MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	GTC	2	6	78	83	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_001880	CTC	2	6	95	100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957042
3	NC_001880	TC	3	6	99	104	0 %	50 %	0 %	50 %	10957042
4	NC_001880	TACA	2	8	114	121	50 %	25 %	0 %	25 %	10957042
5	NC_001880	CCG	2	6	167	172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957042
6	NC_001880	TTA	2	6	249	254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957042
7	NC_001880	CA	3	6	274	279	50 %	0 %	0 %	50 %	10957042
8	NC_001880	GA	3	6	284	289	50 %	0 %	50 %	0 %	10957042
9	NC_001880	T	6	6	318	323	0 %	100 %	0 %	0 %	10957042
10	NC_001880	AT	3	6	448	453	50 %	50 %	0 %	0 %	10957042
11	NC_001880	CTT	2	6	495	500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_001880	AT	3	6	513	518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001880	AAG	2	6	533	538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001880	CTT	2	6	556	561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_001880	AT	3	6	580	585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001880	AGA	2	6	609	614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001880	AT	3	6	646	651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001880	CAC	2	6	769	774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_001880	ATA	2	6	785	790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001880	TCA	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_001880	GTT	2	6	821	826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001880	A	7	7	931	937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001880	GAA	2	6	941	946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001880	AGA	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001880	AGA	2	6	997	1002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001880	GAAAA	2	10	1031	1040	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001880	A	6	6	1069	1074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001880	CAA	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_001880	TAG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957043
30	NC_001880	TGA	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957043
31	NC_001880	AAG	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957043
32	NC_001880	TCT	2	6	1259	1264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957043
33	NC_001880	TTA	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957043
34	NC_001880	TAT	2	6	1293	1298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957043
35	NC_001880	AAAG	2	8	1319	1326	75 %	0 %	25 %	0 %	10957043
36	NC_001880	A	6	6	1466	1471	100 %	0 %	0 %	0 %	10957043
37	NC_001880	GA	3	6	1554	1559	50 %	0 %	50 %	0 %	10957043
38	NC_001880	A	7	7	1653	1659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001880	AAATA	2	10	1675	1684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001880	TTA	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001880	TTC	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957044
42	NC_001880	CAAA	2	8	1754	1761	75 %	0 %	0 %	25 %	10957044
43	NC_001880	A	6	6	1764	1769	100 %	0 %	0 %	0 %	10957044
44	NC_001880	A	6	6	1834	1839	100 %	0 %	0 %	0 %	10957044
45	NC_001880	TAG	2	6	1856	1861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957044
46	NC_001880	AGAA	3	12	1877	1888	75 %	0 %	25 %	0 %	10957044
47	NC_001880	AGGA	2	8	1893	1900	50 %	0 %	50 %	0 %	10957044
48	NC_001880	CA	3	6	1944	1949	50 %	0 %	0 %	50 %	10957044
49	NC_001880	AAG	2	6	2001	2006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957044
50	NC_001880	A	6	6	2058	2063	100 %	0 %	0 %	0 %	10957044
51	NC_001880	GAA	2	6	2071	2076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957044
52	NC_001880	CTC	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957044
53	NC_001880	TAG	2	6	2150	2155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957044
54	NC_001880	GAC	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957044
55	NC_001880	AAAG	2	8	2224	2231	75 %	0 %	25 %	0 %	10957044
56	NC_001880	GAA	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001880	TAA	2	6	2321	2326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957045
58	NC_001880	TAC	2	6	2341	2346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957045
59	NC_001880	AGA	2	6	2381	2386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
60	NC_001880	A	7	7	2388	2394	100 %	0 %	0 %	0 %	10957045
61	NC_001880	TAA	2	6	2405	2410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957045
62	NC_001880	A	6	6	2471	2476	100 %	0 %	0 %	0 %	10957045
63	NC_001880	AAGC	2	8	2481	2488	50 %	0 %	25 %	25 %	10957045
64	NC_001880	GAG	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957045
65	NC_001880	GAA	2	6	2565	2570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
66	NC_001880	AGGA	2	8	2583	2590	50 %	0 %	50 %	0 %	10957045
67	NC_001880	A	6	6	2623	2628	100 %	0 %	0 %	0 %	10957045
68	NC_001880	GAAA	2	8	2667	2674	75 %	0 %	25 %	0 %	10957045
69	NC_001880	TAG	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957045
70	NC_001880	AGGAA	2	10	2752	2761	60 %	0 %	40 %	0 %	10957045
71	NC_001880	AAG	2	6	2767	2772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
72	NC_001880	GA	3	6	2815	2820	50 %	0 %	50 %	0 %	10957045
73	NC_001880	AGA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
74	NC_001880	AAG	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
75	NC_001880	GA	3	6	2912	2917	50 %	0 %	50 %	0 %	10957045
76	NC_001880	TC	3	6	2921	2926	0 %	50 %	0 %	50 %	10957045
77	NC_001880	GTT	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957045
78	NC_001880	AAG	2	6	2956	2961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957045
79	NC_001880	TCAA	2	8	2999	3006	50 %	25 %	0 %	25 %	10957045
80	NC_001880	CTTT	2	8	3009	3016	0 %	75 %	0 %	25 %	10957045
81	NC_001880	GCCC	2	8	3049	3056	0 %	0 %	25 %	75 %	10957045
82	NC_001880	CAA	2	6	3128	3133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957045
83	NC_001880	TTC	2	6	3150	3155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957045
84	NC_001880	TCA	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_001880	TTC	2	6	3329	3334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_001880	AGA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001880	AAG	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001880	A	7	7	3505	3511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001880	A	7	7	3552	3558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001880	A	7	7	3589	3595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001880	CTC	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_001880	TA	3	6	3715	3720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001880	GAAA	2	8	3764	3771	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001880	TTG	2	6	3795	3800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001880	AAG	2	6	3829	3834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001880	T	7	7	3985	3991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001880	TA	3	6	4031	4036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001880	GAC	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957046
99	NC_001880	GAA	3	9	4188	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
100	NC_001880	TCT	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957046
101	NC_001880	GGAA	2	8	4295	4302	50 %	0 %	50 %	0 %	10957046
102	NC_001880	CAA	2	6	4318	4323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957046
103	NC_001880	AAG	2	6	4340	4345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
104	NC_001880	AAG	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
105	NC_001880	AG	3	6	4413	4418	50 %	0 %	50 %	0 %	10957046
106	NC_001880	AAG	2	6	4517	4522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
107	NC_001880	GAAA	2	8	4575	4582	75 %	0 %	25 %	0 %	10957046
108	NC_001880	AGA	2	6	4587	4592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
109	NC_001880	AAG	2	6	4618	4623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
110	NC_001880	ATA	2	6	4636	4641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957046
111	NC_001880	A	6	6	4686	4691	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
112	NC_001880	TTTCC	2	10	4698	4707	0 %	60 %	0 %	40 %	10957046
113	NC_001880	GAA	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
114	NC_001880	GAA	2	6	4762	4767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
115	NC_001880	GA	3	6	4773	4778	50 %	0 %	50 %	0 %	10957046
116	NC_001880	CTT	2	6	4780	4785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957046
117	NC_001880	A	6	6	4799	4804	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
118	NC_001880	GAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
119	NC_001880	A	6	6	4838	4843	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
120	NC_001880	AGTGG	2	10	4863	4872	20 %	20 %	60 %	0 %	10957046
121	NC_001880	AAG	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957046
122	NC_001880	A	6	6	4946	4951	100 %	0 %	0 %	0 %	10957046
123	NC_001880	GAAG	2	8	4986	4993	50 %	0 %	50 %	0 %	10957046
124	NC_001880	TTG	2	6	5030	5035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957046
125	NC_001880	ACT	2	6	5036	5041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957046
126	NC_001880	A	9	9	5089	5097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001880	GAC	2	6	5127	5132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_001880	A	6	6	5137	5142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001880	GAA	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001880	GAA	2	6	5323	5328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001880	GAA	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001880	CT	3	6	5380	5385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_001880	TTAT	3	12	5406	5417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001880	GAA	3	9	5422	5430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001880	A	7	7	5446	5452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001880	AAAGG	2	10	5486	5495	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001880	TAA	2	6	5530	5535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001880	TGG	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001880	ATA	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001880	ATT	2	6	5678	5683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001880	AGG	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_001880	TCT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_001880	TA	3	6	5763	5768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001880	AAG	2	6	5808	5813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001880	AAT	2	6	5873	5878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957047
146	NC_001880	TCT	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957047
147	NC_001880	ATT	2	6	5974	5979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957047
148	NC_001880	TCT	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957047
149	NC_001880	AAG	2	6	6079	6084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957047
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152	NC_001880	TAC	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957047
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162	NC_001880	TAC	2	6	6865	6870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_001880	AGAA	2	8	7172	7179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_001880	AAG	2	6	7274	7279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_001880	GTT	2	6	7311	7316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_001880	TTG	2	6	7352	7357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_001880	GAAG	2	8	8001	8008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_001880	AGT	2	6	8191	8196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_001880	TAT	2	6	8441	8446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_001880	AT	4	8	8499	8506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_001880	TGT	2	6	8507	8512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_001880	CCT	2	6	11605	11610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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268	NC_001880	CAACA	2	10	12650	12659	60 %	0 %	0 %	40 %	10957052
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272	NC_001880	TAA	2	6	12886	12891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_001880	AAG	2	6	12934	12939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_001880	TTCTG	2	10	13000	13009	0 %	60 %	20 %	20 %	10957053
275	NC_001880	ATC	2	6	13095	13100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957053
276	NC_001880	CTT	2	6	13133	13138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957053
277	NC_001880	TAAA	2	8	13164	13171	75 %	25 %	0 %	0 %	10957053
278	NC_001880	AAC	2	6	13188	13193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957053
279	NC_001880	TGAGA	2	10	13264	13273	40 %	20 %	40 %	0 %	10957053
280	NC_001880	TGC	2	6	13286	13291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957053
281	NC_001880	CCT	2	6	13303	13308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957053
282	NC_001880	TTG	2	6	13340	13345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957053
283	NC_001880	TCCT	2	8	13370	13377	0 %	50 %	0 %	50 %	10957053
284	NC_001880	CCT	2	6	13477	13482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957053
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286	NC_001880	TGT	2	6	13770	13775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_001880	TATC	2	8	13817	13824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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292	NC_001880	TGT	2	6	14068	14073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_001880	TAT	2	6	20313	20318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_001880	TCT	2	6	20345	20350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_001880	AAG	2	6	20611	20616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
454	NC_001880	CTT	2	6	20717	20722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_001880	AAG	2	6	20771	20776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_001880	TTA	2	6	20799	20804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_001880	TCC	2	6	21178	21183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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471	NC_001880	TGTT	2	8	21427	21434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_001880	TTTC	2	8	21533	21540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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