	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
545	NC_003065	CAG	2	6	28509	28514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119831
546	NC_003065	CTC	2	6	28540	28545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119831
547	NC_003065	CGT	2	6	28566	28571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119831
548	NC_003065	CGG	2	6	28573	28578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119831
549	NC_003065	CGG	2	6	28594	28599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119831
550	NC_003065	TGC	2	6	28643	28648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119831
551	NC_003065	GAA	2	6	28704	28709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119831
552	NC_003065	TC	3	6	28728	28733	0 %	50 %	0 %	50 %	16119831
553	NC_003065	GTCC	2	8	28791	28798	0 %	25 %	25 %	50 %	16119831
554	NC_003065	TCG	2	6	28817	28822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119831
555	NC_003065	GC	3	6	28866	28871	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
556	NC_003065	AAG	2	6	28918	28923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119831
557	NC_003065	GTC	2	6	28983	28988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119831
558	NC_003065	TGA	2	6	29121	29126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119831
559	NC_003065	CTG	2	6	29182	29187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119831
560	NC_003065	AT	3	6	29189	29194	50 %	50 %	0 %	0 %	16119831
561	NC_003065	AGC	2	6	29195	29200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119831
562	NC_003065	CGA	2	6	29217	29222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119831
563	NC_003065	GCG	2	6	29273	29278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119831
564	NC_003065	CGC	2	6	29487	29492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119831
565	NC_003065	CGGC	2	8	29540	29547	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
566	NC_003065	CCG	2	6	29606	29611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119831
567	NC_003065	GC	3	6	29618	29623	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
568	NC_003065	CGA	2	6	29655	29660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119831
569	NC_003065	ATG	2	6	29680	29685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119831
570	NC_003065	CAT	2	6	29808	29813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119832
571	NC_003065	GGAA	2	8	29838	29845	50 %	0 %	50 %	0 %	16119832
572	NC_003065	AGG	2	6	29846	29851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119832
573	NC_003065	GTC	2	6	29865	29870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119832
574	NC_003065	CGG	2	6	29885	29890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119832
575	NC_003065	GAC	2	6	29921	29926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119832
576	NC_003065	CGC	2	6	29981	29986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119832
577	NC_003065	CTG	2	6	30003	30008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119833
578	NC_003065	CGT	2	6	30019	30024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119833
579	NC_003065	TGCA	2	8	30071	30078	25 %	25 %	25 %	25 %	16119833
580	NC_003065	CGA	2	6	30109	30114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119833
581	NC_003065	CGC	2	6	30132	30137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119833
582	NC_003065	CG	3	6	30236	30241	0 %	0 %	50 %	50 %	16119833
583	NC_003065	GGC	2	6	30350	30355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119833
584	NC_003065	TGA	2	6	30385	30390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119833
585	NC_003065	AAT	2	6	30470	30475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119833
586	NC_003065	GCC	2	6	30521	30526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119833
587	NC_003065	TCA	2	6	30562	30567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119833
588	NC_003065	CAG	2	6	30614	30619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119833
589	NC_003065	ACG	2	6	30649	30654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119833
590	NC_003065	AC	3	6	30659	30664	50 %	0 %	0 %	50 %	16119833
591	NC_003065	TCT	2	6	30754	30759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119833
592	NC_003065	TCT	3	9	30774	30782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119833
593	NC_003065	AGA	2	6	30802	30807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119833
594	NC_003065	ACC	2	6	30812	30817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119833
595	NC_003065	GCG	2	6	30821	30826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119833
596	NC_003065	GAT	2	6	30907	30912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119833
597	NC_003065	TCG	2	6	30924	30929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119833
598	NC_003065	TTCG	2	8	30960	30967	0 %	50 %	25 %	25 %	16119833
599	NC_003065	ACGC	2	8	30970	30977	25 %	0 %	25 %	50 %	16119833
600	NC_003065	GAT	3	9	30998	31006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119833
601	NC_003065	GCG	2	6	31044	31049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119833
602	NC_003065	CCG	2	6	31059	31064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119833
603	NC_003065	CAA	2	6	31066	31071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119833
604	NC_003065	GT	3	6	31210	31215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_003065	CTT	2	6	31252	31257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_003065	TCA	2	6	31268	31273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_003065	GAT	2	6	31284	31289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_003065	GCC	2	6	31364	31369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_003065	GGC	2	6	31420	31425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_003065	TCG	2	6	31481	31486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_003065	GATT	2	8	31525	31532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_003065	CAAT	2	8	31541	31548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
613	NC_003065	AGC	2	6	31581	31586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_003065	GAA	2	6	31681	31686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_003065	CTC	2	6	31801	31806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119834
616	NC_003065	ACT	2	6	31844	31849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119834
617	NC_003065	CAC	2	6	31898	31903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119834
618	NC_003065	TTC	2	6	31950	31955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119834
619	NC_003065	GATC	2	8	32045	32052	25 %	25 %	25 %	25 %	16119834
620	NC_003065	CTG	2	6	32082	32087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119834
621	NC_003065	CGG	2	6	32090	32095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119834
622	NC_003065	TCGA	2	8	32109	32116	25 %	25 %	25 %	25 %	16119834
623	NC_003065	CGT	2	6	32142	32147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119834
624	NC_003065	TGC	2	6	32162	32167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119834
625	NC_003065	GCT	2	6	32183	32188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119834
626	NC_003065	GCA	2	6	32207	32212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119834
627	NC_003065	CG	3	6	32225	32230	0 %	0 %	50 %	50 %	16119834
628	NC_003065	GGT	2	6	32433	32438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119834
629	NC_003065	GCC	2	6	32445	32450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119834
630	NC_003065	GC	3	6	32457	32462	0 %	0 %	50 %	50 %	16119834
631	NC_003065	ACA	2	6	32545	32550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119834
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633	NC_003065	GGC	2	6	32688	32693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119834
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681	NC_003065	CGG	2	6	34742	34747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119835
682	NC_003065	TGC	2	6	34754	34759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119835
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702	NC_003065	CGC	2	6	35460	35465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119835
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757	NC_003065	GGC	2	6	37821	37826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119838
758	NC_003065	GGCGCA	2	12	37844	37855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16119838
759	NC_003065	GCT	2	6	37882	37887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119838
760	NC_003065	GCA	2	6	38039	38044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119838
761	NC_003065	CCG	2	6	38053	38058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119838
762	NC_003065	GAT	2	6	38073	38078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119838
763	NC_003065	AAC	2	6	38100	38105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119838
764	NC_003065	GCA	2	6	38161	38166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119838
765	NC_003065	GAT	2	6	38181	38186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119838
766	NC_003065	TCA	2	6	38222	38227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119838
767	NC_003065	C	6	6	38264	38269	0 %	0 %	0 %	100 %	16119838
768	NC_003065	AGT	2	6	38275	38280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119838
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770	NC_003065	GGC	2	6	38434	38439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41223319
771	NC_003065	TCT	2	6	38477	38482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223319
772	NC_003065	C	7	7	38518	38524	0 %	0 %	0 %	100 %	41223319
773	NC_003065	TTG	2	6	38555	38560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41223319
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777	NC_003065	GAG	2	6	38875	38880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41223319
778	NC_003065	CG	3	6	38910	38915	0 %	0 %	50 %	50 %	41223319
779	NC_003065	CGC	2	6	38932	38937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223319
780	NC_003065	ATG	2	6	38939	38944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41223319
781	NC_003065	CAT	2	6	38946	38951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223319
782	NC_003065	ATCCC	2	10	38978	38987	20 %	20 %	0 %	60 %	41223319
783	NC_003065	CGA	2	6	38997	39002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223319
784	NC_003065	CCGC	2	8	39071	39078	0 %	0 %	25 %	75 %	41223319
785	NC_003065	CTTGG	2	10	39139	39148	0 %	40 %	40 %	20 %	41223319
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788	NC_003065	GC	3	6	39275	39280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
789	NC_003065	CTT	2	6	39337	39342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223320
790	NC_003065	CAC	2	6	39428	39433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223320
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792	NC_003065	CCA	2	6	39487	39492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223320
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795	NC_003065	GCT	3	9	39574	39582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223320
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798	NC_003065	GTTT	2	8	39616	39623	0 %	75 %	25 %	0 %	41223320
799	NC_003065	CG	3	6	39653	39658	0 %	0 %	50 %	50 %	41223320
800	NC_003065	GCATGC	2	12	39772	39783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41223320
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803	NC_003065	GCCGGA	2	12	39920	39931	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	41223320
804	NC_003065	TCT	2	6	40020	40025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223320
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807	NC_003065	CGC	2	6	40131	40136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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809	NC_003065	GCA	2	6	40169	40174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
810	NC_003065	CCG	2	6	40188	40193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
811	NC_003065	TTC	2	6	40201	40206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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819	NC_003065	CTGC	2	8	40808	40815	0 %	25 %	25 %	50 %	159161955
820	NC_003065	GCC	2	6	40817	40822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161955
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832	NC_003065	TCG	2	6	41407	41412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119842
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886	NC_003065	CTTCG	2	10	44098	44107	0 %	40 %	20 %	40 %	41223323
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