ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Lotus japonicus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016743	TA	6	2333	2343	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016743	GGTG	3	2980	2991	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016743	GAA	4	5923	5933	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37245028
4	NC_016743	CTAG	4	5965	5981	17	25 %	25 %	25 %	25 %	5 %	37245028
5	NC_016743	ACT	4	6226	6236	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37245028
6	NC_016743	GGCG	3	6345	6356	12	0 %	0 %	75 %	25 %	8 %	37245028
7	NC_016743	GTCA	3	8344	8355	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	37245028
8	NC_016743	TTTC	3	8745	8755	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37245028
9	NC_016743	TCTTTC	3	9535	9553	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	37245028
10	NC_016743	TTGT	3	9653	9663	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	37245028
11	NC_016743	ATGA	3	9888	9899	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37245028
12	NC_016743	AAC	4	10135	10146	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37245028
13	NC_016743	GTTC	3	10392	10404	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	37245028
14	NC_016743	ATT	5	10703	10716	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37245028
15	NC_016743	AAG	4	10982	10993	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37245028
16	NC_016743	AGTTGA	3	15114	15131	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	37245028
17	NC_016743	TTG	4	16584	16595	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37245028
18	NC_016743	CGAA	3	18589	18599	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	37245028
19	NC_016743	TCT	4	18925	18937	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	37245028
20	NC_016743	GAA	5	19027	19041	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	37245028
21	NC_016743	AAG	4	20166	20176	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37245028
22	NC_016743	AGGT	3	20279	20289	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	37245028
23	NC_016743	AAAT	3	20478	20488	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37245028
24	NC_016743	AAAG	3	20598	20609	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37245028
25	NC_016743	GTTT	3	20805	20815	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	37245028
26	NC_016743	TCTA	4	21646	21662	17	25 %	50 %	0 %	25 %	5 %	37245028
27	NC_016743	TTC	4	22337	22348	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37245028
28	NC_016743	AAAT	3	23681	23691	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37245028
29	NC_016743	CAAG	3	24119	24130	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	37245028
30	NC_016743	GACC	3	25341	25352	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	37245028
31	NC_016743	TGGC	3	29531	29541	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	37245028
32	NC_016743	CAAG	3	29859	29870	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	37245028
33	NC_016743	ATAGTG	3	30621	30637	17	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	37245028
34	NC_016743	AT	6	30727	30737	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
35	NC_016743	CTAT	3	32299	32311	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	37245028
36	NC_016743	TTAG	3	32427	32438	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	37245028
37	NC_016743	TG	6	33411	33422	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	37245028
38	NC_016743	TTTG	3	33789	33799	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	37245028
39	NC_016743	TTTTC	3	33999	34013	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	37245028
40	NC_016743	GTTC	3	35483	35493	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	37245028
41	NC_016743	CATA	3	35665	35676	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	37245028
42	NC_016743	GGAAT	3	35765	35779	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	37245028
43	NC_016743	TCA	6	36024	36042	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10 %	37245028
44	NC_016743	TTAC	3	36119	36129	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37245028
45	NC_016743	AT	7	36517	36531	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	37245028
46	NC_016743	GCTTG	3	36551	36565	15	0 %	40 %	40 %	20 %	6 %	37245028
47	NC_016743	A	13	37559	37571	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	37245028
48	NC_016743	TTCT	3	38189	38200	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	37245028
49	NC_016743	A	13	38449	38461	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	37245028
50	NC_016743	AAAT	3	38505	38516	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37245028
51	NC_016743	AACG	3	38533	38543	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	37245028
52	NC_016743	CTTT	3	38744	38755	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245028
53	NC_016743	ATA	5	39073	39086	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37245028
54	NC_016743	ACCG	3	42099	42110	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	37245028
55	NC_016743	ATC	4	42318	42328	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37245028
56	NC_016743	TTC	4	42422	42433	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37245028
57	NC_016743	AG	6	46648	46659	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
58	NC_016743	TC	6	46975	46985	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
59	NC_016743	TTCTT	3	48642	48655	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	37245028
60	NC_016743	ACTA	3	49049	49059	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	37245028
61	NC_016743	GA	7	49905	49917	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	37245028
62	NC_016743	TGTAAG	3	51973	51990	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	37245028
63	NC_016743	GGC	4	52508	52518	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	37245028
64	NC_016743	TTACC	3	53830	53845	16	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	37245028
65	NC_016743	TTC	4	54613	54625	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	37245028
66	NC_016743	GTC	4	54727	54738	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37245028
67	NC_016743	AATG	3	54754	54765	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	37245028
68	NC_016743	AAT	4	54886	54898	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37245028
69	NC_016743	GGGT	3	55436	55446	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	37245028
70	NC_016743	TAAA	3	55627	55637	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37245028
71	NC_016743	TAAA	3	55652	55663	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37245028
72	NC_016743	GCG	4	56166	56177	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	37245028
73	NC_016743	TTC	4	57099	57110	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37245028
74	NC_016743	GAAG	3	57260	57271	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
75	NC_016743	TTA	4	57418	57428	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37245028
76	NC_016743	AAG	4	57441	57451	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37245028
77	NC_016743	AAGA	4	57908	57923	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	37245028
78	NC_016743	ACTA	3	58185	58195	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	37245028
79	NC_016743	GGAA	3	58754	58766	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	37245028
80	NC_016743	CTTT	3	59741	59752	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245028
81	NC_016743	CGG	4	60589	60600	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	37245028
82	NC_016743	A	13	62062	62074	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	37245028
83	NC_016743	ATTCC	3	63375	63389	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	37245028
84	NC_016743	TCCC	3	63632	63643	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	37245028
85	NC_016743	AGAA	4	65294	65308	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	37245028
86	NC_016743	AGA	4	65314	65325	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37245028
87	NC_016743	AACT	3	65543	65554	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	37245028
88	NC_016743	ATAAGA	3	67531	67548	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	37245028
89	NC_016743	TAT	4	67868	67880	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37245028
90	NC_016743	CTT	4	68656	68668	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	37245028
91	NC_016743	TC	6	68837	68847	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
92	NC_016743	GAATA	3	70388	70401	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	37245028
93	NC_016743	AGA	4	74874	74885	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37245028
94	NC_016743	AT	7	75568	75581	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
95	NC_016743	T	14	76051	76064	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	37245028
96	NC_016743	ACCT	3	76741	76752	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	37245028
97	NC_016743	TA	7	78005	78017	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
98	NC_016743	CCTT	3	78924	78934	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
99	NC_016743	GTCA	3	80734	80744	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	37245028
100	NC_016743	TGAA	3	81583	81594	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	37245028
101	NC_016743	TGAA	3	81926	81937	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37245028
102	NC_016743	TTG	4	82260	82271	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	37245028
103	NC_016743	GTCC	3	82300	82311	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	37245028
104	NC_016743	CTAT	3	83308	83318	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37245028
105	NC_016743	CAG	4	85541	85552	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37245028
106	NC_016743	CTG	4	86147	86158	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37245028
107	NC_016743	AATG	3	88090	88100	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37245028
108	NC_016743	GACCAG	3	88442	88459	18	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	5 %	37245028
109	NC_016743	CTT	4	88637	88649	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	37245028
110	NC_016743	GTA	5	89152	89166	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	37245028
111	NC_016743	AGA	4	89479	89490	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37245028
112	NC_016743	ATTC	3	89846	89856	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37245028
113	NC_016743	AG	6	89986	89997	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
114	NC_016743	ATGG	3	91444	91456	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	37245028
115	NC_016743	TCTT	3	91463	91474	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245028
116	NC_016743	AGT	4	92169	92180	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37245028
117	NC_016743	CAG	4	93323	93334	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37245028
118	NC_016743	GAT	4	93677	93687	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37245028
119	NC_016743	ACCC	3	97564	97574	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	37245028
120	NC_016743	CAT	4	98457	98467	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37245028
121	NC_016743	TA	7	98663	98675	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
122	NC_016743	GGTT	3	99730	99741	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	37245028
123	NC_016743	GGAT	4	100363	100378	16	25 %	25 %	50 %	0 %	6 %	37245028
124	NC_016743	CTAT	3	100379	100390	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	37245028
125	NC_016743	TA	6	100391	100401	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
126	NC_016743	TATCG	3	103724	103737	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	37245028
127	NC_016743	TGAA	3	104325	104336	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	37245028
128	NC_016743	GATC	3	104752	104763	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	37245028
129	NC_016743	CT	8	104880	104895	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	37245028
130	NC_016743	AAAT	3	105295	105305	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37245028
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142	NC_016743	GCTT	3	117306	117317	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	37245028
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234	NC_016743	TTTC	3	184470	184481	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245028
235	NC_016743	TCAA	3	184542	184553	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	37245028
236	NC_016743	TTCCC	3	184876	184890	15	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	37245028
237	NC_016743	TCAC	3	186490	186500	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	37245028
238	NC_016743	A	13	186543	186555	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	37245028
239	NC_016743	CTTAA	3	186739	186753	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	37245028
240	NC_016743	ATGG	3	190695	190706	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	37245028
241	NC_016743	CT	7	191535	191547	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	37245028
242	NC_016743	TGAG	3	192286	192297	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	37245028
243	NC_016743	A	12	192501	192512	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	37245028
244	NC_016743	CTT	4	192693	192703	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37245028
245	NC_016743	CCA	4	193495	193506	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	37245028
246	NC_016743	CAAGC	3	193515	193528	14	40 %	0 %	20 %	40 %	7 %	37245028
247	NC_016743	TTCT	3	194113	194124	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245028
248	NC_016743	CTT	4	195947	195957	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37245028
249	NC_016743	AT	6	196171	196182	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37245028
250	NC_016743	AGGA	3	196372	196383	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
251	NC_016743	TA	6	197915	197925	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37245028
252	NC_016743	GATT	3	198209	198219	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	37245028
253	NC_016743	TC	6	198460	198470	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
254	NC_016743	TGC	4	199602	199613	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37245028
255	NC_016743	AGAA	5	199664	199684	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37245028
256	NC_016743	TTTC	3	201213	201224	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245028
257	NC_016743	GAA	4	203082	203093	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37245028
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269	NC_016743	CAAG	3	212203	212214	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	37245028
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273	NC_016743	CTT	4	216806	216817	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37245028
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363	NC_016743	CCTT	3	278118	278128	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	37245028
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365	NC_016743	TGAA	3	280777	280788	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	37245028
366	NC_016743	TGAA	3	281120	281131	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	37245028
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372	NC_016743	AATG	3	287284	287294	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37245028
373	NC_016743	GACCAG	3	287636	287653	18	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	5 %	37245028
374	NC_016743	CTT	4	287831	287843	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	37245028
375	NC_016743	GTA	5	288346	288360	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	37245028
376	NC_016743	AGA	4	288673	288684	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37245028
377	NC_016743	ATTC	3	289040	289050	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	37245028
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379	NC_016743	ATGG	3	290638	290650	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	37245028
380	NC_016743	TCTT	3	290657	290668	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	37245028
381	NC_016743	AGT	4	291363	291374	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37245028
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386	NC_016743	AAGCG	3	294320	294334	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	37245028
387	NC_016743	GAAA	3	295337	295352	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	37245028
388	NC_016743	GAAA	3	295377	295387	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37245028
389	NC_016743	CTAC	3	297012	297022	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	37245028
390	NC_016743	GA	6	298763	298773	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37245028
391	NC_016743	AAGG	3	301596	301606	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	37245028
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395	NC_016743	CT	6	303912	303923	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	37245028
396	NC_016743	GAAG	3	304087	304098	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	37245028
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399	NC_016743	TA	7	306099	306112	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
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403	NC_016743	CTTT	3	310053	310063	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37245028
404	NC_016743	AGCAA	3	310804	310817	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	37245028
405	NC_016743	AGAA	3	311071	311082	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	37245028
406	NC_016743	GTTT	3	311293	311304	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	37245028
407	NC_016743	ATTTTA	3	311586	311604	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	37245028
408	NC_016743	CTTT	3	311638	311650	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	37245028
409	NC_016743	CTTAAG	3	311969	311985	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	37245028
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412	NC_016743	ATAA	3	312635	312646	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37245028
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440	NC_016743	TA	7	337119	337131	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
441	NC_016743	TAT	4	338070	338080	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37245028
442	NC_016743	GAT	4	339412	339422	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	37245028
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459	NC_016743	AT	7	351217	351229	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37245028
460	NC_016743	ATTT	3	352019	352030	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	37245028
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463	NC_016743	ATGG	3	356519	356529	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	37245028
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469	NC_016743	CTAG	3	359633	359643	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
470	NC_016743	TTG	4	360300	360310	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
471	NC_016743	CCAA	3	361123	361134	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
472	NC_016743	ATT	4	361815	361825	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
473	NC_016743	AAG	4	362033	362043	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
474	NC_016743	GTTT	3	363392	363402	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
475	NC_016743	TTTC	3	364026	364036	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
476	NC_016743	GATT	3	364091	364102	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
477	NC_016743	AAAT	3	366716	366726	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
478	NC_016743	GAA	4	367705	367716	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
479	NC_016743	TCC	4	369253	369263	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
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481	NC_016743	GATT	3	370751	370762	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	37245032
482	NC_016743	GTAGGA	3	375358	375375	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
483	NC_016743	TTCTC	3	375632	375645	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
484	NC_016743	CTTT	3	375682	375694	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
485	NC_016743	TTCA	3	375705	375715	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
486	NC_016743	GA	6	376562	376572	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
487	NC_016743	AGGA	3	377096	377106	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
488	NC_016743	GGAG	3	377234	377245	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
489	NC_016743	CTAG	3	377383	377394	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
490	NC_016743	TTCA	3	378242	378252	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
491	NC_016743	CTT	4	378790	378800	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
492	NC_016743	ACT	4	379241	379251	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
493	NC_016743	A	12	379614	379625	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	37245032
494	NC_016743	TAA	4	380135	380146	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37245032
495	NC_016743	GCCG	3	380184	380196	13	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	37245032

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Lotus japonicus mitochondrion