ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pavlova lutheri chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020371	AGGT	3	1648	1659	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020371	ATT	4	3346	3357	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45606197
3	NC_020371	TTGA	3	3991	4001	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	45606208
4	NC_020371	AT	7	5668	5680	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_020371	GACC	3	5784	5794	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_020371	CGGC	3	5874	5884	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
7	NC_020371	AATT	3	5971	5982	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45606198
8	NC_020371	GAA	4	6755	6766	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45606208
9	NC_020371	AAG	4	8747	8758	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45606198
10	NC_020371	TGC	4	9277	9287	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	45606198
11	NC_020371	AACA	3	9584	9594	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	45606198
12	NC_020371	TAAG	3	11630	11642	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	45606199
13	NC_020371	TAAT	3	12064	12074	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45606199
14	NC_020371	A	12	12178	12189	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	45606199
15	NC_020371	TAA	4	12331	12342	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	45606199
16	NC_020371	GTTGGT	3	13911	13928	18	0 %	50 %	50 %	0 %	5 %	45606199
17	NC_020371	ACTCT	3	15617	15630	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	45606199
18	NC_020371	AAAG	3	16932	16943	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_020371	A	24	16952	16975	24	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
20	NC_020371	TATT	3	17412	17423	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	45606199
21	NC_020371	TTA	4	19193	19204	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_020371	TTAA	5	19332	19351	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
23	NC_020371	TA	6	19592	19603	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020371	AT	7	19648	19661	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_020371	CTT	4	19810	19820	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	45606200
26	NC_020371	ATAA	3	20040	20050	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45606200
27	NC_020371	TAG	4	22451	22462	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606200
28	NC_020371	TTAA	3	23059	23069	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_020371	AATT	4	23123	23137	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_020371	AAAC	3	24030	24041	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	45606200
31	NC_020371	TTCA	3	24452	24462	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	45606200
32	NC_020371	CTT	4	24893	24904	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606200
33	NC_020371	CAA	4	27880	27891	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45606200
34	NC_020371	TCA	11	28236	28268	33	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	45606208
35	NC_020371	ATT	4	28440	28451	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45606208
36	NC_020371	TCT	4	28488	28499	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606208
37	NC_020371	TATAGC	3	29406	29423	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	45606201
38	NC_020371	GTTT	3	31167	31178	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	45606201
39	NC_020371	CTT	4	31630	31641	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	45606201
40	NC_020371	TTCT	3	33880	33891	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	45606202
41	NC_020371	TAA	4	36600	36610	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	45606202
42	NC_020371	ATT	4	37345	37356	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45606202
43	NC_020371	AT	6	38653	38663	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_020371	TAC	5	39612	39626	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	45606203
45	NC_020371	TA	6	41583	41593	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45606203
46	NC_020371	ATT	4	42066	42076	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606203
47	NC_020371	TA	7	43047	43060	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45606203
48	NC_020371	CTG	4	43427	43438	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45606203
49	NC_020371	CCTG	3	47888	47898	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	45606204
50	NC_020371	ATT	4	50585	50595	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606204
51	NC_020371	TAG	4	52558	52569	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606204
52	NC_020371	ATAA	3	55943	55954	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020371	A	12	56075	56086	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_020371	TTTA	3	56313	56324	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_020371	AAG	4	57474	57485	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	45606204
56	NC_020371	TAAA	3	57889	57900	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45606204
57	NC_020371	TA	6	58648	58658	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45606204
58	NC_020371	GA	6	59990	60000	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	45606204
59	NC_020371	A	13	60768	60780	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_020371	ATT	4	60814	60825	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_020371	CTAAAA	3	64140	64158	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
62	NC_020371	ATT	4	65131	65141	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	45606205
63	NC_020371	GC	6	68926	68936	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	45606205
64	NC_020371	AATT	3	70770	70780	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_020371	AAT	4	71268	71279	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45606206
66	NC_020371	TA	6	71676	71687	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_020371	ATATT	3	72674	72687	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_020371	AGA	4	73395	73405	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45606206
69	NC_020371	ATATA	3	74022	74035	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	45606206
70	NC_020371	AT	6	74677	74687	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_020371	AAC	4	75620	75631	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	45606206
72	NC_020371	ATTT	3	77719	77729	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45606208
73	NC_020371	AATA	3	78275	78286	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_020371	ATA	4	78978	78988	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_020371	AT	6	79148	79159	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_020371	GCT	4	80190	80201	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45606207
77	NC_020371	AT	6	80540	80551	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_020371	TTAA	3	80573	80583	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_020371	GCA	4	81145	81156	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	45606207
80	NC_020371	AAG	4	81410	81420	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	45606207
81	NC_020371	AAT	4	82279	82290	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_020371	TTTA	3	82467	82478	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020371	ACA	4	86396	86408	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	45606207
84	NC_020371	AAAAT	3	89047	89061	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	45606207
85	NC_020371	TCCC	3	89431	89442	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
86	NC_020371	GTA	4	92046	92057	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	45606208
87	NC_020371	TTC	4	93309	93320	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
88	NC_020371	ATTTTC	4	93393	93422	30	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	6 %	Non-Coding

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