MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 37127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36007	NC_000854	TAG	2	6	1615393	1615398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36013	NC_000854	GCTG	2	8	1615631	1615638	0 %	25 %	50 %	25 %	118431919
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36118	NC_000854	GGA	2	6	1621133	1621138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602139
36119	NC_000854	CGT	2	6	1621157	1621162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602139
36120	NC_000854	CGGCG	2	10	1621188	1621197	0 %	0 %	60 %	40 %	14602139
36121	NC_000854	TCT	2	6	1621223	1621228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14602139
36122	NC_000854	TGC	2	6	1621286	1621291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602139
36123	NC_000854	CA	3	6	1621299	1621304	50 %	0 %	0 %	50 %	14602139
36124	NC_000854	ACA	2	6	1621309	1621314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14602139
36125	NC_000854	CTC	2	6	1621323	1621328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602139
36126	NC_000854	AGGT	2	8	1621398	1621405	25 %	25 %	50 %	0 %	14602139
36127	NC_000854	CAAGGC	2	12	1621454	1621465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602139
36128	NC_000854	GGGT	2	8	1621471	1621478	0 %	25 %	75 %	0 %	14602139
36129	NC_000854	CTC	2	6	1621488	1621493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602139
36130	NC_000854	CCTG	2	8	1621503	1621510	0 %	25 %	25 %	50 %	14602139
36131	NC_000854	GCT	2	6	1621593	1621598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602139
36132	NC_000854	TGC	2	6	1621635	1621640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602139
36133	NC_000854	GTAG	2	8	1621759	1621766	25 %	25 %	50 %	0 %	14602139
36134	NC_000854	AT	3	6	1621785	1621790	50 %	50 %	0 %	0 %	14602139
36135	NC_000854	TGA	2	6	1621838	1621843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14602139
36136	NC_000854	GAGAG	2	10	1621954	1621963	40 %	0 %	60 %	0 %	14602139
36137	NC_000854	CTC	2	6	1621974	1621979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602139
36138	NC_000854	AGG	2	6	1622004	1622009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602139
36139	NC_000854	CGG	2	6	1622027	1622032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602139
36140	NC_000854	CT	3	6	1622080	1622085	0 %	50 %	0 %	50 %	14602140
36141	NC_000854	ACG	2	6	1622175	1622180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602140
36142	NC_000854	GCTG	2	8	1622322	1622329	0 %	25 %	50 %	25 %	14602140
36143	NC_000854	GAG	2	6	1622345	1622350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602140
36144	NC_000854	GCC	2	6	1622428	1622433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14602140
36145	NC_000854	CTC	2	6	1622438	1622443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602140
36146	NC_000854	GGAG	2	8	1622487	1622494	25 %	0 %	75 %	0 %	14602140
36147	NC_000854	TA	3	6	1622576	1622581	50 %	50 %	0 %	0 %	14602140
36148	NC_000854	CCT	2	6	1622605	1622610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602140
36149	NC_000854	GT	3	6	1622663	1622668	0 %	50 %	50 %	0 %	14602140
36150	NC_000854	CGT	2	6	1622686	1622691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602140
36151	NC_000854	TCA	2	6	1622838	1622843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36152	NC_000854	CCT	2	6	1622853	1622858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36153	NC_000854	GCT	2	6	1622944	1622949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36154	NC_000854	GA	3	6	1622967	1622972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36155	NC_000854	TCC	2	6	1623010	1623015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602141
36156	NC_000854	CCT	2	6	1623091	1623096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602141
36157	NC_000854	AGC	2	6	1623113	1623118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602141
36158	NC_000854	AGC	2	6	1623148	1623153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602141
36159	NC_000854	CTG	3	9	1623280	1623288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602141
36160	NC_000854	GCG	2	6	1623297	1623302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602141
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36167	NC_000854	GA	3	6	1623694	1623699	50 %	0 %	50 %	0 %	14602141
36168	NC_000854	AGG	2	6	1623717	1623722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602141
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36170	NC_000854	GCCT	2	8	1623763	1623770	0 %	25 %	25 %	50 %	14602141
36171	NC_000854	AG	3	6	1623818	1623823	50 %	0 %	50 %	0 %	14602141
36172	NC_000854	AGG	2	6	1623852	1623857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602141
36173	NC_000854	TGA	2	6	1623860	1623865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14602141
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36176	NC_000854	TGC	2	6	1623932	1623937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602141
36177	NC_000854	AG	3	6	1623960	1623965	50 %	0 %	50 %	0 %	14602141
36178	NC_000854	CTG	2	6	1623981	1623986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602141
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36182	NC_000854	TTCT	2	8	1624305	1624312	0 %	75 %	0 %	25 %	118431922
36183	NC_000854	TGT	2	6	1624328	1624333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431922
36184	NC_000854	GAG	2	6	1624338	1624343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431922
36185	NC_000854	TGGT	2	8	1624360	1624367	0 %	50 %	50 %	0 %	118431922
36186	NC_000854	TGT	2	6	1624409	1624414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431922
36187	NC_000854	C	6	6	1624462	1624467	0 %	0 %	0 %	100 %	118431922
36188	NC_000854	CCGGCG	2	12	1624470	1624481	0 %	0 %	50 %	50 %	118431922
36189	NC_000854	AG	3	6	1624490	1624495	50 %	0 %	50 %	0 %	118431922
36190	NC_000854	CGG	2	6	1624501	1624506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431922
36191	NC_000854	CCTA	2	8	1624512	1624519	25 %	25 %	0 %	50 %	118431922
36192	NC_000854	TAC	2	6	1624689	1624694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431922
36193	NC_000854	GGC	2	6	1624704	1624709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431922
36194	NC_000854	GTT	2	6	1624838	1624843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431922
36195	NC_000854	ACG	2	6	1624846	1624851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431922
36196	NC_000854	TTG	2	6	1624879	1624884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431922
36197	NC_000854	GA	3	6	1624956	1624961	50 %	0 %	50 %	0 %	118431922
36198	NC_000854	CAC	2	6	1625015	1625020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431922
36199	NC_000854	TCG	2	6	1625023	1625028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431922
36200	NC_000854	GGC	2	6	1625171	1625176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431922
36201	NC_000854	GAG	2	6	1625186	1625191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431922
36202	NC_000854	GA	4	8	1625265	1625272	50 %	0 %	50 %	0 %	118431922
36203	NC_000854	TG	3	6	1625329	1625334	0 %	50 %	50 %	0 %	118431922
36204	NC_000854	ACA	2	6	1625381	1625386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14602143
36205	NC_000854	ATG	2	6	1625435	1625440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14602143
36206	NC_000854	AGG	2	6	1625461	1625466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602143
36207	NC_000854	CCA	2	6	1625595	1625600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14602143
36208	NC_000854	ATC	2	6	1625602	1625607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14602143
36209	NC_000854	AG	3	6	1625631	1625636	50 %	0 %	50 %	0 %	14602143
36210	NC_000854	GAC	2	6	1625791	1625796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602143
36211	NC_000854	C	6	6	1625870	1625875	0 %	0 %	0 %	100 %	14602143
36212	NC_000854	A	6	6	1625957	1625962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36213	NC_000854	GGA	2	6	1626000	1626005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36214	NC_000854	CTTT	2	8	1626127	1626134	0 %	75 %	0 %	25 %	118431923
36215	NC_000854	TCGTC	2	10	1626139	1626148	0 %	40 %	20 %	40 %	118431923
36216	NC_000854	TGC	2	6	1626203	1626208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431923
36217	NC_000854	CGT	2	6	1626224	1626229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431923
36218	NC_000854	ACC	2	6	1626291	1626296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431923
36219	NC_000854	CCTT	2	8	1626369	1626376	0 %	50 %	0 %	50 %	118431923
36220	NC_000854	TCC	2	6	1626384	1626389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431923
36221	NC_000854	ACG	2	6	1626435	1626440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431923
36222	NC_000854	TACC	2	8	1626477	1626484	25 %	25 %	0 %	50 %	118431923
36223	NC_000854	CCTT	2	8	1626508	1626515	0 %	50 %	0 %	50 %	118431923
36224	NC_000854	CGG	2	6	1626533	1626538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431923
36225	NC_000854	CTG	2	6	1626553	1626558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431923
36226	NC_000854	TCC	2	6	1626622	1626627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431923
36227	NC_000854	CAA	2	6	1626652	1626657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431923
36228	NC_000854	TCC	2	6	1626663	1626668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431923
36229	NC_000854	GGGC	2	8	1626685	1626692	0 %	0 %	75 %	25 %	118431923
36230	NC_000854	ATG	2	6	1626696	1626701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431923
36231	NC_000854	CTC	2	6	1626709	1626714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431923
36232	NC_000854	CTT	2	6	1626809	1626814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431923
36233	NC_000854	TCG	2	6	1626870	1626875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431923
36234	NC_000854	TCAACC	2	12	1626909	1626920	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118431923
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36236	NC_000854	CTT	2	6	1627012	1627017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431923
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36355	NC_000854	AGGGTC	2	12	1633310	1633321	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431927
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36470	NC_000854	ATC	2	6	1639302	1639307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431929
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