ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cupido argiades mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020779	TAA	4	205	216	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_020779	TTTTCT	3	240	257	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
3	NC_020779	TATT	4	258	273	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	47023591
4	NC_020779	TATTTT	3	287	305	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	47023591
5	NC_020779	AATT	3	932	943	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47023591
6	NC_020779	ATT	4	953	963	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023591
7	NC_020779	ATT	4	1036	1048	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	47023591
8	NC_020779	TAT	4	1109	1120	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023591
9	NC_020779	TAA	5	1188	1201	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47023591
10	NC_020779	TTTA	3	1225	1236	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	47023591
11	NC_020779	TAT	4	1958	1969	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023591
12	NC_020779	ATT	5	2033	2047	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	47023591
13	NC_020779	AAT	8	2849	2872	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	47023591
14	NC_020779	ATC	4	2921	2933	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	47023591
15	NC_020779	TAATTA	3	3157	3174	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	47023591
16	NC_020779	TTTA	3	3311	3323	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	47023591
17	NC_020779	TAA	4	3443	3454	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	47023591
18	NC_020779	ATA	4	3495	3507	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47023591
19	NC_020779	ATT	4	3855	3866	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_020779	TATTTA	3	3934	3950	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	47023591
21	NC_020779	ATT	4	3960	3970	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023591
22	NC_020779	AATT	3	4224	4235	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47023592
23	NC_020779	ATTT	3	4331	4342	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	47023592
24	NC_020779	AGA	5	4564	4577	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	47023592
25	NC_020779	ATT	4	4839	4849	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023592
26	NC_020779	TAT	6	4856	4872	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	47023592
27	NC_020779	TATTT	3	4987	5001	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	47023592
28	NC_020779	ATT	4	5462	5473	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023592
29	NC_020779	TAT	7	5598	5619	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023592
30	NC_020779	TAT	4	5866	5877	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023592
31	NC_020779	AT	6	6549	6559	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	47023591
32	NC_020779	TAT	4	6670	6681	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023591
33	NC_020779	AATT	3	6718	6729	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	47023591
34	NC_020779	TAA	4	6757	6767	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	47023591
35	NC_020779	AAT	4	6894	6904	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	47023591
36	NC_020779	AAAT	3	6909	6920	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	47023591
37	NC_020779	TTA	4	7188	7199	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023591
38	NC_020779	TGAA	3	7381	7391	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	47023591
39	NC_020779	AAT	5	7477	7491	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	47023591
40	NC_020779	AAAT	3	7532	7542	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47023591
41	NC_020779	TAA	4	7731	7743	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	47023591
42	NC_020779	AGA	4	7834	7844	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	47023591
43	NC_020779	A	23	7997	8019	23	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	47023591
44	NC_020779	AAT	4	8758	8769	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47023591
45	NC_020779	A	15	9121	9135	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	47023591
46	NC_020779	TTAA	3	9276	9288	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	47023591
47	NC_020779	TAA	5	9376	9390	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	47023591
48	NC_020779	ATTAA	3	9467	9481	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	47023591
49	NC_020779	AT	7	9581	9593	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	47023592
50	NC_020779	TATAAA	4	9714	9737	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47023592
51	NC_020779	TAT	4	9935	9945	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023592
52	NC_020779	TTTTTA	3	10043	10061	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	47023592
53	NC_020779	TTTA	3	10085	10096	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	47023592
54	NC_020779	TATT	4	10156	10172	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	47023592
55	NC_020779	ATTT	3	10177	10188	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	47023592
56	NC_020779	AT	6	10204	10214	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	47023592
57	NC_020779	TAA	4	10333	10344	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	47023592
58	NC_020779	ATTT	3	11019	11029	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	47023592
59	NC_020779	ATT	4	11129	11139	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023592
60	NC_020779	ATT	4	11146	11157	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	47023592
61	NC_020779	TAT	4	11516	11526	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	47023592
62	NC_020779	ATT	4	11534	11546	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	47023592
63	NC_020779	TAAT	3	11563	11574	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	47023592
64	NC_020779	ATAA	3	11686	11696	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47023591
65	NC_020779	AAAT	3	11811	11821	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	47023591
66	NC_020779	AAT	4	12036	12046	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	47023591
67	NC_020779	TAA	4	12292	12302	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	47023591
68	NC_020779	TA	6	12612	12622	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_020779	AT	22	12662	12703	42	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_020779	T	14	12924	12937	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_020779	ATCA	3	13002	13013	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_020779	TAA	4	13195	13207	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_020779	ATT	4	13413	13423	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_020779	ATTTT	3	13518	13531	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_020779	TTTTA	4	13597	13617	21	20 %	80 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_020779	ATTA	4	13663	13678	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_020779	AAAT	4	13679	13693	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_020779	ATTA	5	13785	13805	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_020779	ATT	4	14003	14014	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_020779	AATT	3	14023	14033	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_020779	ATT	4	14045	14057	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_020779	A	12	14260	14271	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020779	ATTTTT	3	14339	14356	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_020779	TTTA	3	14365	14375	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_020779	TTAT	4	14723	14738	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_020779	T	19	14907	14925	19	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020779	TAAA	3	15071	15082	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_020779	TTAA	3	15083	15095	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_020779	TA	12	15149	15171	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_020779	TA	11	15188	15208	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_020779	ATAAAT	3	15253	15270	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_020779	ATTT	3	15291	15302	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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