ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 12

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016345	AGA	4	1408	1418	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016345	TAT	4	1680	1690	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016345	CTC	4	2090	2100	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016345	AAAG	3	2233	2243	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016345	GGAA	3	2437	2448	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016345	TTAA	3	3329	3340	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016345	A	13	3830	3842	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016345	CCTTC	3	4690	4705	16	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
9	NC_016345	GTT	4	6803	6814	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016345	CAAG	3	6939	6949	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016345	CCTATA	3	6950	6966	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
12	NC_016345	TA	6	7578	7588	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016345	GAA	4	9143	9154	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016345	AG	6	9455	9466	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016345	TAA	4	10912	10923	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016345	TA	11	12076	12096	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016345	ACTG	3	12150	12161	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016345	AG	6	13261	13271	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016345	AAGAGA	3	13278	13295	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_016345	CTT	4	14403	14414	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016345	GGAA	3	14821	14833	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016345	TA	6	14938	14949	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016345	CTTT	3	15096	15107	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016345	AG	6	16260	16270	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016345	GCCT	3	16656	16666	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016345	GCA	4	16771	16781	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016345	TCTT	4	17708	17723	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016345	AAATT	3	18531	18546	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016345	TGAAA	3	18671	18684	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016345	TTTATA	3	19875	19892	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_016345	TAAAT	3	20908	20921	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016345	ATCT	3	21250	21260	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016345	AAT	4	21468	21478	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016345	AGGAA	3	21698	21711	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_016345	TCT	4	22653	22664	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016345	CAAT	3	23829	23840	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016345	GGGT	3	23963	23974	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016345	TACT	3	24072	24084	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016345	TCCAGT	3	24561	24578	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
40	NC_016345	T	12	25162	25173	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016345	TA	6	25284	25294	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016345	T	16	27399	27414	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_016345	GGAAAA	3	27917	27934	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_016345	AGA	7	28443	28462	20	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	Non-Coding
45	NC_016345	TTC	4	28496	28507	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016345	T	15	30047	30061	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016345	TTTC	3	30101	30111	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016345	AGAT	3	30231	30242	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016345	AAG	4	30897	30908	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016345	TAAA	3	31454	31465	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016345	AAAG	3	31718	31729	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016345	TC	6	33031	33042	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016345	TAA	4	33510	33522	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016345	T	12	36022	36033	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016345	GAAA	3	37505	37516	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016345	TTGC	3	37853	37863	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016345	ATT	4	39214	39225	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016345	TA	6	39688	39698	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016345	CTTT	3	39725	39735	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016345	TAT	4	39807	39819	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016345	TATC	3	40983	40993	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016345	GAAA	3	41710	41721	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016345	GATT	3	41856	41866	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016345	GTCC	3	42162	42172	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016345	TAAAG	3	42379	42393	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016345	TACA	3	42447	42457	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016345	AGC	4	43181	43192	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016345	CTA	4	45879	45889	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016345	AAAG	3	46211	46222	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016345	AAT	4	46327	46337	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016345	T	14	47588	47601	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016345	TCAA	3	47658	47669	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016345	TA	6	47674	47684	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016345	AAGGT	3	47824	47839	16	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_016345	ATT	4	48265	48275	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016345	CCT	4	48493	48503	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016345	CTTT	3	49259	49269	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016345	AAGC	3	49704	49715	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016345	TCTTAT	3	51836	51854	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
80	NC_016345	TCTT	3	53954	53964	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016345	TA	11	54231	54252	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016345	ATA	4	54250	54260	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016345	GCAAA	3	54309	54322	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016345	A	14	54617	54630	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016345	CTT	4	54673	54683	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016345	GAAT	3	54938	54948	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016345	A	25	56484	56508	25	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016345	GAACAA	4	56812	56837	26	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016345	ATT	4	57339	57350	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016345	TCT	4	57863	57877	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
91	NC_016345	TTA	4	58358	58369	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016345	AAC	4	60010	60021	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016345	TAA	4	60605	60616	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016345	CCTTAT	3	62377	62394	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
95	NC_016345	AAAG	3	63084	63094	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016345	CTTAT	3	63335	63349	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
97	NC_016345	TA	7	63351	63364	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016345	ATTT	3	63474	63485	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016345	TTC	5	63702	63715	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016345	AGAC	3	64243	64253	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016345	TCCT	3	65656	65667	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016345	TC	6	65994	66005	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016345	GAG	4	67750	67761	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016345	CAGA	3	67951	67963	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016345	TCA	4	68454	68464	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016345	ACT	4	68552	68562	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016345	TA	6	68907	68917	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016345	ATCC	3	69365	69376	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016345	GATA	3	69431	69442	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016345	ATA	4	69502	69514	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016345	GCT	4	69698	69708	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016345	CTT	4	69983	69994	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016345	CTTT	3	70084	70095	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016345	TCA	4	70557	70568	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016345	GCA	4	70861	70872	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016345	AGC	4	72400	72411	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016345	ATTA	3	72893	72903	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016345	TAAT	3	72987	72998	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016345	TC	6	73269	73280	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016345	GAA	4	73419	73430	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016345	CTTT	3	74049	74060	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016345	GAG	4	74643	74654	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016345	TTAT	3	75116	75127	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016345	TGAA	3	75180	75191	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016345	TCT	4	75502	75512	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016345	AGA	4	75996	76008	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016345	TTTG	3	76153	76164	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016345	CTA	4	76311	76322	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016345	A	12	77013	77024	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016345	GGA	4	77639	77650	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016345	AGAA	3	77858	77869	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016345	TA	6	78530	78540	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016345	CTATTT	3	80613	80630	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
134	NC_016345	AAG	4	80909	80919	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016345	T	12	81021	81032	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016345	A	14	81658	81671	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016345	TTCT	3	81959	81970	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016345	GCTTC	3	82069	82083	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
139	NC_016345	TTTA	3	82213	82223	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016345	TA	6	82563	82573	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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182	NC_016345	TGTC	3	116046	116057	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
183	NC_016345	AAGA	3	118334	118345	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_016345	A	13	133698	133710	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
205	NC_016345	ACA	4	133779	133791	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene noctiflora mitochondrion chromosome 12