ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 72

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016306	TC	6	987	997	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016306	TC	6	1905	1915	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016306	CCT	4	1992	2002	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016306	TCTCCT	3	2857	2873	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
5	NC_016306	TC	6	3761	3771	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016306	TCCC	3	3794	3805	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016306	AAAAG	3	4991	5004	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	35796726
8	NC_016306	AGGG	3	5509	5520	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	35796726
9	NC_016306	TCT	5	5545	5558	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35796726
10	NC_016306	TCA	4	6182	6192	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	35796726
11	NC_016306	GA	6	7920	7930	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	35796726
12	NC_016306	CTTT	3	8011	8022	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	35796726
13	NC_016306	CT	6	8068	8079	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	35796726
14	NC_016306	TTTC	3	8207	8218	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	35796726
15	NC_016306	CTT	4	8539	8551	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	35796726
16	NC_016306	GA	6	9174	9185	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	35796726
17	NC_016306	AT	6	9485	9498	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016306	CG	6	9849	9860	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016306	CTT	5	10361	10374	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016306	AAGG	3	11372	11383	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016306	TA	6	11399	11410	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016306	CTTT	3	12389	12400	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016306	AT	7	12750	12762	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016306	AAG	4	14364	14375	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016306	CTT	4	14953	14964	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016306	AAG	5	15241	15254	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016306	CTTT	3	15353	15364	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016306	TCTCC	3	17713	17728	16	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
29	NC_016306	TAG	4	18100	18110	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016306	AG	6	18390	18401	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016306	AG	6	18875	18885	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016306	AGA	4	19134	19144	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016306	TA	6	19510	19521	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016306	GAAA	3	20020	20031	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016306	ATG	4	20683	20693	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016306	GA	6	20890	20900	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016306	CCTA	3	20958	20968	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016306	AC	6	21731	21741	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016306	CTA	6	21769	21786	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016306	TTCTC	3	21804	21817	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016306	CTAA	3	22120	22130	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016306	TAG	4	22503	22513	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016306	AGA	4	22712	22722	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016306	TA	6	23034	23045	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016306	CTA	4	23865	23875	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016306	AGA	4	25605	25615	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016306	TCT	4	27161	27172	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016306	CTC	4	27257	27268	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016306	TA	6	27307	27317	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016306	CCAT	3	28263	28274	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016306	GCAA	3	28379	28389	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016306	CTAT	4	28602	28617	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016306	GGTA	3	28926	28937	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016306	GGAA	3	29378	29388	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016306	GCT	4	30203	30213	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_016306	TCTT	3	30934	30944	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016306	TAC	4	32309	32319	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016306	TA	8	32371	32385	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016306	AGCT	3	32445	32455	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016306	AG	7	32915	32928	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016306	TTA	4	33680	33691	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016306	AGG	5	34081	34095	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_016306	AG	6	34617	34627	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016306	AAGA	3	35109	35119	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016306	CTT	4	35978	35989	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016306	CTT	4	37739	37750	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016306	ACC	4	38448	38459	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016306	TCTT	3	38548	38558	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016306	CTAT	3	38682	38693	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016306	AAGA	3	38883	38894	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016306	CT	7	39192	39204	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016306	TTCTC	3	39582	39596	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
73	NC_016306	CTTC	3	40156	40167	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016306	TCT	4	40271	40282	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016306	GA	6	40809	40819	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016306	TC	6	41074	41084	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016306	AAG	4	42288	42299	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016306	CAA	4	43074	43085	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016306	CTTT	3	43171	43182	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016306	AGA	4	43393	43404	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016306	CCT	4	43511	43521	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
82	NC_016306	AGAAAA	3	44376	44393	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_016306	AAAAG	4	44531	44550	20	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
84	NC_016306	GAT	4	44559	44569	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_016306	CAA	4	45250	45261	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016306	AAG	4	45290	45301	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016306	AGA	4	46186	46197	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016306	AAG	4	46329	46340	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016306	CT	7	46806	46818	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016306	TC	6	46888	46898	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016306	TTTA	3	48083	48095	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016306	GA	6	48371	48382	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016306	TC	6	48497	48508	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016306	TCT	4	49756	49766	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016306	ATT	4	50146	50158	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016306	TGCT	3	51354	51364	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016306	CTT	4	51448	51460	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016306	AAG	4	51851	51862	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016306	CTC	4	52180	52192	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
100	NC_016306	GGTT	3	52195	52206	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016306	TAAG	4	53081	53096	16	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016306	TA	6	53488	53498	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016306	AGA	4	53658	53669	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016306	AAAG	3	54529	54541	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016306	AGA	4	56683	56694	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016306	TA	6	56924	56934	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016306	TTC	4	56965	56976	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016306	TGC	4	57622	57633	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016306	GA	7	58121	58133	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_016306	TTC	4	58548	58559	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016306	AGA	4	58719	58730	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016306	AAG	4	59142	59152	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016306	CTTT	3	59551	59562	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016306	AG	8	60625	60639	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016306	AG	6	60833	60843	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016306	TTCTT	4	60890	60909	20	0 %	80 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
117	NC_016306	TCT	4	60948	60959	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016306	CGT	4	61471	61482	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016306	TTA	4	61529	61539	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016306	TCT	4	61671	61681	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016306	GAAAAA	3	61893	61911	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
122	NC_016306	TGAA	3	62150	62160	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016306	AG	6	62371	62381	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016306	TCTTTT	3	62594	62611	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
125	NC_016306	TTC	4	62992	63002	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016306	TC	6	63468	63478	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016306	CTT	4	63732	63743	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016306	TA	6	64176	64187	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016306	CTT	5	64396	64410	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
130	NC_016306	GA	6	64896	64908	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016306	GA	7	64927	64939	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016306	TTC	4	65190	65201	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016306	CT	6	66753	66763	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016306	AGA	4	66837	66848	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_016306	CTTT	3	67098	67109	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016306	CTTT	3	67193	67205	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016306	AG	6	68193	68203	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016306	CTT	4	68559	68570	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016306	AAG	4	68903	68913	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
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169	NC_016306	ATAG	3	77646	77656	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
170	NC_016306	GAA	4	78305	78317	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 72