ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ardisia polysticta chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021121	TAT	4	98	108	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021121	TTTC	3	340	350	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
3	NC_021121	CAG	4	1104	1115	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	48265117
4	NC_021121	AAGT	3	1210	1220	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	48265117
5	NC_021121	AAAT	3	1634	1644	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021121	GAA	4	2170	2181	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	48265118
7	NC_021121	AAG	4	2977	2988	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	48265118
8	NC_021121	ATTGA	3	3776	3790	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_021121	CATT	3	4119	4130	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_021121	AAAG	3	4537	4547	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_021121	A	13	4628	4640	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_021121	TACA	3	4742	4753	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_021121	TAT	4	4894	4905	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021121	T	14	4902	4915	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_021121	TCTCT	3	5090	5103	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	48265118
16	NC_021121	T	16	5313	5328	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	48265118
17	NC_021121	TAAAA	3	6256	6271	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_021121	TAT	4	6425	6435	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_021121	CAAA	3	6542	6552	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_021121	GAAT	4	6961	6977	17	50 %	25 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_021121	TCTTAT	3	7761	7778	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
22	NC_021121	TAGT	3	7987	7998	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021121	GAA	4	8131	8142	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_021121	ATTT	3	9306	9316	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_021121	A	19	9380	9398	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_021121	AATT	3	9912	9923	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_021121	T	13	10782	10794	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021121	A	18	12440	12457	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_021121	TTTC	3	13154	13164	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48265118
30	NC_021121	CATA	3	13191	13201	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	48265118
31	NC_021121	T	12	13270	13281	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	48265118
32	NC_021121	CGAAA	3	13715	13728	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	48265118
33	NC_021121	A	15	14067	14081	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_021121	T	15	18901	18915	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	48265118
35	NC_021121	AT	7	20283	20295	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48265118
36	NC_021121	A	14	22968	22981	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	48265119
37	NC_021121	T	14	23038	23051	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	48265119
38	NC_021121	GTT	4	24011	24022	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	48265119
39	NC_021121	T	12	26633	26644	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	48265119
40	NC_021121	CATT	3	27252	27263	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	48265119
41	NC_021121	CAG	4	28569	28580	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_021121	ATTT	3	29197	29207	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_021121	AAAT	3	30657	30669	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_021121	ATT	4	30761	30771	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_021121	CT	6	30998	31008	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_021121	AGA	4	31032	31043	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_021121	TGA	4	31160	31170	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_021121	ATA	5	31966	31979	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_021121	ATGA	3	32829	32839	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_021121	A	14	33249	33262	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_021121	AT	8	33468	33484	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_021121	TAA	4	33794	33805	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_021121	GAAA	3	35453	35464	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	48265119
54	NC_021121	T	12	36512	36523	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021121	AG	6	36667	36677	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_021121	TC	6	37271	37281	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	48265119
57	NC_021121	ATAA	4	37382	37397	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_021121	AT	8	37496	37510	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_021121	ATG	4	39766	39776	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	48265119
60	NC_021121	AATG	3	41259	41270	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	48265119
61	NC_021121	GCA	4	41664	41675	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	48265119
62	NC_021121	AAAG	3	42051	42062	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	48265119
63	NC_021121	T	12	42947	42958	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_021121	TTA	4	43281	43291	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_021121	A	14	43327	43340	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_021121	TAAA	4	43517	43531	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_021121	AGA	4	44041	44051	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	48265120
68	NC_021121	TAA	4	44742	44753	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48265120
69	NC_021121	TTA	4	46665	46675	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_021121	GATTTA	3	47311	47328	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_021121	TAT	4	47448	47458	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_021121	TAT	4	47462	47472	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_021121	TTTA	3	47588	47599	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_021121	AAAAT	3	47632	47645	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_021121	TTAA	3	48079	48091	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_021121	TTGA	4	48323	48338	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_021121	GAAA	3	48485	48495	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_021121	ATG	4	49366	49377	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_021121	AAAT	3	51572	51582	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48265120
80	NC_021121	T	12	52482	52493	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021121	AAG	4	52573	52584	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_021121	GAATTT	3	52602	52619	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_021121	TTA	4	52672	52683	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_021121	TTTTC	3	53542	53556	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
85	NC_021121	ATA	4	55601	55613	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	48265120
86	NC_021121	TTG	4	56240	56250	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_021121	AATT	3	56261	56272	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_021121	TATT	3	58279	58290	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_021121	T	14	59954	59967	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021121	GAA	4	60242	60253	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_021121	AATT	3	60465	60475	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_021121	ATA	4	60515	60526	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_021121	CAA	4	61836	61846	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
94	NC_021121	AT	6	63413	63423	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48265121
95	NC_021121	ATTTT	3	64391	64404	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_021121	CTTT	5	65068	65087	20	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
97	NC_021121	AGAA	3	65189	65199	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_021121	TTTG	3	65695	65706	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	48265121
99	NC_021121	TTTC	4	66335	66350	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
100	NC_021121	TTGA	3	66508	66518	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_021121	TTATA	3	66711	66725	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_021121	CTTT	3	66816	66826	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_021121	A	18	67937	67954	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
104	NC_021121	TA	6	68010	68020	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_021121	ATTT	3	68040	68051	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021121	ATA	4	68277	68288	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_021121	AT	7	68297	68309	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_021121	AAATA	4	68809	68827	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
109	NC_021121	AT	6	68908	68918	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_021121	TACA	3	69365	69376	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	48265122
111	NC_021121	TAA	4	69984	69995	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_021121	TGAA	3	70515	70526	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_021121	CTTT	3	70553	70565	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
114	NC_021121	TAA	4	70837	70849	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_021121	ATAG	3	71150	71161	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_021121	TTA	4	71165	71176	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_021121	TAAA	3	71838	71850	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	48265117
118	NC_021121	TTTA	5	72049	72067	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	48265117
119	NC_021121	TATTTA	3	72076	72093	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	48265117
120	NC_021121	TAA	4	72337	72348	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48265117
121	NC_021121	GTTT	3	72420	72430	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48265117
122	NC_021121	TAAT	3	73181	73191	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48265117
123	NC_021121	ATA	4	73407	73417	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	48265117
124	NC_021121	G	12	73448	73459	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	48265117
125	NC_021121	GGTT	3	75146	75157	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	48265117
126	NC_021121	TGT	4	75769	75780	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	48265117
127	NC_021121	TTTC	3	76881	76891	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48265117
128	NC_021121	TATTC	3	76941	76954	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	48265117
129	NC_021121	TAAAGA	3	77174	77191	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	48265117
130	NC_021121	TGATCA	3	78721	78737	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	48265117
131	NC_021121	TAAAT	3	79640	79654	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	48265117
132	NC_021121	T	16	79972	79987	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	48265117
133	NC_021121	TCT	4	80064	80075	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	48265117
134	NC_021121	AT	8	81280	81295	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	48265117
135	NC_021121	ATTT	3	82951	82962	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48265117
136	NC_021121	A	16	82976	82991	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	48265117
137	NC_021121	A	14	83012	83025	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	48265117
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205	NC_021121	CATAC	3	147187	147200	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	48265126
206	NC_021121	CTCCTT	3	148057	148074	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	48265126
207	NC_021121	TATT	3	148849	148861	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	48265126
208	NC_021121	TGAT	3	149878	149890	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	48265126
209	NC_021121	ATC	4	151442	151453	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	48265126
210	NC_021121	AAAG	3	151598	151608	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48265126
211	NC_021121	CGAT	3	152025	152037	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	48265126
212	NC_021121	ATC	4	155874	155884	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	48265126
213	NC_021121	GAA	5	156339	156353	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	48265126
214	NC_021121	AAAG	3	156439	156450	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ardisia polysticta chloroplast