ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Botryllus schlosseri complete mitochondrial genome

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021463	AATTGT	3	161	179	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	51106071
2	NC_021463	TTA	4	1536	1547	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51106071
3	NC_021463	T	19	1632	1650	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	51106071
4	NC_021463	TTTA	3	1888	1899	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51106071
5	NC_021463	TTTA	3	1942	1954	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	51106071
6	NC_021463	TCTT	4	2198	2213	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	51106071
7	NC_021463	T	14	2217	2230	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51106071
8	NC_021463	T	18	2443	2460	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	51106071
9	NC_021463	T	14	2483	2496	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51106071
10	NC_021463	AGATTT	3	2621	2637	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	51106071
11	NC_021463	T	14	2703	2716	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	51106071
12	NC_021463	ATA	4	3350	3361	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51106071
13	NC_021463	T	15	3641	3655	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	51106071
14	NC_021463	ATT	4	4902	4913	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51106071
15	NC_021463	AATA	3	4919	4930	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51106071
16	NC_021463	T	14	5384	5397	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51106071
17	NC_021463	TATT	3	5455	5466	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	51106071
18	NC_021463	TTTA	3	5531	5542	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51106071
19	NC_021463	T	12	5880	5891	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	51106071
20	NC_021463	T	14	6149	6162	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51106071
21	NC_021463	AT	6	6368	6378	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51106071
22	NC_021463	ATTT	3	7076	7087	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51106071
23	NC_021463	TTTTTA	3	7293	7311	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	51106071
24	NC_021463	T	12	7735	7746	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	51106071
25	NC_021463	T	13	8536	8548	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	51106072
26	NC_021463	TTG	4	8995	9006	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51106072
27	NC_021463	TAA	4	9086	9097	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_021463	T	25	9855	9879	25	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	51106072
29	NC_021463	TAA	4	10062	10072	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51106072
30	NC_021463	T	17	10156	10172	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	51106072
31	NC_021463	ATT	4	10555	10566	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51106072
32	NC_021463	T	13	10609	10621	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	51106072
33	NC_021463	T	13	10636	10648	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51106072
34	NC_021463	TAT	4	10843	10855	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51106072
35	NC_021463	GGTT	3	11041	11051	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	51106072
36	NC_021463	T	17	11169	11185	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	51106072
37	NC_021463	GTAT	3	11419	11430	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	51106072
38	NC_021463	TAT	4	12956	12966	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_021463	TAT	4	12986	12996	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_021463	TAAT	3	13279	13289	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_021463	TTTA	3	13487	13498	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_021463	TTTA	3	14110	14120	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_021463	TA	7	14195	14208	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_021463	TA	6	14822	14832	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51106072

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Botryllus schlosseri complete mitochondrial genome