MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 37127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_000854	AGG	2	6	628454	628459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601103
14003	NC_000854	AAC	2	6	628483	628488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14601103
14004	NC_000854	CCT	2	6	628497	628502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14601103
14005	NC_000854	TTG	2	6	628508	628513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14601103
14006	NC_000854	G	6	6	628655	628660	0 %	0 %	100 %	0 %	14601103
14007	NC_000854	AGT	2	6	628667	628672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14601103
14008	NC_000854	CT	3	6	628732	628737	0 %	50 %	0 %	50 %	14601103
14009	NC_000854	CTT	2	6	628744	628749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14601103
14010	NC_000854	CCT	2	6	628752	628757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14601103
14011	NC_000854	TCG	2	6	628772	628777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601103
14012	NC_000854	CCG	2	6	628829	628834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601103
14013	NC_000854	ATC	2	6	628883	628888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14601103
14014	NC_000854	CTT	2	6	628894	628899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14601103
14015	NC_000854	TTG	2	6	629009	629014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14601103
14016	NC_000854	GCC	2	6	629027	629032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601103
14017	NC_000854	C	6	6	629040	629045	0 %	0 %	0 %	100 %	14601103
14018	NC_000854	TCT	2	6	629046	629051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14601103
14019	NC_000854	CAG	2	6	629061	629066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14601103
14020	NC_000854	CG	3	6	629128	629133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14021	NC_000854	C	6	6	629142	629147	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14022	NC_000854	CCTG	2	8	629183	629190	0 %	25 %	25 %	50 %	118431274
14023	NC_000854	CTG	2	6	629213	629218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431274
14024	NC_000854	CCT	2	6	629222	629227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431274
14025	NC_000854	ATG	2	6	629238	629243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431274
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14030	NC_000854	GTC	2	6	629390	629395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431274
14031	NC_000854	CCT	2	6	629398	629403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431274
14032	NC_000854	CCT	2	6	629423	629428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431274
14033	NC_000854	GGCA	2	8	629468	629475	25 %	0 %	50 %	25 %	118431274
14034	NC_000854	TGT	2	6	629482	629487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431274
14035	NC_000854	CTT	2	6	629717	629722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431274
14036	NC_000854	CGT	2	6	629755	629760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431274
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14040	NC_000854	CTC	2	6	629894	629899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431274
14041	NC_000854	ATA	2	6	629946	629951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431274
14042	NC_000854	GT	3	6	630043	630048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_000854	GTC	2	6	630082	630087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_000854	CTC	2	6	630172	630177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431275
14045	NC_000854	TAG	2	6	630210	630215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431275
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14051	NC_000854	GGA	2	6	630494	630499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431275
14052	NC_000854	TCA	2	6	630505	630510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431275
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14055	NC_000854	GTA	2	6	630729	630734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431275
14056	NC_000854	ACG	2	6	630781	630786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431275
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14058	NC_000854	ACA	2	6	630826	630831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431275
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14060	NC_000854	CT	3	6	630925	630930	0 %	50 %	0 %	50 %	118431275
14061	NC_000854	TGT	2	6	631010	631015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431275
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14063	NC_000854	TA	4	8	631103	631110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_000854	GAG	3	9	631211	631219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_000854	GAA	2	6	631238	631243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_000854	GAG	2	6	631244	631249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_000854	AGG	2	6	631263	631268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_000854	CGA	2	6	631276	631281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_000854	GAA	2	6	631304	631309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_000854	GAG	2	6	631310	631315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_000854	GAG	3	9	631322	631330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_000854	GAG	2	6	631334	631339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_000854	AGG	2	6	631344	631349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_000854	AGCCT	2	10	631374	631383	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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14076	NC_000854	GAG	2	6	631474	631479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_000854	CTG	2	6	631582	631587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431276
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14079	NC_000854	CGGC	2	8	631637	631644	0 %	0 %	50 %	50 %	118431276
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14082	NC_000854	CTT	2	6	631785	631790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431276
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14087	NC_000854	C	6	6	631900	631905	0 %	0 %	0 %	100 %	118431276
14088	NC_000854	CGC	2	6	631935	631940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431276
14089	NC_000854	AGCAGG	2	12	631987	631998	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118431276
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14092	NC_000854	CGT	2	6	632094	632099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431276
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14095	NC_000854	CT	3	6	632174	632179	0 %	50 %	0 %	50 %	118431276
14096	NC_000854	CGC	2	6	632190	632195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431276
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14100	NC_000854	GCG	2	6	632359	632364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431276
14101	NC_000854	TGTC	2	8	632369	632376	0 %	50 %	25 %	25 %	118431276
14102	NC_000854	GCC	2	6	632421	632426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14103	NC_000854	TGC	3	9	632453	632461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431277
14104	NC_000854	ATG	3	9	632466	632474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431277
14105	NC_000854	TAT	2	6	632498	632503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431277
14106	NC_000854	CAG	2	6	632524	632529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431277
14107	NC_000854	TCC	2	6	632562	632567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431277
14108	NC_000854	GCCT	2	8	632570	632577	0 %	25 %	25 %	50 %	118431277
14109	NC_000854	TCC	2	6	632604	632609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431277
14110	NC_000854	GGT	2	6	632663	632668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431277
14111	NC_000854	TGT	2	6	632681	632686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431277
14112	NC_000854	GTG	2	6	632707	632712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431277
14113	NC_000854	TGG	2	6	632713	632718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431277
14114	NC_000854	TTG	2	6	632719	632724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431277
14115	NC_000854	G	6	6	632728	632733	0 %	0 %	100 %	0 %	118431277
14116	NC_000854	ACT	2	6	632754	632759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431277
14117	NC_000854	CCT	2	6	632872	632877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431277
14118	NC_000854	CCT	2	6	632905	632910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431277
14119	NC_000854	TAC	2	6	632981	632986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431277
14120	NC_000854	GCG	3	9	633004	633012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431277
14121	NC_000854	CT	3	6	633054	633059	0 %	50 %	0 %	50 %	118431277
14122	NC_000854	GTA	2	6	633083	633088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431277
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14243	NC_000854	CAC	2	6	638439	638444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431280
14244	NC_000854	GA	3	6	638469	638474	50 %	0 %	50 %	0 %	118431280
14245	NC_000854	G	7	7	638484	638490	0 %	0 %	100 %	0 %	118431280
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14248	NC_000854	TGGC	2	8	638583	638590	0 %	25 %	50 %	25 %	118431280
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14347	NC_000854	GCA	2	6	642850	642855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14348	NC_000854	ATGG	2	8	642892	642899	25 %	25 %	50 %	0 %	118431287
14349	NC_000854	GCC	2	6	642926	642931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431287
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14355	NC_000854	CT	3	6	643178	643183	0 %	50 %	0 %	50 %	118431287
14356	NC_000854	CGC	2	6	643192	643197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431287
14357	NC_000854	C	6	6	643200	643205	0 %	0 %	0 %	100 %	118431287
14358	NC_000854	C	6	6	643223	643228	0 %	0 %	0 %	100 %	118431287
14359	NC_000854	GAG	2	6	643234	643239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431287
14360	NC_000854	AC	3	6	643268	643273	50 %	0 %	0 %	50 %	118431287
14361	NC_000854	TCC	2	6	643274	643279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431287
14362	NC_000854	CGG	2	6	643302	643307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431287
14363	NC_000854	AGG	2	6	643333	643338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431287
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14485	NC_000854	GAGGCT	2	12	648813	648824	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118431291
14486	NC_000854	GAG	2	6	648836	648841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431291
14487	NC_000854	CTG	2	6	648849	648854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431291
14488	NC_000854	GAG	2	6	648861	648866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431291
14489	NC_000854	GT	3	6	648894	648899	0 %	50 %	50 %	0 %	118431291
14490	NC_000854	ACC	2	6	648913	648918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14601122
14491	NC_000854	GGA	2	6	648948	648953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601122
14492	NC_000854	CTGGG	2	10	649072	649081	0 %	20 %	60 %	20 %	14601122
14493	NC_000854	GGC	2	6	649116	649121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601122
14494	NC_000854	ACGAGG	2	12	649184	649195	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	14601122
14495	NC_000854	GGA	2	6	649206	649211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601122
14496	NC_000854	GGC	2	6	649215	649220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601122
14497	NC_000854	AGGG	2	8	649273	649280	25 %	0 %	75 %	0 %	14601122
14498	NC_000854	TA	3	6	649363	649368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14499	NC_000854	CAT	2	6	649428	649433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14500	NC_000854	GGA	2	6	649444	649449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431292

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