ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Haemaphysalis parva mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_020335	TAAGC	3	8	22	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
2	NC_020335	CTTT	3	258	269	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	45284937
3	NC_020335	TTTAT	3	440	453	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45284937
4	NC_020335	TTA	4	847	858	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284937
5	NC_020335	ATT	4	2546	2557	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284937
6	NC_020335	A	14	2574	2587	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	45284937
7	NC_020335	AAT	4	2768	2779	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284938
8	NC_020335	ATTT	3	2932	2944	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	45284938
9	NC_020335	TTTTA	3	4563	4576	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	45284938
10	NC_020335	ATTT	3	5090	5100	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	45284938
11	NC_020335	T	16	5202	5217	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	45284938
12	NC_020335	ATT	4	5360	5371	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	45284938
13	NC_020335	TTAA	3	5656	5667	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_020335	ATTA	3	5687	5699	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_020335	TAAAA	3	5979	5992	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	45284938
16	NC_020335	ATT	4	6053	6065	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	45284938
17	NC_020335	AAGT	3	6126	6137	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	45284938
18	NC_020335	AT	6	7303	7314	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_020335	ATA	4	7826	7838	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_020335	TAA	4	8435	8446	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_020335	ATAA	4	8696	8711	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_020335	AATT	3	8806	8816	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_020335	AATT	3	9084	9095	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_020335	TAAA	3	9576	9586	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284938
25	NC_020335	AAAT	3	9775	9785	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	45284938
26	NC_020335	TA	7	11260	11273	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284938
27	NC_020335	AAT	4	11312	11323	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284938
28	NC_020335	ATT	4	11442	11453	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284938
29	NC_020335	A	12	11741	11752	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	45284938
30	NC_020335	TA	7	11939	11952	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	45284938
31	NC_020335	ATA	4	12075	12086	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284938
32	NC_020335	A	16	12104	12119	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	45284938
33	NC_020335	ATT	4	12261	12272	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284938
34	NC_020335	ATT	4	12342	12353	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284938
35	NC_020335	AATT	3	12362	12372	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	45284938
36	NC_020335	ATTTA	3	12435	12449	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	45284938
37	NC_020335	AAGA	3	12563	12573	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	45284938
38	NC_020335	ATAA	3	12600	12611	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	45284938
39	NC_020335	AATA	4	12678	12692	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	45284938
40	NC_020335	AAT	5	12884	12898	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	45284938
41	NC_020335	AAT	4	12968	12979	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284938
42	NC_020335	TAA	4	13180	13191	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45284938
43	NC_020335	TAT	4	13598	13609	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	45284939
44	NC_020335	AATT	3	14659	14670	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_020335	AATTTT	3	14785	14803	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Haemaphysalis parva mitochondrion