ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Naegleria fowleri mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021104	TA	6	561	572	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_021104	ATAG	3	892	902	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_021104	TAAA	3	999	1010	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_021104	TTGA	3	2152	2163	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_021104	AAGT	3	2569	2579	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021104	AGA	4	2924	2935	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	48475971
7	NC_021104	TTTA	3	3032	3043	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475971
8	NC_021104	CAG	4	3237	3247	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	48475971
9	NC_021104	TTGG	3	3561	3571	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	48475971
10	NC_021104	CATTT	3	3582	3595	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	48475971
11	NC_021104	TAAA	3	4108	4119	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475971
12	NC_021104	T	16	4334	4349	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	48475971
13	NC_021104	TA	6	4396	4406	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48475971
14	NC_021104	AAAC	3	4671	4682	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	48475971
15	NC_021104	ATAA	3	4719	4730	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475971
16	NC_021104	ATA	4	4936	4947	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475971
17	NC_021104	A	21	4979	4999	21	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021104	GTT	4	5694	5706	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	48475971
19	NC_021104	TAAA	3	6443	6454	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	48475971
20	NC_021104	ATTT	3	7071	7082	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475971
21	NC_021104	T	12	7094	7105	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	48475971
22	NC_021104	TTA	4	7545	7556	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475971
23	NC_021104	TTTA	3	7837	7847	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475971
24	NC_021104	TTA	4	7913	7924	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475971
25	NC_021104	TAT	4	8421	8432	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475971
26	NC_021104	ATT	5	8886	8900	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	48475971
27	NC_021104	AAAG	3	8947	8957	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475971
28	NC_021104	TATT	3	9441	9452	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021104	TAAA	3	9457	9467	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_021104	TATT	3	10124	10134	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475971
31	NC_021104	TAG	4	10204	10215	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	48475971
32	NC_021104	ATT	4	10244	10255	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	48475971
33	NC_021104	AGG	4	10292	10303	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	48475971
34	NC_021104	TAT	4	10685	10695	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48475971
35	NC_021104	ATA	4	10964	10974	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	48475971
36	NC_021104	CATT	3	11422	11433	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	48475971
37	NC_021104	CTA	4	11435	11445	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	48475971
38	NC_021104	T	12	11597	11608	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_021104	AT	6	11799	11809	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48475972
40	NC_021104	TGTT	3	11813	11823	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	48475972
41	NC_021104	T	16	11875	11890	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	48475972
42	NC_021104	TAG	4	11959	11970	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	48475972
43	NC_021104	AATG	3	12282	12292	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	48475972
44	NC_021104	TAA	5	12766	12779	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	48475972
45	NC_021104	T	13	12970	12982	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	48475972
46	NC_021104	T	13	13134	13146	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_021104	TAA	4	13208	13219	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_021104	TTTA	3	14348	14358	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475972
49	NC_021104	TTTA	3	15075	15085	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475972
50	NC_021104	TTCCT	3	16338	16351	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
51	NC_021104	AGATAT	3	16783	16799	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	48475972
52	NC_021104	TATT	3	17662	17672	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475972
53	NC_021104	ATT	4	18032	18043	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475972
54	NC_021104	TTTTA	3	18218	18232	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	48475972
55	NC_021104	T	17	18263	18279	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	48475972
56	NC_021104	TTTTG	3	18338	18351	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	48475972
57	NC_021104	TTTA	3	18583	18594	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	48475972
58	NC_021104	TACA	3	18735	18746	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	48475972
59	NC_021104	T	14	19347	19360	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	48475972
60	NC_021104	TTTTAT	3	19783	19806	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	48475972
61	NC_021104	CATT	3	19837	19848	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	48475972
62	NC_021104	TAT	4	19961	19972	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475972
63	NC_021104	ATTT	3	20164	20176	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	48475972
64	NC_021104	TA	6	20326	20336	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48475972
65	NC_021104	CTTT	3	21111	21121	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	48475972
66	NC_021104	TTTA	5	21922	21940	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
67	NC_021104	GAA	4	22100	22111	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	48475972
68	NC_021104	AAAT	3	22164	22174	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475972
69	NC_021104	ATA	7	22402	22425	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475972
70	NC_021104	TTTA	3	22476	22486	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475972
71	NC_021104	TA	6	22782	22792	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48475972
72	NC_021104	T	12	22909	22920	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	48475972
73	NC_021104	T	14	23210	23223	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	48475972
74	NC_021104	TTTA	3	23577	23587	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475972
75	NC_021104	TTTA	3	23625	23635	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475972
76	NC_021104	AATT	3	24137	24148	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475973
77	NC_021104	T	18	24291	24308	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_021104	GAAA	3	24331	24341	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_021104	TTA	4	24499	24510	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_021104	A	19	24706	24724	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	48475973
81	NC_021104	TTTA	3	24855	24865	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475973
82	NC_021104	TTAA	3	25309	25320	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	48475973
83	NC_021104	GGA	4	26088	26098	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	48475973
84	NC_021104	AAAAG	3	26169	26182	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	48475973
85	NC_021104	AAAG	3	26419	26430	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	48475973
86	NC_021104	AAT	4	26447	26458	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	48475973
87	NC_021104	A	18	26996	27013	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	48475973
88	NC_021104	TTA	4	27035	27047	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48475973
89	NC_021104	ATT	4	27125	27136	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475973
90	NC_021104	ATT	4	27190	27201	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475973
91	NC_021104	TTTTA	3	27283	27297	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	48475973
92	NC_021104	ATTT	3	27318	27329	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	48475973
93	NC_021104	AAG	5	27621	27635	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	48475973
94	NC_021104	AATA	3	28515	28525	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475973
95	NC_021104	ATTTT	3	28835	28848	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	48475973
96	NC_021104	T	13	28906	28918	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	48475973
97	NC_021104	TAG	5	28947	28961	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	48475973
98	NC_021104	AAAG	3	29045	29055	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	48475973
99	NC_021104	ATT	4	29171	29183	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48475973
100	NC_021104	TTAT	3	29820	29830	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475974
101	NC_021104	T	12	30225	30236	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	48475974
102	NC_021104	ATT	4	30309	30320	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	48475974
103	NC_021104	TTAT	3	30441	30451	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475974
104	NC_021104	AT	6	30836	30846	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48475974
105	NC_021104	A	13	31029	31041	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	48475974
106	NC_021104	T	12	31269	31280	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	48475974
107	NC_021104	AGAA	3	31392	31403	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	48475974
108	NC_021104	A	13	31836	31848	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	48475974
109	NC_021104	AGAAAA	3	32230	32247	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	48475974
110	NC_021104	TAAA	3	32490	32500	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	48475974
111	NC_021104	AAAG	3	32678	32689	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	48475974
112	NC_021104	T	14	32785	32798	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	48475974
113	NC_021104	T	14	32903	32916	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	48475974
114	NC_021104	ATT	4	33023	33034	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475974
115	NC_021104	AAT	4	33086	33097	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475974
116	NC_021104	T	12	33162	33173	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	48475974
117	NC_021104	TAA	4	33850	33861	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	48475974
118	NC_021104	TTTTAT	4	34155	34178	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	48475974
119	NC_021104	TATTT	3	34454	34467	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	48475974
120	NC_021104	T	16	34617	34632	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	48475974
121	NC_021104	TTAT	3	34788	34799	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475974
122	NC_021104	ATT	4	34819	34831	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48475974
123	NC_021104	TTTA	4	34908	34922	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	48475974
124	NC_021104	TTA	5	34927	34940	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	48475974
125	NC_021104	TAT	4	35030	35041	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475974
126	NC_021104	ATTT	3	35111	35121	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	48475974
127	NC_021104	TGTT	3	35152	35163	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	48475974
128	NC_021104	TTA	4	35346	35356	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48475974
129	NC_021104	TA	9	35413	35429	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	48475974
130	NC_021104	TAT	4	36050	36061	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	48475974
131	NC_021104	TAT	4	36078	36088	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	48475974
132	NC_021104	AT	7	36174	36186	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	48475974
133	NC_021104	TATAA	5	36378	36402	25	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021104	TTTA	3	36525	36536	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	48475974
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162	NC_021104	AAAT	3	43174	43184	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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179	NC_021104	AATT	3	45693	45703	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	48475975
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182	NC_021104	TAA	7	46598	46618	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
183	NC_021104	TA	6	46834	46844	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
184	NC_021104	TTTA	3	46847	46858	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
185	NC_021104	TAT	6	46863	46879	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
186	NC_021104	ATA	4	46936	46947	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
187	NC_021104	TTAT	3	46950	46961	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
188	NC_021104	AGAA	3	47819	47829	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
189	NC_021104	AT	6	48014	48024	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
190	NC_021104	AT	6	48087	48097	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
191	NC_021104	TAGATA	3	48847	48865	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
192	NC_021104	TA	8	48940	48954	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
193	NC_021104	ATA	4	49367	49378	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
194	NC_021104	AAT	4	49507	49519	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Naegleria fowleri mitochondrion