ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Silene vulgaris mitochondrion chromosome 1

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016406	TAAG	3	4161	4172	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016406	TCTT	3	4506	4517	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016406	CTTT	3	4950	4961	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016406	AGGAAT	3	7667	7684	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016406	AAAAG	7	8324	8358	35	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016406	CTTT	3	11721	11732	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016406	TTAAA	3	11759	11773	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016406	CTTC	3	13503	13514	12	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016406	ATA	4	21709	21720	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	35796733
10	NC_016406	TA	6	23682	23693	12	50 %	50 %	0 %	0 %	35796733
11	NC_016406	TTTC	3	24498	24509	12	0 %	75 %	0 %	25 %	35796733
12	NC_016406	TA	6	28089	28100	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016406	CAATA	3	34823	34837	15	60 %	20 %	0 %	20 %	35796732
14	NC_016406	A	12	36725	36736	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016406	TCCTA	3	49428	49442	15	20 %	40 %	0 %	40 %	35796732
16	NC_016406	CTTT	3	50506	50517	12	0 %	75 %	0 %	25 %	35796732
17	NC_016406	CTAG	3	53421	53432	12	25 %	25 %	25 %	25 %	35796732
18	NC_016406	ACTG	3	55252	55263	12	25 %	25 %	25 %	25 %	35796732
19	NC_016406	A	12	55864	55875	12	100 %	0 %	0 %	0 %	35796732
20	NC_016406	AGAA	3	58103	58114	12	75 %	0 %	25 %	0 %	35796732
21	NC_016406	ACGA	3	59507	59518	12	50 %	0 %	25 %	25 %	35796732
22	NC_016406	TA	6	61409	61420	12	50 %	50 %	0 %	0 %	35796732
23	NC_016406	AT	6	64422	64433	12	50 %	50 %	0 %	0 %	35796732
24	NC_016406	TCAGGC	3	66609	66626	18	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	35796732
25	NC_016406	AAGA	3	72036	72047	12	75 %	0 %	25 %	0 %	35796732
26	NC_016406	CTATA	3	73035	73049	15	40 %	40 %	0 %	20 %	35796732
27	NC_016406	TAAAT	3	78569	78583	15	60 %	40 %	0 %	0 %	35796732
28	NC_016406	TAT	4	78586	78597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	35796732
29	NC_016406	T	12	81238	81249	12	0 %	100 %	0 %	0 %	35796732
30	NC_016406	CAAAG	3	82405	82419	15	60 %	0 %	20 %	20 %	35796732
31	NC_016406	CTT	4	84713	84724	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	35796732
32	NC_016406	CTT	4	85846	85857	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	35796732
33	NC_016406	GAA	4	87512	87523	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	35796732
34	NC_016406	AGAAT	4	88092	88111	20	60 %	20 %	20 %	0 %	35796732
35	NC_016406	AAC	4	89091	89102	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	35796732
36	NC_016406	AAGA	3	95437	95448	12	75 %	0 %	25 %	0 %	35796732
37	NC_016406	CTTC	3	97346	97357	12	0 %	50 %	0 %	50 %	35796732
38	NC_016406	GTA	4	102405	102416	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	35796732
39	NC_016406	TA	6	103594	103605	12	50 %	50 %	0 %	0 %	35796732
40	NC_016406	TTCT	3	106096	106107	12	0 %	75 %	0 %	25 %	35796732
41	NC_016406	GAAA	3	112709	112720	12	75 %	0 %	25 %	0 %	35796732
42	NC_016406	TTTA	3	114797	114808	12	25 %	75 %	0 %	0 %	35796732
43	NC_016406	CTTAA	3	117660	117674	15	40 %	40 %	0 %	20 %	35796732
44	NC_016406	T	13	123343	123355	13	0 %	100 %	0 %	0 %	35796732
45	NC_016406	TA	6	123965	123976	12	50 %	50 %	0 %	0 %	35796732
46	NC_016406	TTC	4	127849	127860	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	35796732
47	NC_016406	TAAAT	3	133772	133786	15	60 %	40 %	0 %	0 %	35796732
48	NC_016406	CGAT	3	137071	137082	12	25 %	25 %	25 %	25 %	35796732
49	NC_016406	A	12	142240	142251	12	100 %	0 %	0 %	0 %	35796732
50	NC_016406	ATTAAA	3	142881	142898	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	35796732
51	NC_016406	T	13	148415	148427	13	0 %	100 %	0 %	0 %	35796732
52	NC_016406	AGAA	3	149436	149447	12	75 %	0 %	25 %	0 %	35796732
53	NC_016406	TTA	4	153104	153115	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	35796732
54	NC_016406	AAG	4	154693	154704	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	35796732
55	NC_016406	TATG	3	156118	156129	12	25 %	50 %	25 %	0 %	35796732
56	NC_016406	TATGA	3	159115	159129	15	40 %	40 %	20 %	0 %	35796732
57	NC_016406	ATTAA	3	161670	161684	15	60 %	40 %	0 %	0 %	35796732
58	NC_016406	GAAAA	4	166545	166564	20	80 %	0 %	20 %	0 %	35796732
59	NC_016406	TAT	4	166633	166644	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	35796732
60	NC_016406	AT	6	170229	170240	12	50 %	50 %	0 %	0 %	35796732
61	NC_016406	GGTT	4	174771	174786	16	0 %	50 %	50 %	0 %	35796732
62	NC_016406	GAAAA	4	181353	181372	20	80 %	0 %	20 %	0 %	35796732
63	NC_016406	TAT	4	181441	181452	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	35796732
64	NC_016406	CAAAG	4	183689	183708	20	60 %	0 %	20 %	20 %	35796732
65	NC_016406	GAAAT	6	196612	196641	30	60 %	20 %	20 %	0 %	35796732
66	NC_016406	TCGT	3	199442	199453	12	0 %	50 %	25 %	25 %	35796732
67	NC_016406	ATTGG	3	199573	199587	15	20 %	40 %	40 %	0 %	35796732
68	NC_016406	CTTT	3	204102	204113	12	0 %	75 %	0 %	25 %	35796732
69	NC_016406	GCAAAG	4	213001	213024	24	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	35796732
70	NC_016406	TAATA	3	214560	214574	15	60 %	40 %	0 %	0 %	35796732
71	NC_016406	TTTAA	3	220486	220500	15	40 %	60 %	0 %	0 %	35796732
72	NC_016406	AAAG	3	220527	220538	12	75 %	0 %	25 %	0 %	35796732
73	NC_016406	TCCTA	3	225936	225950	15	20 %	40 %	0 %	40 %	35796732
74	NC_016406	TAAGTA	3	228955	228972	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	35796732
75	NC_016406	AAGGA	3	232400	232414	15	60 %	0 %	40 %	0 %	35796732
76	NC_016406	TTATA	3	242504	242518	15	40 %	60 %	0 %	0 %	35796732
77	NC_016406	TAT	4	242788	242799	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	35796732
78	NC_016406	TCCTA	3	246562	246576	15	20 %	40 %	0 %	40 %	35796732
79	NC_016406	TATAT	3	252540	252554	15	40 %	60 %	0 %	0 %	35796732
80	NC_016406	CTTT	3	262328	262339	12	0 %	75 %	0 %	25 %	35796732
81	NC_016406	CCGC	3	275487	275498	12	0 %	0 %	25 %	75 %	35796732
82	NC_016406	AGGAT	3	282756	282770	15	40 %	20 %	40 %	0 %	35796732
83	NC_016406	TA	6	288731	288742	12	50 %	50 %	0 %	0 %	35796732
84	NC_016406	TAGCA	3	291934	291948	15	40 %	20 %	20 %	20 %	35796732
85	NC_016406	GGCC	3	293123	293134	12	0 %	0 %	50 %	50 %	35796732
86	NC_016406	CCCAA	6	294447	294476	30	40 %	0 %	0 %	60 %	35796732
87	NC_016406	AAACTA	3	295012	295029	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	35796732
88	NC_016406	AGAA	3	298932	298943	12	75 %	0 %	25 %	0 %	35796732
89	NC_016406	TGCC	3	303510	303521	12	0 %	25 %	25 %	50 %	35796732
90	NC_016406	ATC	4	306978	306989	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	35796732
91	NC_016406	GA	7	309949	309962	14	50 %	0 %	50 %	0 %	35796732
92	NC_016406	TA	6	324628	324639	12	50 %	50 %	0 %	0 %	35796732
93	NC_016406	CTA	4	325816	325827	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	35796732
94	NC_016406	TTAAA	3	329289	329303	15	60 %	40 %	0 %	0 %	35796732
95	NC_016406	ATA	4	331652	331663	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	35796732
96	NC_016406	ATTTA	3	334145	334159	15	40 %	60 %	0 %	0 %	35796732
97	NC_016406	TAG	4	336703	336714	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	35796732
98	NC_016406	TAG	5	336793	336807	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	35796732
99	NC_016406	AGGT	3	337065	337076	12	25 %	25 %	50 %	0 %	35796732
100	NC_016406	AAG	4	339106	339117	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	35796732
101	NC_016406	CTTT	3	342786	342797	12	0 %	75 %	0 %	25 %	35796732
102	NC_016406	TAA	4	343381	343392	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	35796732
103	NC_016406	GTA	4	348120	348131	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	35796732
104	NC_016406	TA	6	349309	349320	12	50 %	50 %	0 %	0 %	35796732
105	NC_016406	ATTGT	10	355515	355564	50	20 %	60 %	20 %	0 %	35796732
106	NC_016406	GAAA	3	367167	367178	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016406	GCC	4	380736	380747	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016406	TTTAA	3	385708	385722	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016406	ATA	4	385729	385740	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016406	ATA	4	387920	387931	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016406	ATA	4	389742	389753	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Silene vulgaris mitochondrion chromosome 1