ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 54

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016400	CTG	4	86	97	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016400	CAA	4	218	229	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016400	AAAG	3	306	316	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016400	GCTT	3	897	907	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016400	TACT	3	1728	1739	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016400	TA	7	2481	2493	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016400	TTAC	4	3116	3131	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016400	ATTT	3	4774	4784	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016400	ATT	4	5853	5864	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016400	GTA	4	8366	8376	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016400	TTA	4	8830	8841	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016400	AAAT	3	9095	9107	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016400	AGA	4	9786	9796	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016400	CTT	4	11676	11688	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
15	NC_016400	CTT	4	12129	12140	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016400	ATT	4	12299	12310	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016400	TAG	4	12417	12427	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016400	GCTT	3	13227	13238	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016400	ATG	4	13705	13715	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016400	TA	6	13890	13900	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016400	TAG	4	13924	13934	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016400	CTGG	3	16033	16043	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016400	CTTC	3	16339	16351	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016400	TCTA	3	16833	16843	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016400	CTTC	3	17100	17112	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016400	AAGAC	3	19200	19214	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016400	CTT	4	19243	19254	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016400	T	17	19445	19461	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_016400	AAAG	3	20047	20057	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016400	TAAA	3	20557	20567	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016400	ATA	4	20758	20769	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016400	T	12	20868	20879	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016400	ATTTC	3	21942	21957	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016400	TAA	4	23241	23251	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016400	T	12	23967	23978	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016400	T	13	25347	25359	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016400	GTA	4	25616	25627	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016400	CCGA	3	26047	26058	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016400	ACT	4	26772	26782	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016400	CTTT	3	26993	27004	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016400	TTCTT	3	28939	28952	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016400	T	15	29632	29646	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016400	CCCT	3	29964	29974	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016400	A	14	30770	30783	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016400	TTC	4	31816	31826	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016400	TCCT	4	32458	32473	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016400	AAG	4	33378	33389	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016400	T	14	33463	33476	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016400	CTT	4	33820	33831	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016400	AGCA	3	34594	34606	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016400	GTG	4	34767	34777	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016400	AGTA	3	35858	35869	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016400	TCT	4	36246	36257	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016400	TA	6	37217	37228	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016400	CTTG	3	37349	37360	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016400	TA	6	37726	37736	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016400	CAG	4	37985	37996	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016400	AAG	5	38569	38583	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016400	TTATA	3	39992	40006	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016400	TA	6	40225	40235	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016400	A	12	41290	41301	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016400	AAAT	3	41310	41322	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016400	TTTG	3	41777	41788	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016400	AT	6	41910	41920	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016400	ATTG	3	42261	42272	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016400	GTAA	3	44981	44991	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016400	T	16	45507	45522	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_016400	TCTT	3	45713	45723	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016400	TGC	4	47092	47103	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016400	TAAAA	3	47380	47393	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_016400	AACT	3	47800	47810	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016400	TA	6	52104	52116	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016400	AGGA	3	52245	52256	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016400	CT	6	52864	52874	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016400	GAAA	3	53278	53288	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016400	TA	8	54982	54997	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016400	G	13	55490	55502	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016400	AAG	4	55747	55757	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016400	CTTT	3	56172	56182	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016400	ATT	4	56873	56884	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016400	TTA	4	57391	57402	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016400	TTA	4	57970	57981	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016400	ATA	4	59035	59046	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016400	CATA	3	60000	60011	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016400	CTT	5	60263	60276	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016400	ACT	4	60663	60673	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016400	AACA	3	60713	60724	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016400	AAG	4	61456	61466	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016400	AAAT	3	61726	61737	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016400	AAAG	3	61739	61750	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016400	CT	6	61760	61770	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016400	CATT	3	61907	61917	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016400	TCCA	3	62077	62089	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016400	TACTT	3	62619	62632	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016400	AAAG	3	62849	62859	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016400	ATGTC	3	63340	63355	16	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
97	NC_016400	TCCT	3	63485	63495	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016400	CTAT	3	65857	65868	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016400	GAAA	3	67340	67350	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016400	A	16	67693	67708	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016400	CTTT	3	67712	67722	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016400	CTCC	3	71591	71602	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016400	GAAA	3	73427	73437	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016400	CTTT	3	73913	73923	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016400	CAAG	3	74291	74301	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016400	TCT	4	75561	75572	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016400	CTTT	3	76065	76076	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016400	CAG	4	76747	76758	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016400	AAGG	3	77128	77139	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016400	AAC	5	77849	77863	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016400	AATT	3	78707	78718	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016400	AAG	4	78869	78880	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016400	T	12	80719	80730	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016400	AAG	4	80757	80768	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016400	AAG	4	81175	81186	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016400	GTTC	3	82387	82397	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016400	A	13	83450	83462	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016400	TAAA	3	84036	84047	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016400	CTTT	3	84280	84290	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016400	TCT	4	84577	84588	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016400	GAAT	3	85160	85171	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016400	GAA	4	85620	85631	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016400	AAAG	3	86933	86943	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016400	GCT	4	88510	88521	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016400	AGA	4	89368	89379	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

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