ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Danaus plexippus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021452	TTTAT	3	126	140	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_021452	AT	13	205	228	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_021452	T	26	304	329	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51134891
4	NC_021452	ATT	4	515	526	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134891
5	NC_021452	T	13	1094	1106	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51134891
6	NC_021452	T	12	1271	1282	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	51134891
7	NC_021452	GAAA	3	2256	2267	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51134891
8	NC_021452	ATT	7	2863	2884	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134891
9	NC_021452	ATT	4	2909	2919	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134891
10	NC_021452	CTCTT	3	3305	3318	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	51134891
11	NC_021452	ATT	4	3321	3331	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134891
12	NC_021452	ATT	4	3870	3881	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_021452	TAA	5	4006	4020	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134891
14	NC_021452	TTTAT	4	4287	4306	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	51134891
15	NC_021452	TTA	4	4877	4887	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134891
16	NC_021452	T	15	5011	5025	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	51134891
17	NC_021452	AT	7	5532	5544	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_021452	TATT	3	5874	5884	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134891
19	NC_021452	CAAA	3	6365	6375	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	51134891
20	NC_021452	TAAA	3	6378	6389	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51134891
21	NC_021452	ATT	4	6592	6604	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134891
22	NC_021452	TTA	4	6768	6779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134891
23	NC_021452	TTA	4	6945	6956	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134891
24	NC_021452	TTA	4	7203	7214	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134891
25	NC_021452	ATA	5	7308	7322	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51134891
26	NC_021452	TAA	4	7342	7353	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	51134891
27	NC_021452	TAAA	3	7546	7556	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134891
28	NC_021452	TAA	4	7746	7758	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134891
29	NC_021452	AT	6	7818	7828	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134891
30	NC_021452	TAA	5	7974	7987	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134891
31	NC_021452	A	21	8014	8034	21	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	51134891
32	NC_021452	TAA	4	8162	8173	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134892
33	NC_021452	ATT	4	8962	8972	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134892
34	NC_021452	TAT	4	8974	8986	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134892
35	NC_021452	AAAT	3	9038	9048	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51134892
36	NC_021452	CAAA	3	9124	9134	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	51134892
37	NC_021452	ATATTA	3	9175	9192	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51134892
38	NC_021452	TTA	4	9226	9237	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134892
39	NC_021452	AAT	4	9447	9458	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134892
40	NC_021452	ATT	4	9620	9631	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134892
41	NC_021452	TA	7	9739	9752	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51134892
42	NC_021452	ATT	5	9860	9874	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_021452	TAT	4	9909	9920	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51134892
44	NC_021452	ATTTT	4	10033	10052	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	51134892
45	NC_021452	TTTA	3	10078	10089	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	51134892
46	NC_021452	AATTT	4	10193	10212	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	51134892
47	NC_021452	TAA	4	10297	10308	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134892
48	NC_021452	TTA	5	10316	10330	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51134892
49	NC_021452	ATTT	4	10334	10349	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	51134892
50	NC_021452	TA	6	10579	10589	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51134892
51	NC_021452	ATT	4	10775	10785	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51134892
52	NC_021452	ATTT	3	10968	10978	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134892
53	NC_021452	ATTT	3	11010	11020	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51134892
54	NC_021452	TATTA	3	11136	11149	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	51134892
55	NC_021452	AATTTT	3	11314	11331	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	51134892
56	NC_021452	ATTA	3	11559	11574	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51134892
57	NC_021452	AAAT	3	11791	11803	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	51134892
58	NC_021452	TAA	4	12184	12196	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134892
59	NC_021452	TAA	4	12294	12304	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134892
60	NC_021452	TA	17	12663	12695	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_021452	TA	6	13070	13080	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_021452	TTAA	3	13164	13174	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_021452	TAATTA	3	13369	13391	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_021452	TAT	4	13398	13410	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_021452	TTA	4	13487	13498	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_021452	TTAT	3	13560	13571	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021452	ATTTA	3	13604	13618	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021452	TTTA	3	13786	13797	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021452	TTTA	3	13968	13980	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_021452	AATT	3	13981	13991	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_021452	AATT	5	14003	14023	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_021452	TAATT	3	14635	14649	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021452	TAT	7	14747	14767	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_021452	ATTT	4	14830	14845	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_021452	ATTT	4	14920	14935	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_021452	T	24	14956	14979	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_021452	T	13	15022	15034	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_021452	ATTA	3	15072	15083	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021452	TTAA	4	15126	15140	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_021452	TAAT	3	15162	15176	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_021452	TAAT	5	15173	15193	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_021452	AT	11	15199	15219	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_021452	ATT	4	15256	15267	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_021452	ATTTA	3	15272	15286	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Danaus plexippus mitochondrion