Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Scapharca broughtonii mitochondrial DNA

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_020787T13182194130 %100 %0 %0 %7 %47565610
2NC_020787GTTT3501511110 %75 %25 %0 %9 %47565610
3NC_020787TGTT3531541110 %75 %25 %0 %9 %47565610
4NC_020787TTTG311821192110 %75 %25 %0 %9 %47565610
5NC_020787TGTTT313881402150 %80 %20 %0 %0 %47565610
6NC_020787ATT4256225731233.33 %66.67 %0 %0 %8 %47565610
7NC_020787ATA4280228131266.67 %33.33 %0 %0 %8 %47565610
8NC_020787GTAT3395139611125 %50 %25 %0 %9 %47565610
9NC_020787TTTTGG341634181190 %66.67 %33.33 %0 %10 %47565610
10NC_020787ATT4508951011333.33 %66.67 %0 %0 %7 %47565611
11NC_020787TAA4520852191266.67 %33.33 %0 %0 %8 %47565611
12NC_020787T1356235635130 %100 %0 %0 %0 %47565611
13NC_020787T1262656276120 %100 %0 %0 %8 %47565611
14NC_020787TTA4643564461233.33 %66.67 %0 %0 %8 %47565611
15NC_020787GTTT365316542120 %75 %25 %0 %8 %47565611
16NC_020787TATT3681268221125 %75 %0 %0 %9 %47565611
17NC_020787TGTT371387148110 %75 %25 %0 %9 %47565611
18NC_020787TTAAT3739174041440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_020787AAAAAT3836583821883.33 %16.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
20NC_020787TGA4858785981233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
21NC_020787ACAA310260102701175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
22NC_020787AT610392104031250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_020787AAT410510105211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_020787ATA410864108751266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_020787TTTTAA310918109361933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
26NC_020787GAAT310938109481150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
27NC_020787TTA411296113071233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_020787TTAAA311470114831460 %40 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_020787TTTA311676116871225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_020787TTTA312066120771225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_020787GGAA312092121031250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
32NC_020787TTA413452134621133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
33NC_020787ATTT313567135771125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
34NC_020787ATTT313617136271125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
35NC_020787TA613931139411150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
36NC_020787T141399014003140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
37NC_020787TG61443914450120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
38NC_020787T181468614703180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
39NC_020787TTA415346153571233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
40NC_020787TAT416091161011133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
41NC_020787ATGG316810168211225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
42NC_020787TATT317606176171225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
43NC_020787TTG41806418075120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
44NC_020787AG718969189811350 %0 %50 %0 %7 %Non-Coding
45NC_020787TAT418996190061133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
46NC_020787TGTTGG31920619223180 %50 %50 %0 %0 %47565611
47NC_020787TTCGT31955019563140 %60 %20 %20 %7 %47565611
48NC_020787AT920086201031850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
49NC_020787T132028820300130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
50NC_020787TATT320594206051225 %75 %0 %0 %0 %47565611
51NC_020787AATT320678206901350 %50 %0 %0 %7 %47565611
52NC_020787AGA420843208541266.67 %0 %33.33 %0 %8 %47565611
53NC_020787TAT421097211071133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
54NC_020787ATAGA322223222361460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
55NC_020787TATT323074230841125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
56NC_020787TTTA323190232001125 %75 %0 %0 %9 %47565611
57NC_020787TTAT323534235451225 %75 %0 %0 %8 %47565611
58NC_020787TAAA324826248361175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
59NC_020787ATTT324838248501325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
60NC_020787TAAA325098251081175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
61NC_020787ATTT325110251221325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
62NC_020787TTA426623266331133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
63NC_020787T202735027369200 %100 %0 %0 %5 %47565611
64NC_020787ATA527388274021566.67 %33.33 %0 %0 %6 %47565611
65NC_020787TATT328532285431225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
66NC_020787AGG430219302301233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
67NC_020787TTAA331316313271250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_020787ATG431546315571233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
69NC_020787TTG43189631907120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
70NC_020787T153319433208150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
71NC_020787T143435434367140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
72NC_020787TAT535464354781533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
73NC_020787AGA435508355181166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
74NC_020787ATT435725357361233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_020787TGG43592735938120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
76NC_020787TTA436575365861233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
77NC_020787ATT436778367901333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
78NC_020787AGAA338110381201175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
79NC_020787TTA438322383331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
80NC_020787GATT338522385321125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
81NC_020787TAT439127391381233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
82NC_020787TTAT339518395291225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
83NC_020787TTAC339575395851125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
84NC_020787TAT439946399571233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
85NC_020787AGA439990400001166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
86NC_020787ATT440208402191233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
87NC_020787TGTGT34059740610140 %60 %40 %0 %7 %Non-Coding
88NC_020787TA641822418321150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
89NC_020787TAT443677436881233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
90NC_020787TCT44515445165120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
91NC_020787TTGT34562345634120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
92NC_020787AAGT345913459231150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
93NC_020787AAAG345928459381175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
94NC_020787ATA446613466241266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
95NC_020787GTTT34677546785110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding