ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 43

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016351	TCT	4	792	804	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016351	G	14	958	971	14	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016351	TAA	4	1652	1662	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016351	ATA	4	2948	2958	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016351	TAAG	4	3072	3087	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016351	AGA	4	3392	3403	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016351	TTCT	3	4069	4080	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016351	TCT	4	5554	5566	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016351	CTT	4	5605	5615	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016351	TCT	5	6535	6550	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016351	TA	8	7417	7431	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016351	TTTC	3	7481	7492	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016351	ATTA	3	7653	7664	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016351	AAAT	3	8216	8226	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016351	CTT	4	10780	10792	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016351	TAT	4	10857	10868	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016351	TAGA	3	10917	10929	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016351	TTC	4	11537	11549	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016351	AAGGGG	3	12882	12900	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
20	NC_016351	ATT	4	13133	13143	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016351	ATTTTT	3	13747	13764	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_016351	ATA	4	15411	15421	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016351	AGGT	3	16232	16242	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016351	TCT	4	16343	16354	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016351	ATTA	3	17973	17984	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016351	CTT	4	18064	18075	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016351	TTCA	3	19418	19428	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016351	AAAG	3	19437	19448	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016351	CAT	4	19944	19954	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016351	CTTT	3	20806	20816	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016351	G	12	21474	21485	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016351	ATAAA	3	21783	21798	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016351	TA	7	21809	21821	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016351	TGT	4	21843	21854	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016351	TTAT	3	22177	22188	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016351	CTTA	3	22546	22556	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016351	ATT	4	23257	23268	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016351	TTA	4	23802	23812	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016351	ATCT	3	24266	24278	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016351	TGCT	3	24654	24665	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016351	TTTG	3	25001	25011	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016351	AT	7	25632	25644	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016351	CTT	4	26532	26543	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016351	TA	6	26940	26950	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016351	TAA	5	27473	27487	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016351	GAT	4	29082	29092	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016351	GAAA	3	29673	29684	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016351	TAT	4	31519	31530	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016351	ATT	4	32345	32355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016351	GAA	4	32916	32928	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016351	GTATT	3	33582	33595	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016351	GGGT	3	35164	35175	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016351	T	13	35670	35682	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016351	TAA	6	35776	35792	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_016351	TTC	4	37761	37772	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016351	ATA	8	38582	38603	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016351	TTCT	3	39573	39584	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016351	CAA	4	40529	40540	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016351	TAAG	3	40669	40679	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016351	TAG	5	41030	41044	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_016351	ATTT	3	41112	41123	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016351	AAGA	3	41162	41172	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016351	TAT	4	41458	41469	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016351	TA	8	43130	43144	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016351	TA	6	44942	44953	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016351	AAGA	3	45568	45578	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016351	GGC	4	45583	45593	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016351	GCCA	3	45960	45971	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016351	TA	7	46588	46602	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016351	CTTG	3	46760	46770	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016351	ATC	4	46865	46876	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016351	GAAA	3	47001	47011	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016351	GCTT	3	47798	47809	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016351	T	17	48164	48180	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_016351	CCTT	3	49342	49353	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	35805105
76	NC_016351	CTT	5	49442	49455	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35805105
77	NC_016351	GAAT	3	51298	51309	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016351	TTC	4	51451	51461	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016351	GAA	5	52448	52463	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016351	TGGA	3	52487	52499	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016351	TA	7	52983	52995	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016351	AAG	4	53361	53371	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016351	ATAG	3	55097	55108	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016351	TTA	4	55450	55461	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016351	TCT	4	56072	56082	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016351	AATAC	3	58781	58794	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016351	CTT	4	61080	61090	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016351	AAG	4	62307	62318	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016351	TA	6	62541	62552	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016351	GAAA	3	63553	63564	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016351	A	13	64201	64213	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016351	GAAA	3	64808	64818	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016351	TA	6	64918	64928	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016351	CTTTT	3	64957	64971	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016351	GA	7	65144	65156	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016351	AAT	4	65422	65433	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016351	GCAA	3	65524	65535	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016351	TA	8	67591	67605	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016351	AAAG	3	69300	69310	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016351	AAGG	3	71761	71772	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016351	CTT	5	71811	71825	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016351	TAT	4	72009	72019	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016351	A	18	72851	72868	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
104	NC_016351	GA	6	72969	72979	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016351	AAAT	3	73059	73069	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016351	TAAGA	3	73930	73944	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016351	GA	6	74187	74198	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016351	TAA	4	74686	74698	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016351	TAA	4	74852	74864	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016351	A	16	75616	75631	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016351	TACT	3	75782	75793	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016351	TCT	4	75877	75888	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016351	ATGA	3	76094	76106	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_016351	AAAG	3	76713	76724	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016351	AGA	4	77429	77440	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016351	AGCG	3	78158	78169	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016351	T	15	78524	78538	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016351	TTTTA	3	78753	78766	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016351	ATGC	3	79767	79778	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016351	AGGA	3	80359	80369	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016351	CTT	4	84037	84049	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016351	T	12	84928	84939	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016351	TAT	4	86140	86150	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016351	AAAG	3	86427	86437	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016351	TCGA	3	87193	87203	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016351	GGAA	3	87314	87324	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016351	GCA	4	87445	87455	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016351	GTA	4	87582	87593	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016351	AGA	4	90291	90301	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016351	TAAG	3	90355	90365	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016351	TCAAT	3	90516	90530	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016351	AAGT	3	90989	90999	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016351	GAA	4	91200	91211	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016351	GA	7	92789	92801	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016351	TTA	4	92835	92846	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016351	GAT	4	93611	93622	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016351	TTCA	3	93700	93710	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016351	TCTTT	3	93711	93724	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016351	AAGCCA	3	94001	94017	17	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
140	NC_016351	TTAGT	3	96003	96016	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016351	TTGA	3	96224	96234	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016351	AT	6	96312	96322	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 43