MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 37127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_000854	CGG	2	6	448800	448805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10003	NC_000854	ATG	2	6	448885	448890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_000854	GGT	2	6	448931	448936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_000854	CT	3	6	448947	448952	0 %	50 %	0 %	50 %	118431145
10006	NC_000854	CTT	2	6	448980	448985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431145
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10010	NC_000854	CT	3	6	449050	449055	0 %	50 %	0 %	50 %	118431145
10011	NC_000854	TGC	2	6	449207	449212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431145
10012	NC_000854	CCT	2	6	449267	449272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431145
10013	NC_000854	TCC	2	6	449278	449283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431145
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10025	NC_000854	TAA	2	6	449912	449917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_000854	CGG	2	6	449932	449937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_000854	TGC	3	9	450011	450019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431146
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10030	NC_000854	CGC	2	6	450116	450121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431146
10031	NC_000854	CTG	2	6	450163	450168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431146
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10034	NC_000854	CCGAGG	2	12	450347	450358	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118431146
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10041	NC_000854	GAGG	2	8	450672	450679	25 %	0 %	75 %	0 %	118431146
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10043	NC_000854	AGGCT	2	10	450704	450713	20 %	20 %	40 %	20 %	118431146
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10052	NC_000854	CTG	2	6	451228	451233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431146
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10088	NC_000854	TGC	2	6	453026	453031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431147
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10093	NC_000854	AGGG	2	8	453241	453248	25 %	0 %	75 %	0 %	118431147
10094	NC_000854	GGCT	2	8	453257	453264	0 %	25 %	50 %	25 %	118431147
10095	NC_000854	GCT	2	6	453267	453272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431147
10096	NC_000854	GGCT	2	8	453278	453285	0 %	25 %	50 %	25 %	118431147
10097	NC_000854	C	7	7	453299	453305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10101	NC_000854	CAA	2	6	453452	453457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431148
10102	NC_000854	CTC	2	6	453480	453485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431148
10103	NC_000854	CTC	2	6	453525	453530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431148
10104	NC_000854	C	7	7	453530	453536	0 %	0 %	0 %	100 %	118431148
10105	NC_000854	TG	3	6	453569	453574	0 %	50 %	50 %	0 %	118431148
10106	NC_000854	CCTCC	2	10	453650	453659	0 %	20 %	0 %	80 %	118431148
10107	NC_000854	CAC	2	6	453676	453681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10108	NC_000854	GGA	2	6	453699	453704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_000854	GAC	2	6	453727	453732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_000854	GAG	2	6	453779	453784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_000854	G	6	6	453807	453812	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_000854	CTC	2	6	453857	453862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600884
10113	NC_000854	CCA	2	6	453913	453918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600884
10114	NC_000854	TCC	2	6	453922	453927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600884
10115	NC_000854	GTG	2	6	453955	453960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600884
10116	NC_000854	TG	3	6	453959	453964	0 %	50 %	50 %	0 %	14600884
10117	NC_000854	CTA	2	6	453976	453981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600884
10118	NC_000854	TAT	2	6	453995	454000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600884
10119	NC_000854	CCT	2	6	454013	454018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600884
10120	NC_000854	TCG	2	6	454036	454041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600884
10121	NC_000854	CCT	2	6	454052	454057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600884
10122	NC_000854	CTG	2	6	454069	454074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600884
10123	NC_000854	CCT	2	6	454075	454080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600884
10124	NC_000854	CGCC	2	8	454111	454118	0 %	0 %	25 %	75 %	14600884
10125	NC_000854	CGA	2	6	454120	454125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600884
10126	NC_000854	AGC	2	6	454143	454148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600884
10127	NC_000854	TCCC	2	8	454161	454168	0 %	25 %	0 %	75 %	14600884
10128	NC_000854	CCT	2	6	454188	454193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600884
10129	NC_000854	G	6	6	454210	454215	0 %	0 %	100 %	0 %	14600884
10130	NC_000854	CTA	2	6	454252	454257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600884
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10132	NC_000854	GCG	2	6	454347	454352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600884
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10134	NC_000854	ATC	2	6	454445	454450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600884
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10137	NC_000854	CCT	2	6	454777	454782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431149
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10140	NC_000854	CCT	2	6	454826	454831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431149
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10152	NC_000854	GA	3	6	455213	455218	50 %	0 %	50 %	0 %	118431149
10153	NC_000854	C	7	7	455283	455289	0 %	0 %	0 %	100 %	118431149
10154	NC_000854	CGT	2	6	455353	455358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431149
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10157	NC_000854	TGG	2	6	455651	455656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10158	NC_000854	CCGG	2	8	455658	455665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10159	NC_000854	GGCGC	2	10	455748	455757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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10161	NC_000854	CT	3	6	455887	455892	0 %	50 %	0 %	50 %	118431150
10162	NC_000854	TTC	2	6	455951	455956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431150
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10197	NC_000854	TCG	2	6	457976	457981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600892
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10201	NC_000854	TA	3	6	458077	458082	50 %	50 %	0 %	0 %	14600892
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10203	NC_000854	AGGA	2	8	458179	458186	50 %	0 %	50 %	0 %	14600892
10204	NC_000854	CCG	2	6	458211	458216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600892
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10208	NC_000854	CAG	2	6	458445	458450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600892
10209	NC_000854	G	7	7	458503	458509	0 %	0 %	100 %	0 %	14600892
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10220	NC_000854	TAG	2	6	459016	459021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600893
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10222	NC_000854	ACTTCG	2	12	459216	459227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	14600894
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10224	NC_000854	G	6	6	459339	459344	0 %	0 %	100 %	0 %	14600894
10225	NC_000854	GCA	2	6	459386	459391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600894
10226	NC_000854	CT	4	8	459432	459439	0 %	50 %	0 %	50 %	14600894
10227	NC_000854	AGG	2	6	459446	459451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600894
10228	NC_000854	AGG	2	6	459533	459538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600894
10229	NC_000854	CGC	2	6	459550	459555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600894
10230	NC_000854	GGA	2	6	459571	459576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600894
10231	NC_000854	GGA	2	6	459595	459600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600894
10232	NC_000854	TGGA	2	8	459737	459744	25 %	25 %	50 %	0 %	14600894
10233	NC_000854	ACG	2	6	459767	459772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600894
10234	NC_000854	AGGA	2	8	459821	459828	50 %	0 %	50 %	0 %	14600894
10235	NC_000854	TAG	2	6	459903	459908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600894
10236	NC_000854	CA	3	6	459935	459940	50 %	0 %	0 %	50 %	14600894
10237	NC_000854	TGG	2	6	459963	459968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600894
10238	NC_000854	AGAGG	2	10	460060	460069	40 %	0 %	60 %	0 %	14600894
10239	NC_000854	G	6	6	460086	460091	0 %	0 %	100 %	0 %	14600894
10240	NC_000854	TAA	2	6	460176	460181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600894
10241	NC_000854	TAC	2	6	460262	460267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10243	NC_000854	CAC	2	6	460294	460299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600895
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10486	NC_000854	CAG	2	6	470504	470509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431160
10487	NC_000854	CT	3	6	470603	470608	0 %	50 %	0 %	50 %	118431160
10488	NC_000854	TGC	2	6	470626	470631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431160
10489	NC_000854	GCT	2	6	470647	470652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431160
10490	NC_000854	GTGGGG	2	12	470666	470677	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	118431160
10491	NC_000854	GGC	2	6	470691	470696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431160
10492	NC_000854	AGT	2	6	470725	470730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431160
10493	NC_000854	TAT	2	6	470756	470761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431160
10494	NC_000854	AT	3	6	470796	470801	50 %	50 %	0 %	0 %	118431160
10495	NC_000854	GTGCC	2	10	470859	470868	0 %	20 %	40 %	40 %	118431160
10496	NC_000854	TCA	2	6	470941	470946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431160
10497	NC_000854	TCG	2	6	470968	470973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431160
10498	NC_000854	TGC	2	6	471076	471081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431160
10499	NC_000854	GCCATG	2	12	471102	471113	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118431160
10500	NC_000854	GACAGT	2	12	471146	471157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118431160

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