ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 30

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016354	TTTA	3	122	133	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016354	TTCT	3	306	317	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016354	TA	6	1765	1775	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016354	TTCTCA	3	2753	2770	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016354	CCT	4	3149	3159	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016354	CTTT	3	3362	3373	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016354	TGA	4	3572	3583	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016354	ATCT	3	4188	4198	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016354	AAG	4	4273	4285	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016354	TAT	4	4850	4861	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016354	ATTG	3	5335	5346	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016354	CTTT	3	6300	6310	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016354	AGAA	3	6896	6907	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016354	AAAGG	3	7019	7033	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_016354	T	13	7573	7585	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016354	TCT	4	8678	8689	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016354	TTA	4	9586	9597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016354	TA	6	9955	9966	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016354	ATA	4	9970	9980	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016354	GAAAAA	3	10384	10401	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_016354	CTTT	3	10974	10985	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016354	TA	6	11100	11110	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016354	TA	6	11308	11318	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016354	A	12	11910	11921	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016354	TTA	4	13634	13645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016354	A	13	14710	14722	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016354	ATAG	3	17399	17409	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016354	TTA	4	17749	17760	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016354	AAAT	3	18414	18426	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016354	TA	7	18672	18684	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016354	CTT	4	19837	19848	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016354	GAAA	3	20266	20277	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016354	ACT	4	21011	21022	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016354	TTC	4	21057	21068	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016354	TA	7	21143	21158	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016354	AAGC	3	21859	21869	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016354	GAT	4	22043	22054	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016354	AAG	4	23461	23471	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016354	CCAC	3	23571	23581	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016354	CTA	5	23751	23764	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016354	AG	6	24056	24067	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016354	TAA	4	24419	24430	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016354	AC	6	24795	24805	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016354	CTA	4	26842	26853	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016354	CTT	4	27545	27556	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016354	TAG	4	27604	27614	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016354	CTT	4	29351	29361	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016354	TCT	4	29467	29478	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016354	CAAG	3	29568	29580	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016354	T	12	29717	29728	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016354	TAAA	3	30721	30732	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016354	T	19	30862	30880	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_016354	AGCT	3	31533	31543	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016354	TTA	4	32115	32125	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016354	CATT	3	32149	32160	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016354	ATCT	3	32965	32975	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016354	ATCC	3	33542	33553	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016354	CAAG	3	34041	34052	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016354	AAGT	3	36688	36699	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016354	TTTC	3	38052	38062	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016354	A	12	39075	39086	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016354	AAG	4	39342	39353	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016354	CAAG	4	40212	40228	17	50 %	0 %	25 %	25 %	5 %	Non-Coding
64	NC_016354	TTC	5	40450	40464	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016354	ACT	5	41346	41359	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016354	AAAAG	3	41502	41516	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_016354	CAT	4	43503	43514	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016354	AAAC	4	43613	43628	16	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
69	NC_016354	CTTT	3	43706	43717	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016354	AGA	5	44074	44091	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_016354	CTT	4	44123	44133	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016354	AAAGA	3	44693	44706	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016354	TCT	4	44804	44815	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016354	TCT	4	45218	45228	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016354	CTTA	3	45328	45340	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016354	AGA	4	46028	46040	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016354	CTTT	3	46608	46619	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016354	CTT	4	47118	47129	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016354	TCT	4	47395	47406	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016354	TA	6	47811	47821	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016354	TCTTA	3	47852	47865	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016354	TCCC	3	48545	48556	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016354	AGA	4	48685	48695	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016354	ACAAAG	3	49085	49101	17	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
85	NC_016354	CAT	4	49114	49124	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016354	AT	9	50153	50170	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
87	NC_016354	TGAA	3	50307	50317	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016354	GAGG	3	50778	50789	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016354	GTA	4	51071	51081	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016354	GCTA	3	51404	51414	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016354	GGAA	3	52117	52129	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016354	A	14	52223	52236	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016354	TTCC	3	52979	52989	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016354	TTC	4	53541	53552	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016354	TCT	5	53580	53594	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
96	NC_016354	GAAA	3	54029	54039	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016354	TC	6	54355	54366	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016354	ATA	4	54480	54490	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016354	TCA	4	54807	54818	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016354	AAAG	3	56027	56037	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016354	A	17	56615	56631	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
102	NC_016354	GAAA	3	57252	57264	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016354	TATT	3	57644	57655	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016354	AGTG	3	58238	58249	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016354	T	17	58296	58312	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
106	NC_016354	AGT	4	59788	59798	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016354	CTA	4	60219	60229	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016354	AGA	6	60915	60932	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016354	ATA	4	62199	62211	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016354	AAAAGA	3	63245	63262	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
111	NC_016354	CATAG	3	63295	63309	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016354	TA	6	63707	63719	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016354	ATA	4	64544	64555	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016354	AGC	4	64772	64782	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016354	ATA	4	65018	65029	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016354	TAA	4	65745	65755	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016354	CTTT	3	65904	65914	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016354	CAATG	3	66529	66544	16	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
119	NC_016354	TTG	4	68533	68543	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016354	AT	6	69651	69662	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016354	AT	6	70614	70626	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016354	TA	6	71338	71348	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016354	GTCT	3	71776	71787	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016354	AT	6	72456	72466	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016354	TA	6	72797	72807	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016354	TA	6	73642	73652	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016354	TAAC	4	73865	73880	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
128	NC_016354	GCAA	3	75048	75058	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016354	A	12	77302	77313	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016354	AAAG	3	77365	77375	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016354	CAT	4	78534	78544	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016354	CTTT	3	81181	81192	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016354	AGA	4	81325	81335	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016354	TAA	4	81498	81508	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016354	AGA	4	81523	81535	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016354	GAAA	3	81674	81684	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016354	CTCA	3	81873	81884	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016354	TTCT	3	84602	84613	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016354	AGA	4	84800	84810	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016354	ATTATA	3	87309	87325	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
141	NC_016354	GTA	4	87420	87431	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016354	ATAG	4	87627	87641	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
143	NC_016354	TGCTT	3	88409	88422	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016354	CTG	5	89430	89444	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
145	NC_016354	CCA	4	91194	91205	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
146	NC_016354	GTCA	3	91605	91615	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016354	AG	6	93520	93531	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
148	NC_016354	A	17	93667	93683	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
149	NC_016354	AACA	3	98132	98143	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016354	ATTC	3	98294	98304	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
151	NC_016354	TAGA	3	98584	98594	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
152	NC_016354	AAAGA	3	98699	98712	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
153	NC_016354	CTT	4	100181	100192	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
154	NC_016354	AAGG	3	102963	102973	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
155	NC_016354	TGAA	3	103923	103933	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
156	NC_016354	CT	6	104808	104818	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
157	NC_016354	ACT	4	105407	105417	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
158	NC_016354	GAAA	3	105654	105665	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
159	NC_016354	TA	6	107449	107459	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 30