MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome linear

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_003063	CTG	2	6	1239780	1239785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186033
27503	NC_003063	CTG	2	6	1239789	1239794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186033
27504	NC_003063	CGTC	2	8	1239818	1239825	0 %	25 %	25 %	50 %	159186033
27505	NC_003063	GCC	2	6	1239862	1239867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186033
27506	NC_003063	CCA	2	6	1239897	1239902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159186033
27507	NC_003063	CGGG	2	8	1239950	1239957	0 %	0 %	75 %	25 %	159186033
27508	NC_003063	TGC	2	6	1240030	1240035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186033
27509	NC_003063	GCCA	2	8	1240088	1240095	25 %	0 %	25 %	50 %	159186033
27510	NC_003063	TCC	2	6	1240174	1240179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186033
27511	NC_003063	CGATCT	2	12	1240226	1240237	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159186033
27512	NC_003063	CGG	2	6	1240256	1240261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186033
27513	NC_003063	GGCG	2	8	1240289	1240296	0 %	0 %	75 %	25 %	159186033
27514	NC_003063	TTC	2	6	1240335	1240340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186033
27515	NC_003063	TCGA	2	8	1240357	1240364	25 %	25 %	25 %	25 %	159186033
27516	NC_003063	GCA	2	6	1240367	1240372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186033
27517	NC_003063	ATG	2	6	1240450	1240455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186033
27518	NC_003063	GGA	2	6	1240470	1240475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27519	NC_003063	GTT	2	6	1240500	1240505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27520	NC_003063	TCC	2	6	1240532	1240537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27521	NC_003063	AGCG	2	8	1240661	1240668	25 %	0 %	50 %	25 %	15890853
27522	NC_003063	CGC	2	6	1240718	1240723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890853
27523	NC_003063	GC	3	6	1240765	1240770	0 %	0 %	50 %	50 %	15890853
27524	NC_003063	GAA	2	6	1240930	1240935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890853
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27526	NC_003063	CGG	2	6	1241053	1241058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890853
27527	NC_003063	CTG	2	6	1241107	1241112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890853
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27529	NC_003063	GAA	2	6	1241176	1241181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890853
27530	NC_003063	A	6	6	1241180	1241185	100 %	0 %	0 %	0 %	15890853
27531	NC_003063	CAC	2	6	1241215	1241220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15890853
27532	NC_003063	GCA	2	6	1241226	1241231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890853
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27534	NC_003063	CCA	2	6	1241298	1241303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15890853
27535	NC_003063	GCC	2	6	1241304	1241309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890853
27536	NC_003063	CG	3	6	1241334	1241339	0 %	0 %	50 %	50 %	15890853
27537	NC_003063	GCGG	2	8	1241425	1241432	0 %	0 %	75 %	25 %	15890853
27538	NC_003063	GTC	2	6	1241479	1241484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890853
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27542	NC_003063	GAG	2	6	1241708	1241713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27543	NC_003063	GCC	2	6	1241758	1241763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890852
27544	NC_003063	GCC	2	6	1241779	1241784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890852
27545	NC_003063	CGG	2	6	1241850	1241855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890852
27546	NC_003063	CGG	2	6	1241898	1241903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890852
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27548	NC_003063	TCGAT	2	10	1242005	1242014	20 %	40 %	20 %	20 %	15890852
27549	NC_003063	TCG	3	9	1242028	1242036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890852
27550	NC_003063	AAG	2	6	1242070	1242075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890852
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27552	NC_003063	CGG	2	6	1242183	1242188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890852
27553	NC_003063	GCG	2	6	1242206	1242211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890852
27554	NC_003063	TTC	2	6	1242220	1242225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890852
27555	NC_003063	CTG	2	6	1242230	1242235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890852
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27559	NC_003063	CTTC	2	8	1242344	1242351	0 %	50 %	0 %	50 %	15890852
27560	NC_003063	CTG	2	6	1242352	1242357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890852
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27571	NC_003063	AGCA	2	8	1242826	1242833	50 %	0 %	25 %	25 %	15890852
27572	NC_003063	ATT	2	6	1242842	1242847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15890852
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27587	NC_003063	TGGG	2	8	1243545	1243552	0 %	25 %	75 %	0 %	15890851
27588	NC_003063	CG	3	6	1243601	1243606	0 %	0 %	50 %	50 %	15890851
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27602	NC_003063	TGC	2	6	1244065	1244070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890850
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27617	NC_003063	TCG	3	9	1244700	1244708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890849
27618	NC_003063	TCG	2	6	1244724	1244729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890849
27619	NC_003063	GCT	2	6	1244776	1244781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890849
27620	NC_003063	TGG	3	9	1244802	1244810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15890849
27621	NC_003063	GCG	2	6	1244837	1244842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890849
27622	NC_003063	CGG	2	6	1244875	1244880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890849
27623	NC_003063	GTC	2	6	1244927	1244932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890849
27624	NC_003063	CGGCT	2	10	1244981	1244990	0 %	20 %	40 %	40 %	15890849
27625	NC_003063	GCGG	2	8	1244998	1245005	0 %	0 %	75 %	25 %	15890849
27626	NC_003063	TGC	2	6	1245054	1245059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890849
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27629	NC_003063	TCG	2	6	1245162	1245167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890849
27630	NC_003063	GTC	3	9	1245179	1245187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890849
27631	NC_003063	GGC	2	6	1245188	1245193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890849
27632	NC_003063	TCA	2	6	1245297	1245302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890849
27633	NC_003063	TGC	2	6	1245312	1245317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890849
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27635	NC_003063	CCG	2	6	1245382	1245387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890848
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27640	NC_003063	GCT	2	6	1245566	1245571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890848
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27642	NC_003063	TGC	2	6	1245602	1245607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890848
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27645	NC_003063	CTT	2	6	1245687	1245692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890848
27646	NC_003063	CTT	2	6	1245707	1245712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890848
27647	NC_003063	TCT	2	6	1245778	1245783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890848
27648	NC_003063	CG	3	6	1245832	1245837	0 %	0 %	50 %	50 %	15890848
27649	NC_003063	GCC	2	6	1245897	1245902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890848
27650	NC_003063	ATCC	2	8	1245965	1245972	25 %	25 %	0 %	50 %	15890848
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27652	NC_003063	GC	3	6	1245986	1245991	0 %	0 %	50 %	50 %	15890848
27653	NC_003063	CGG	2	6	1246045	1246050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890848
27654	NC_003063	GGC	2	6	1246068	1246073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890848
27655	NC_003063	TGA	2	6	1246144	1246149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890848
27656	NC_003063	CGG	2	6	1246157	1246162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890848
27657	NC_003063	CAT	2	6	1246250	1246255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890848
27658	NC_003063	CCT	2	6	1246389	1246394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27659	NC_003063	GAC	2	6	1246405	1246410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27660	NC_003063	CGGGG	2	10	1246465	1246474	0 %	0 %	80 %	20 %	159186034
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27662	NC_003063	CAA	2	6	1246600	1246605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186034
27663	NC_003063	CG	3	6	1246658	1246663	0 %	0 %	50 %	50 %	159186034
27664	NC_003063	CG	3	6	1246674	1246679	0 %	0 %	50 %	50 %	159186034
27665	NC_003063	GCT	2	6	1246695	1246700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186034
27666	NC_003063	GGGCTG	2	12	1246774	1246785	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	159186034
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27669	NC_003063	CTGG	2	8	1247007	1247014	0 %	25 %	50 %	25 %	159186034
27670	NC_003063	ATC	2	6	1247102	1247107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186034
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27673	NC_003063	GC	3	6	1247164	1247169	0 %	0 %	50 %	50 %	159186034
27674	NC_003063	CGC	2	6	1247208	1247213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186034
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27677	NC_003063	CCG	2	6	1247493	1247498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186034
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27704	NC_003063	GGC	2	6	1248542	1248547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186035
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27716	NC_003063	ACCGC	2	10	1249016	1249025	20 %	0 %	20 %	60 %	15890845
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27720	NC_003063	GGC	2	6	1249141	1249146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890845
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27724	NC_003063	CGA	2	6	1249261	1249266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890845
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27728	NC_003063	GTC	2	6	1249438	1249443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890845
27729	NC_003063	TCG	2	6	1249668	1249673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890845
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27731	NC_003063	TTC	2	6	1249741	1249746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15890845
27732	NC_003063	ACG	2	6	1249751	1249756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890845
27733	NC_003063	CGG	3	9	1249783	1249791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890845
27734	NC_003063	GCT	2	6	1249792	1249797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890845
27735	NC_003063	CAGG	2	8	1249837	1249844	25 %	0 %	50 %	25 %	15890845
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27737	NC_003063	CAC	2	6	1249864	1249869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15890845
27738	NC_003063	GAT	2	6	1249879	1249884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890845
27739	NC_003063	CG	3	6	1249963	1249968	0 %	0 %	50 %	50 %	15890845
27740	NC_003063	GCCT	2	8	1250033	1250040	0 %	25 %	25 %	50 %	15890845
27741	NC_003063	CG	3	6	1250058	1250063	0 %	0 %	50 %	50 %	15890845
27742	NC_003063	CGC	2	6	1250109	1250114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890845
27743	NC_003063	TATC	2	8	1250137	1250144	25 %	50 %	0 %	25 %	15890845
27744	NC_003063	GGC	2	6	1250213	1250218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890845
27745	NC_003063	GAT	2	6	1250288	1250293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15890845
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27750	NC_003063	ACG	2	6	1250495	1250500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890845
27751	NC_003063	CGG	2	6	1250509	1250514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890845
27752	NC_003063	CGG	2	6	1250529	1250534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890845
27753	NC_003063	GAG	2	6	1250570	1250575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15890845
27754	NC_003063	GAAG	2	8	1250635	1250642	50 %	0 %	50 %	0 %	15890845
27755	NC_003063	GGA	2	6	1250656	1250661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15890845
27756	NC_003063	CGC	2	6	1250703	1250708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890845
27757	NC_003063	ATC	2	6	1250726	1250731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890845
27758	NC_003063	GGCC	2	8	1250801	1250808	0 %	0 %	50 %	50 %	15890845
27759	NC_003063	GAA	2	6	1250812	1250817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890845
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27763	NC_003063	CGG	3	9	1251004	1251012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890844
27764	NC_003063	GC	3	6	1251016	1251021	0 %	0 %	50 %	50 %	15890844
27765	NC_003063	GC	3	6	1251048	1251053	0 %	0 %	50 %	50 %	15890844
27766	NC_003063	CCGG	2	8	1251056	1251063	0 %	0 %	50 %	50 %	15890844
27767	NC_003063	ACG	2	6	1251091	1251096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15890844
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27773	NC_003063	GCATG	2	10	1251500	1251509	20 %	20 %	40 %	20 %	15890844
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27776	NC_003063	GC	3	6	1251618	1251623	0 %	0 %	50 %	50 %	15890844
27777	NC_003063	CGG	2	6	1251653	1251658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890844
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27779	NC_003063	ATG	2	6	1251793	1251798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186036
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27787	NC_003063	CGA	2	6	1252169	1252174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186036
27788	NC_003063	CGATCA	2	12	1252176	1252187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159186036
27789	NC_003063	TGG	2	6	1252196	1252201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186036
27790	NC_003063	AGGC	2	8	1252221	1252228	25 %	0 %	50 %	25 %	159186036
27791	NC_003063	ATC	2	6	1252244	1252249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186036
27792	NC_003063	TGC	2	6	1252259	1252264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186036
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27803	NC_003063	A	7	7	1253054	1253060	100 %	0 %	0 %	0 %	159186037
27804	NC_003063	CCTTT	2	10	1253063	1253072	0 %	60 %	0 %	40 %	159186037
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27806	NC_003063	TTC	2	6	1253285	1253290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186038
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27809	NC_003063	TG	3	6	1253490	1253495	0 %	50 %	50 %	0 %	159186038
27810	NC_003063	AGACCG	2	12	1253552	1253563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186038
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27812	NC_003063	ACA	2	6	1253603	1253608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186038
27813	NC_003063	CG	3	6	1253623	1253628	0 %	0 %	50 %	50 %	159186038
27814	NC_003063	CCG	2	6	1253632	1253637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186038
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27818	NC_003063	TTCGGC	2	12	1253844	1253855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890840
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27822	NC_003063	CGC	2	6	1253948	1253953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890840
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27836	NC_003063	CCGAA	2	10	1254601	1254610	40 %	0 %	20 %	40 %	15890840
27837	NC_003063	CGC	2	6	1254611	1254616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890840
27838	NC_003063	CG	3	6	1254662	1254667	0 %	0 %	50 %	50 %	15890840
27839	NC_003063	CCT	2	6	1254706	1254711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15890840
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27842	NC_003063	CGC	2	6	1254784	1254789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15890840
27843	NC_003063	ATC	3	9	1254810	1254818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15890840
27844	NC_003063	GGC	2	6	1254819	1254824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890840
27845	NC_003063	ATT	2	6	1254838	1254843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15890840
27846	NC_003063	AGA	2	6	1254928	1254933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15890840
27847	NC_003063	CGG	2	6	1254946	1254951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15890840
27848	NC_003063	GGCCTC	2	12	1255008	1255019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15890840
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27850	NC_003063	TGC	2	6	1255195	1255200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15890840
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