ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Celastrina hersilia mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018049	TATT	4	252	267	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122407
2	NC_018049	T	17	283	299	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	39122407
3	NC_018049	ATTT	3	467	477	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122407
4	NC_018049	AAT	4	807	817	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122407
5	NC_018049	ATA	4	853	863	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122407
6	NC_018049	AATT	3	926	937	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122407
7	NC_018049	ATT	4	1059	1071	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122407
8	NC_018049	TTATA	3	1076	1089	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	39122407
9	NC_018049	TAA	5	1182	1195	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122407
10	NC_018049	GGA	4	2117	2127	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	39122407
11	NC_018049	GAAA	3	2235	2246	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	39122407
12	NC_018049	TTTA	4	2477	2492	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122407
13	NC_018049	ATT	4	2690	2700	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122407
14	NC_018049	AT	6	2818	2828	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122407
15	NC_018049	ATA	8	2840	2863	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122407
16	NC_018049	ATA	4	3484	3496	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122407
17	NC_018049	ATTTTT	4	3905	3929	25	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	39122408
18	NC_018049	ATT	4	3949	3959	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122408
19	NC_018049	ATA	4	3985	3999	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122408
20	NC_018049	TTAT	3	4132	4143	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	39122408
21	NC_018049	TAT	4	4174	4185	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122408
22	NC_018049	AATT	3	4216	4227	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122408
23	NC_018049	AGA	4	4556	4567	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	39122408
24	NC_018049	ATT	4	4613	4623	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122408
25	NC_018049	TAT	6	4852	4868	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	39122408
26	NC_018049	TATTT	3	4983	4997	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	39122408
27	NC_018049	TATTTA	3	5499	5517	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
28	NC_018049	TTTAA	4	5543	5562	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
29	NC_018049	TAT	5	5592	5608	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	39122408
30	NC_018049	T	13	5844	5856	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	39122408
31	NC_018049	AT	14	6129	6154	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_018049	TAA	4	6392	6404	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122408
33	NC_018049	A	13	6403	6415	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	39122408
34	NC_018049	TTA	4	6416	6427	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122408
35	NC_018049	TA	6	6440	6451	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	39122408
36	NC_018049	TAA	4	6465	6476	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122408
37	NC_018049	AAAT	3	6787	6797	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122408
38	NC_018049	AT	6	6972	6982	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122408
39	NC_018049	ATA	4	7370	7384	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	39122408
40	NC_018049	AAT	4	7554	7565	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	39122408
41	NC_018049	CAAT	3	7571	7581	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	39122408
42	NC_018049	TAAA	3	7608	7618	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122408
43	NC_018049	AGA	4	7911	7921	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	39122408
44	NC_018049	A	12	8086	8097	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	39122408
45	NC_018049	TAA	6	8255	8272	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	39122408
46	NC_018049	TTA	4	8539	8550	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	39122408
47	NC_018049	AT	6	8980	8990	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122408
48	NC_018049	AAAT	3	9101	9111	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122408
49	NC_018049	AAAAT	3	9190	9203	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39122408
50	NC_018049	ATA	5	9247	9260	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	39122408
51	NC_018049	ATTAAT	3	9444	9461	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	39122408
52	NC_018049	TAAA	3	9627	9637	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122408
53	NC_018049	ATT	5	10143	10157	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39122408
54	NC_018049	ATTT	3	10325	10340	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	39122408
55	NC_018049	TAA	7	10394	10414	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	39122408
56	NC_018049	TTTA	3	10415	10426	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	39122408
57	NC_018049	TAAT	3	10489	10499	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122408
58	NC_018049	TTA	4	10870	10880	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122408
59	NC_018049	ATTT	3	11078	11088	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	39122408
60	NC_018049	TAT	5	11510	11523	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	39122408
61	NC_018049	TTA	4	11558	11568	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	39122408
62	NC_018049	AATT	3	11652	11662	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	39122408
63	NC_018049	AAAT	3	11772	11782	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	39122408
64	NC_018049	TAAA	4	11898	11913	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	39122408
65	NC_018049	TAAA	3	11931	11943	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	39122408
66	NC_018049	AAATC	3	12138	12152	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	39122408
67	NC_018049	TAAAA	3	12342	12355	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	39122408
68	NC_018049	ATT	5	12652	12666	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	39122408
69	NC_018049	TTAT	3	12701	12712	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_018049	TTA	4	12766	12777	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_018049	T	14	12972	12985	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_018049	TTTA	3	13095	13106	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_018049	TAAT	4	13446	13461	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_018049	ATT	4	13475	13485	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_018049	TA	11	13512	13532	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_018049	ATTTT	3	13570	13583	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_018049	ATT	4	13698	13709	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_018049	A	14	13728	13741	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_018049	ATTA	5	13834	13854	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_018049	AT	8	13872	13887	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_018049	ATT	4	14054	14065	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_018049	ATT	4	14575	14585	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_018049	T	19	14958	14976	19	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018049	TC	7	15013	15026	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
85	NC_018049	TAAA	3	15121	15132	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_018049	ATTA	3	15158	15169	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018049	AT	11	15197	15218	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_018049	TATT	3	15239	15250	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_018049	ATA	5	15275	15290	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

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