MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 37127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12005	NC_000854	TGC	2	6	540309	540314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431209
12006	NC_000854	AGCG	2	8	540424	540431	25 %	0 %	50 %	25 %	118431209
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12013	NC_000854	CTC	2	6	540645	540650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12014	NC_000854	CTC	2	6	540669	540674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12015	NC_000854	A	6	6	540709	540714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_000854	CCA	2	6	540752	540757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12017	NC_000854	GCCC	2	8	540795	540802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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12019	NC_000854	GGA	2	6	540885	540890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12079	NC_000854	CT	3	6	543679	543684	0 %	50 %	0 %	50 %	118431212
12080	NC_000854	CT	3	6	543704	543709	0 %	50 %	0 %	50 %	118431212
12081	NC_000854	GGTCTG	2	12	543718	543729	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118431212
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12093	NC_000854	GGTG	2	8	544424	544431	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12094	NC_000854	TGGG	2	8	544436	544443	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12095	NC_000854	ACA	2	6	544498	544503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12096	NC_000854	CTGT	2	8	544636	544643	0 %	50 %	25 %	25 %	118431214
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12099	NC_000854	TATGC	2	10	544755	544764	20 %	40 %	20 %	20 %	118431214
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12109	NC_000854	CGG	2	6	545202	545207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600993
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12116	NC_000854	GCCA	2	8	545571	545578	25 %	0 %	25 %	50 %	14600993
12117	NC_000854	GGA	2	6	545583	545588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600993
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12119	NC_000854	CGG	2	6	545600	545605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600993
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12122	NC_000854	AAGGC	2	10	545677	545686	40 %	0 %	40 %	20 %	14600993
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12249	NC_000854	GGA	2	6	550942	550947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601001
12250	NC_000854	GGC	2	6	550975	550980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601001
12251	NC_000854	AGA	2	6	550995	551000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14601001
12252	NC_000854	GGC	2	6	551019	551024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601001
12253	NC_000854	CGG	3	9	551113	551121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601001
12254	NC_000854	CCA	2	6	551194	551199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14601001
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12261	NC_000854	CGC	2	6	551521	551526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431218
12262	NC_000854	GCC	2	6	551569	551574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431218
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12277	NC_000854	G	6	6	552204	552209	0 %	0 %	100 %	0 %	118431219
12278	NC_000854	TTC	2	6	552219	552224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431219
12279	NC_000854	CTG	2	6	552321	552326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431219
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12281	NC_000854	AGA	2	6	552442	552447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431219
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12283	NC_000854	GGA	2	6	552466	552471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431219
12284	NC_000854	ACG	2	6	552484	552489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431219
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12287	NC_000854	TGG	2	6	552692	552697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12288	NC_000854	GTT	2	6	552736	552741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12289	NC_000854	CTC	2	6	552767	552772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12290	NC_000854	GCT	2	6	552833	552838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601005
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12292	NC_000854	GAA	2	6	552941	552946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14601005
12293	NC_000854	GCT	2	6	552959	552964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601005
12294	NC_000854	GTG	2	6	552979	552984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14601005
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12299	NC_000854	GGT	2	6	553145	553150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14601005
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12303	NC_000854	CTC	2	6	553205	553210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14601005
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12306	NC_000854	GGCGG	2	10	553304	553313	0 %	0 %	80 %	20 %	14601005
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12315	NC_000854	CAGC	2	8	553794	553801	25 %	0 %	25 %	50 %	14601006
12316	NC_000854	GAG	2	6	553811	553816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601006
12317	NC_000854	GAG	3	9	553822	553830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601006
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12319	NC_000854	GAC	2	6	553898	553903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14601006
12320	NC_000854	TGGA	2	8	553931	553938	25 %	25 %	50 %	0 %	14601006
12321	NC_000854	GGA	2	6	554026	554031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601006
12322	NC_000854	GGC	2	6	554038	554043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601006
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12325	NC_000854	AAG	2	6	554147	554152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14601006
12326	NC_000854	CAG	2	6	554176	554181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14601006
12327	NC_000854	GTG	2	6	554218	554223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12328	NC_000854	CGT	2	6	554240	554245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601009
12329	NC_000854	CGG	2	6	554257	554262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601009
12330	NC_000854	GGCT	2	8	554269	554276	0 %	25 %	50 %	25 %	14601009
12331	NC_000854	CTC	2	6	554284	554289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14601009
12332	NC_000854	G	6	6	554424	554429	0 %	0 %	100 %	0 %	14601009
12333	NC_000854	TTG	2	6	554430	554435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14601009
12334	NC_000854	AGG	3	9	554444	554452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601009
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12336	NC_000854	GGAG	2	8	554577	554584	25 %	0 %	75 %	0 %	14601009
12337	NC_000854	GCC	2	6	554771	554776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601009
12338	NC_000854	GGC	2	6	554797	554802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601009
12339	NC_000854	GCT	2	6	554905	554910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601009
12340	NC_000854	AGG	2	6	554936	554941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601009
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12342	NC_000854	GCT	2	6	554977	554982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601009
12343	NC_000854	GAG	2	6	554990	554995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601009
12344	NC_000854	GCTG	2	8	555009	555016	0 %	25 %	50 %	25 %	14601009
12345	NC_000854	GGTACC	2	12	555024	555035	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	14601009
12346	NC_000854	GCT	2	6	555040	555045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601009
12347	NC_000854	TCC	2	6	555075	555080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14601009
12348	NC_000854	GTT	2	6	555097	555102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14601009
12349	NC_000854	GCC	2	6	555118	555123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601009
12350	NC_000854	CCG	2	6	555159	555164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601009
12351	NC_000854	GCC	2	6	555194	555199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601009
12352	NC_000854	GTG	2	6	555228	555233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14601009
12353	NC_000854	CTG	2	6	555246	555251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601009
12354	NC_000854	CT	3	6	555283	555288	0 %	50 %	0 %	50 %	14601009
12355	NC_000854	CGG	2	6	555345	555350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601009
12356	NC_000854	AGG	2	6	555431	555436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14601009
12357	NC_000854	GGC	2	6	555470	555475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601009
12358	NC_000854	CCT	2	6	555503	555508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12359	NC_000854	G	7	7	555512	555518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12360	NC_000854	GCT	2	6	555524	555529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431220
12361	NC_000854	GTT	2	6	555539	555544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431220
12362	NC_000854	TTC	2	6	555557	555562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431220
12363	NC_000854	GTGGG	2	10	555587	555596	0 %	20 %	80 %	0 %	118431220
12364	NC_000854	GT	3	6	555615	555620	0 %	50 %	50 %	0 %	118431220
12365	NC_000854	GCA	2	6	555622	555627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431220
12366	NC_000854	GCC	2	6	555661	555666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431220
12367	NC_000854	GAA	2	6	555676	555681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431220
12368	NC_000854	GGT	2	6	555733	555738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431220
12369	NC_000854	TGC	2	6	555741	555746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431220
12370	NC_000854	GTG	2	6	555755	555760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431220
12371	NC_000854	ATA	2	6	555764	555769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431220
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12389	NC_000854	GGA	2	6	556582	556587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431221
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12402	NC_000854	ACCT	2	8	557534	557541	25 %	25 %	0 %	50 %	118431221
12403	NC_000854	GCC	2	6	557558	557563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431221
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12428	NC_000854	G	6	6	558625	558630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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12455	NC_000854	GTG	2	6	559662	559667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12485	NC_000854	GCTG	2	8	561097	561104	0 %	25 %	50 %	25 %	118431225
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12487	NC_000854	GGT	2	6	561195	561200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431225
12488	NC_000854	CTC	2	6	561217	561222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431225
12489	NC_000854	GGC	2	6	561232	561237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431225
12490	NC_000854	GCG	2	6	561271	561276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431226
12491	NC_000854	CGC	2	6	561380	561385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431226
12492	NC_000854	TGT	2	6	561401	561406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431226
12493	NC_000854	GGGCG	2	10	561422	561431	0 %	0 %	80 %	20 %	118431226
12494	NC_000854	GGC	2	6	561468	561473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431226
12495	NC_000854	GCG	2	6	561477	561482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431226
12496	NC_000854	CGC	2	6	561539	561544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14601023
12497	NC_000854	CTG	2	6	561552	561557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14601023
12498	NC_000854	GTG	2	6	561564	561569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14601023
12499	NC_000854	CT	4	8	561570	561577	0 %	50 %	0 %	50 %	14601023
12500	NC_000854	GGC	2	6	561578	561583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14601023

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