ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 49

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016339	TACCC	3	404	418	15	20 %	20 %	0 %	60 %	6 %	35796728
2	NC_016339	AGAAA	3	1741	1754	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016339	CT	8	3994	4008	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016339	AGAA	3	4055	4066	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016339	AAAG	4	4366	4381	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016339	TGATC	3	5043	5056	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016339	GTTA	3	5280	5291	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016339	TCT	4	8023	8034	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016339	ACTA	3	8939	8949	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016339	CTT	4	9115	9126	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016339	CTT	4	9164	9175	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016339	TTCT	3	9680	9691	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016339	GTA	4	9711	9721	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016339	AT	6	10646	10656	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016339	GTCA	3	10973	10983	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016339	ACC	4	12104	12116	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016339	TAG	4	12631	12642	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016339	TCT	4	13257	13268	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016339	AGC	4	13573	13583	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016339	GATT	3	14965	14975	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016339	TCTT	3	15205	15216	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016339	TA	11	15918	15940	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016339	TTTG	3	16677	16688	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016339	GAA	4	17702	17713	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016339	AGA	5	18185	18198	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016339	CG	6	18500	18511	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016339	ACTC	3	19916	19926	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016339	GAAA	3	20065	20076	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016339	GAA	4	20743	20754	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016339	CTTT	3	21035	21047	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016339	TAG	4	21311	21323	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016339	AAG	4	21353	21366	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016339	AAAG	3	21420	21430	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016339	GAAA	3	21667	21678	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016339	TA	6	22089	22100	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016339	CTA	4	22315	22325	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016339	CGG	4	22592	22602	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016339	AT	6	23100	23111	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016339	CGT	4	24552	24562	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016339	TTC	4	25567	25579	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016339	AGA	4	25947	25957	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016339	CTTT	3	26176	26188	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016339	TA	7	26376	26388	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016339	TAT	4	26852	26862	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016339	AG	6	28613	28624	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016339	AAC	4	29305	29317	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016339	AAG	4	31474	31484	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016339	CAT	4	32590	32601	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016339	AAG	4	33368	33378	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016339	AGA	4	33399	33410	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016339	TACT	3	34684	34694	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016339	AGT	4	34982	34993	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016339	AAGT	3	35109	35119	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016339	AG	6	35379	35389	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016339	TAA	4	36505	36516	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016339	ATAA	3	36732	36743	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016339	GCCT	3	37135	37146	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016339	AAG	4	38747	38758	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016339	AG	6	39526	39536	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016339	CTTC	3	41710	41721	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016339	AGCT	3	41734	41745	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016339	TA	7	42584	42596	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016339	CT	6	43411	43422	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016339	CTG	4	44389	44400	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016339	AG	6	44493	44503	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016339	TA	7	45191	45203	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016339	AGC	4	45243	45254	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016339	AAAG	3	45788	45798	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016339	AAAG	3	46464	46474	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016339	CT	6	46844	46854	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016339	CT	6	46928	46938	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016339	TCT	4	47544	47555	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016339	CCAG	3	47717	47728	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016339	ATG	5	48971	48984	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016339	CTT	5	49492	49505	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016339	CAG	4	51147	51158	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016339	CAA	4	51163	51173	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016339	CTT	5	51329	51343	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
79	NC_016339	AAGA	3	52350	52361	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016339	TCT	4	52426	52438	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016339	CAA	4	52785	52795	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016339	TA	6	55097	55108	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016339	TCGT	3	55801	55812	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016339	GA	7	55922	55934	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016339	AT	6	58266	58277	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016339	AAGGG	3	58702	58715	14	40 %	0 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016339	CTT	4	59398	59409	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016339	CTTT	3	59495	59507	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
89	NC_016339	CTT	4	59710	59721	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016339	CTT	4	59734	59745	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016339	GA	6	60651	60661	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016339	CTT	4	61079	61091	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
93	NC_016339	AT	6	61092	61103	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016339	TC	6	61145	61156	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016339	TCT	4	63784	63794	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016339	TCA	4	64052	64063	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016339	CTT	4	64071	64081	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016339	TTCA	3	64217	64228	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016339	TCT	5	64244	64257	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016339	AAGT	3	64468	64479	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016339	CTT	4	64530	64541	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016339	CTT	4	64792	64803	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016339	CTT	4	64840	64851	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016339	CTT	4	65469	65480	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016339	TCTTG	4	65791	65809	19	0 %	60 %	20 %	20 %	10 %	Non-Coding
106	NC_016339	AAGA	3	66003	66014	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016339	AGGT	3	66187	66197	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016339	TA	6	66305	66316	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016339	TAT	4	66399	66410	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016339	GA	8	66420	66434	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016339	TA	6	66554	66565	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016339	GAAGA	3	67013	67027	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
113	NC_016339	GAAG	3	67608	67619	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016339	CTTT	3	67936	67946	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016339	CTT	7	68064	68084	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016339	GA	6	68605	68615	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016339	AAAGG	3	68661	68675	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
118	NC_016339	TCT	4	69132	69143	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016339	TGAA	3	70262	70272	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016339	TGAA	3	70381	70391	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016339	TCTTTT	3	70639	70656	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
122	NC_016339	TCT	4	71081	71091	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016339	AG	6	71119	71129	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016339	TTC	4	71790	71801	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016339	ATT	4	71813	71824	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016339	TAT	4	72544	72555	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016339	AAAG	3	72967	72978	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016339	AT	6	74333	74344	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016339	GA	7	74527	74540	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016339	GA	7	74705	74717	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016339	TCT	4	75270	75281	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016339	GTC	4	75317	75328	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016339	AGG	4	75577	75587	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016339	CCAAGT	3	76017	76033	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
135	NC_016339	AGAGGT	3	76345	76361	17	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
136	NC_016339	TA	6	76506	76517	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016339	TTC	4	77457	77468	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016339	TTCTTA	3	77878	77895	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
139	NC_016339	CTT	4	77991	78002	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 49