ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Fucus vesiculosus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016735	TCAG	3	1219	1229	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016735	AACT	3	1240	1251	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016735	CTAC	3	1444	1455	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016735	TTTTAT	3	1897	1914	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016735	CAGG	3	2515	2526	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016735	TCT	4	4989	4999	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016735	TTTA	3	6771	6783	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	37640365
8	NC_016735	ATT	4	7027	7037	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640365
9	NC_016735	ATA	5	7200	7213	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016735	A	13	7274	7286	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016735	TAT	4	8158	8170	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016735	TTAA	3	8537	8548	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37640366
13	NC_016735	ATT	4	9076	9087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640366
14	NC_016735	TAA	4	9131	9143	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016735	AT	6	9439	9451	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016735	ATTT	3	9454	9464	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016735	ATT	4	9493	9503	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016735	TATACT	3	9767	9783	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
19	NC_016735	TA	7	9814	9827	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016735	TTAA	3	9851	9861	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016735	TTAA	3	9899	9910	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016735	TTAA	3	9958	9969	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016735	ATTT	3	10207	10218	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	37640366
24	NC_016735	T	13	10425	10437	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	37640366
25	NC_016735	CTT	4	10486	10496	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37640366
26	NC_016735	TTA	4	10534	10545	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016735	TAT	4	10621	10631	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016735	TAT	4	10813	10824	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016735	ATA	4	10875	10886	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016735	TAC	4	11159	11170	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37640366
31	NC_016735	TATAT	4	11221	11240	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_016735	AT	6	11268	11278	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016735	ATTTT	3	11293	11306	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016735	TAT	4	11663	11674	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016735	TAT	4	11959	11969	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640366
36	NC_016735	AAT	4	12129	12139	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016735	TAA	4	12430	12441	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640366
38	NC_016735	GGGA	3	12622	12632	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	37640366
39	NC_016735	AAGA	3	12652	12663	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016735	AAAT	3	14670	14681	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37640367
41	NC_016735	ATA	4	15396	15406	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016735	A	13	16058	16070	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	37640367
43	NC_016735	AAAGA	3	17077	17090	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	37640367
44	NC_016735	ATG	4	17354	17365	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	37640367
45	NC_016735	TAA	4	18127	18138	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	37640367
46	NC_016735	AATT	3	18858	18869	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016735	TAAA	3	18939	18949	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016735	TTA	5	18994	19007	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	37640367
49	NC_016735	AATT	5	19353	19372	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
50	NC_016735	AT	6	20244	20254	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37640367
51	NC_016735	AAAT	3	20646	20657	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37640367
52	NC_016735	ATTA	3	20993	21005	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	37640367
53	NC_016735	CTA	4	21696	21706	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	37640367
54	NC_016735	AAAG	3	22161	22171	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37640367
55	NC_016735	ATT	5	22703	22718	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	37640367
56	NC_016735	TAAA	3	22786	22797	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37640367
57	NC_016735	TAT	4	23917	23928	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640367
58	NC_016735	TAGT	3	23935	23945	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	37640367
59	NC_016735	AAAT	3	23966	23977	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	37640367
60	NC_016735	ATT	4	24033	24044	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640367
61	NC_016735	TCAA	3	24281	24291	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	37640367
62	NC_016735	AAT	4	24779	24791	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37640367
63	NC_016735	ATT	4	25187	25198	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640368
64	NC_016735	AT	8	25889	25903	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016735	TA	6	26012	26023	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016735	TAA	4	26396	26406	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37640368
67	NC_016735	TAT	4	26762	26773	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640368
68	NC_016735	ATA	4	28506	28517	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016735	AT	6	28684	28694	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016735	AATT	3	29227	29237	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37640368
71	NC_016735	AATT	3	30917	30927	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37640368
72	NC_016735	TTTA	3	31006	31016	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37640368
73	NC_016735	ATA	5	31282	31296	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	37640368
74	NC_016735	AGA	5	31427	31441	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	37640368
75	NC_016735	TTAA	3	32404	32415	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37640368
76	NC_016735	TCG	4	32773	32784	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640368
77	NC_016735	ATTT	3	33597	33607	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37640368
78	NC_016735	TTTA	3	33989	33999	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37640368
79	NC_016735	AATG	3	34553	34563	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37640368
80	NC_016735	AAAT	3	36112	36122	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	37640368
81	NC_016735	TATT	3	36554	36565	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	37640368
82	NC_016735	AATT	3	36649	36659	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37640368
83	NC_016735	TAT	4	37644	37655	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640368
84	NC_016735	TTTAT	4	38268	38287	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
85	NC_016735	AGA	4	38701	38712	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37640368
86	NC_016735	TTTTA	3	41130	41145	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	37640369
87	NC_016735	AAAT	3	41659	41671	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	37640369
88	NC_016735	AAG	4	43468	43479	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	37640369
89	NC_016735	TTTA	3	45077	45087	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37640369
90	NC_016735	AAT	4	45762	45773	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640369
91	NC_016735	TTTA	3	45878	45889	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	37640369
92	NC_016735	GAAA	3	46082	46092	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	37640369
93	NC_016735	TGTT	3	46626	46637	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	37640369
94	NC_016735	A	13	46643	46655	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	37640369
95	NC_016735	GAA	4	46800	46810	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37640369
96	NC_016735	GGGA	3	48111	48123	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016735	GCT	7	48998	49018	21	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	37640370
98	NC_016735	TGC	4	49522	49533	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	37640370
99	NC_016735	TAAA	3	50421	50432	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016735	ATT	5	51115	51128	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016735	TTTC	3	51312	51323	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016735	CAA	4	51563	51574	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	37640370
103	NC_016735	TA	6	55022	55033	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	37640370
104	NC_016735	AGAA	3	56372	56382	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016735	TA	7	56530	56543	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016735	ATTT	3	57001	57011	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016735	TCT	4	57595	57605	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	37640370
108	NC_016735	TGAA	3	57694	57704	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	37640370
109	NC_016735	GCT	4	57867	57878	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	37640370
110	NC_016735	AAAC	3	58221	58232	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	37640370
111	NC_016735	GTTA	3	58380	58390	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016735	TCT	4	59204	59215	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	37640371
113	NC_016735	ATC	4	59281	59292	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	37640371
114	NC_016735	AATT	3	59401	59411	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37640371
115	NC_016735	GAA	4	60050	60060	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	37640371
116	NC_016735	TAAT	3	61762	61773	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016735	TA	6	61895	61905	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016735	AT	6	62116	62126	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37640371
119	NC_016735	TGT	4	62506	62517	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016735	AATT	3	63118	63129	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016735	ATA	4	63212	63223	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640371
122	NC_016735	TTTA	3	63954	63964	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37640371
123	NC_016735	TTAA	3	64619	64629	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37640371
124	NC_016735	TAAAAT	3	65230	65248	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	37640371
125	NC_016735	TTTA	3	65582	65592	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	37640371
126	NC_016735	ATT	4	65750	65761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640371
127	NC_016735	AAATA	3	66606	66620	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	37640371
128	NC_016735	T	14	67352	67365	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	37640371
129	NC_016735	ATT	4	67447	67457	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640371
130	NC_016735	ATA	4	68549	68560	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016735	ATA	4	68697	68707	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	37640371
132	NC_016735	TA	7	68724	68736	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016735	TA	6	68977	68987	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	37640372
134	NC_016735	TAA	4	69295	69307	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	37640372
135	NC_016735	AT	10	69419	69439	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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140	NC_016735	AAAT	4	71998	72012	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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161	NC_016735	TTATA	4	76791	76810	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
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169	NC_016735	TTTA	3	78661	78672	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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250	NC_016735	CTTG	3	120937	120947	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	37640378
251	NC_016735	AAT	4	120966	120977	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640378
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254	NC_016735	TTTC	3	122086	122096	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	37640379
255	NC_016735	TAT	4	122269	122280	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	37640379
256	NC_016735	TTA	4	123315	123325	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	37640379
257	NC_016735	ATTT	3	123520	123532	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	37640379
258	NC_016735	GTAAA	3	124257	124270	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	37640379
259	NC_016735	TAA	4	124827	124838	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	37640379

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Fucus vesiculosus chloroplast