ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 17

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016346	ATT	4	114	125	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016346	CT	6	1157	1167	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016346	AAAG	3	2820	2831	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016346	TTATG	3	3604	3619	16	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_016346	AGA	5	3646	3659	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016346	TTA	5	4210	4224	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016346	AGAA	3	4946	4957	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016346	TA	6	6027	6039	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016346	CTTT	3	6078	6089	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016346	CTTT	3	7224	7234	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016346	CTT	4	7292	7303	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016346	AGA	4	9041	9053	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016346	CTA	4	9061	9072	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016346	TA	6	9492	9503	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016346	ATTTT	3	10629	10644	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016346	ATT	4	11968	11979	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016346	AGA	4	13104	13116	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016346	ATA	4	13398	13408	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016346	G	12	14836	14847	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016346	TTATAG	3	15455	15471	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_016346	CATG	3	15549	15560	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016346	GAAAA	3	16729	16742	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016346	TTA	4	17667	17677	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016346	AAAGG	3	18003	18017	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016346	TAT	4	18207	18217	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016346	CTTC	4	18359	18373	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016346	AGA	4	18838	18849	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016346	CTC	4	19486	19496	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016346	AGTT	3	20007	20017	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016346	AG	6	20226	20237	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016346	ATA	4	20438	20448	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016346	TTGC	3	20581	20591	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016346	TTAA	3	20665	20676	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016346	ACTT	3	20883	20893	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016346	ATCT	3	21127	21138	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016346	TTTC	3	22336	22347	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016346	GAA	4	23346	23357	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016346	TTA	4	24345	24355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016346	AAG	4	24939	24949	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016346	TA	6	25082	25092	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016346	TA	7	25112	25124	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016346	TAG	4	25417	25428	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016346	TAG	4	26231	26242	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016346	AAG	4	26419	26431	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016346	TTA	4	27035	27047	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016346	TCTT	3	27239	27250	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016346	TGAGA	3	27540	27553	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016346	TA	6	28755	28765	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016346	TACA	3	28819	28829	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016346	ACT	4	29119	29129	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016346	TAAG	3	29391	29402	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016346	CTTT	3	29563	29573	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016346	TTAC	3	29827	29837	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016346	AAAGA	3	30127	30141	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016346	TA	6	30437	30447	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016346	GAA	4	31123	31134	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016346	CAT	4	31250	31261	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016346	TCCA	3	33901	33911	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016346	GGAAA	3	34072	34085	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016346	A	12	34618	34629	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016346	TAC	4	35577	35587	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016346	GCTTC	3	36233	36246	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016346	AAAG	3	36419	36429	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016346	CCTT	3	36452	36463	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016346	CTTG	3	36967	36979	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016346	AAAG	3	37383	37394	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016346	TTTC	3	37690	37701	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016346	ACT	4	38719	38730	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016346	AT	6	39889	39899	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016346	A	16	39972	39987	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_016346	CTCA	3	41188	41200	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016346	TATTT	3	41775	41789	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016346	AGA	4	42052	42064	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016346	AGA	4	42431	42441	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016346	CGGGT	3	44058	44071	14	0 %	20 %	60 %	20 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016346	TTCG	3	45365	45376	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016346	AAAG	3	46275	46285	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016346	TTCC	3	46409	46420	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016346	TA	8	47439	47453	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016346	T	14	47514	47527	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016346	ACTG	3	47751	47762	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016346	TGA	4	48199	48210	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016346	CCT	4	48411	48421	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016346	GAAA	3	48528	48539	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016346	CTTT	3	49116	49127	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016346	AGC	4	49872	49884	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016346	GA	6	50817	50827	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016346	TTTC	3	51331	51343	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016346	GTCA	3	51511	51521	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016346	AATC	3	51582	51592	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016346	TA	11	51664	51685	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016346	TTAAA	3	52095	52108	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016346	TA	6	52325	52336	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016346	TTTAT	4	53664	53682	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
95	NC_016346	AATG	3	53696	53707	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016346	GTTT	4	54250	54266	17	0 %	75 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_016346	CAAGTA	3	55496	55512	17	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
98	NC_016346	ATT	5	55554	55568	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_016346	AAAG	3	56225	56235	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016346	TCTTT	3	56330	56343	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016346	CTTT	3	56776	56787	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016346	T	18	56864	56881	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_016346	TCT	4	57218	57228	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016346	AAAG	3	57771	57782	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016346	CTTA	3	58836	58847	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016346	ATTT	3	59037	59048	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016346	AAG	4	59658	59669	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016346	TCT	4	60420	60430	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016346	TTA	4	60595	60605	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016346	CAA	4	60691	60702	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016346	TGTAGA	3	60919	60937	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
112	NC_016346	TTA	4	61390	61402	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016346	A	12	61623	61634	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016346	T	13	62200	62212	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016346	GTAAAA	3	62351	62369	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
116	NC_016346	CCA	4	62449	62460	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016346	TTATT	3	62514	62529	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
118	NC_016346	GCTC	3	62805	62815	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016346	AATCAA	3	62929	62946	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
120	NC_016346	ATAA	3	63882	63892	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016346	TTGC	3	63947	63958	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016346	TGG	4	64330	64341	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016346	AAGC	3	64827	64837	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016346	GAT	4	66689	66700	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016346	GAG	4	67531	67541	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016346	TAT	4	67583	67593	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016346	TTAT	3	67779	67789	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016346	ACT	4	68100	68111	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016346	TC	6	68750	68760	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016346	CTT	4	69106	69116	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016346	CTTTT	3	69226	69240	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
132	NC_016346	TAACA	3	71295	71309	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016346	TAT	4	72325	72335	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016346	ATTCT	3	73589	73602	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016346	AAGA	3	74569	74580	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016346	AACT	3	77414	77425	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016346	ATC	4	77471	77481	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016346	TA	6	77976	77986	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016346	ATA	4	78171	78181	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016346	TAATA	3	80666	80680	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
141	NC_016346	AGG	4	84021	84032	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016346	A	12	84856	84867	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016346	GA	7	85016	85029	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
144	NC_016346	TAATTA	3	85236	85253	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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147	NC_016346	TC	6	85665	85675	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016346	TGGA	3	85689	85700	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
149	NC_016346	AG	8	87103	87118	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
150	NC_016346	TTTC	3	88136	88147	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016346	AGTA	3	88560	88572	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
152	NC_016346	CTTT	3	88581	88592	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
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154	NC_016346	ATAAT	4	89635	89653	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
155	NC_016346	TCTT	3	90290	90301	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016346	TCA	4	90669	90680	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
157	NC_016346	TA	7	91667	91679	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
158	NC_016346	AAAG	4	93335	93350	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
159	NC_016346	TCTTTC	3	93755	93772	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
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161	NC_016346	CTTT	3	95175	95185	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
162	NC_016346	AAAT	3	95682	95693	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
163	NC_016346	GATC	3	95717	95727	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
164	NC_016346	AGAA	3	97117	97127	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
165	NC_016346	CTTT	3	97323	97333	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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167	NC_016346	CTTA	3	98749	98760	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
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177	NC_016346	CTTTA	3	107007	107021	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
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182	NC_016346	TTA	5	110795	110808	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
183	NC_016346	GAAAAA	3	111621	111638	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
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192	NC_016346	CTT	4	116023	116034	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
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195	NC_016346	TTAG	3	117952	117963	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
196	NC_016346	GTA	4	118800	118810	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
197	NC_016346	GATA	3	119602	119613	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
198	NC_016346	TA	6	120541	120551	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
199	NC_016346	TCTT	3	120677	120688	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
200	NC_016346	GAAT	3	123562	123573	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
201	NC_016346	CTTT	3	124726	124736	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
202	NC_016346	GTAA	3	125064	125075	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
203	NC_016346	CAAGTA	3	125497	125513	17	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
204	NC_016346	CCT	4	127292	127302	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
205	NC_016346	GGA	4	127597	127607	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 17