ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 76

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016304	AAG	4	348	359	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016304	GAG	4	689	701	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016304	AT	6	824	835	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016304	AGA	4	1716	1727	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016304	TTC	4	1886	1896	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016304	CTT	4	2036	2047	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016304	TTTGAC	3	2197	2215	19	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
8	NC_016304	AAG	4	2222	2233	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016304	CT	7	2272	2285	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016304	CCTTTT	3	3026	3044	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
11	NC_016304	AGAA	3	3459	3470	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016304	AAG	4	3832	3842	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016304	TCTT	4	4598	4613	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016304	CT	6	5273	5284	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016304	CTTTG	3	5887	5901	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016304	ACT	5	6169	6184	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016304	TAG	4	7249	7260	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016304	AAGG	3	7396	7406	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016304	CTT	4	7577	7589	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016304	TCT	4	9857	9868	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016304	ACT	4	10195	10205	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016304	CCA	4	11077	11087	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016304	AAGC	3	12124	12135	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016304	CTT	4	13230	13240	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016304	TCT	4	13549	13560	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016304	CTTT	3	13661	13671	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016304	AT	6	13743	13753	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016304	AAG	4	13818	13828	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016304	TCTT	3	14086	14096	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016304	ACT	4	15211	15221	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016304	TA	7	16222	16234	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016304	CTT	5	16478	16491	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016304	TCT	4	16525	16536	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016304	TTC	4	16583	16594	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016304	AG	6	17434	17444	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016304	CTTT	3	17490	17500	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016304	TA	6	17878	17889	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016304	TTC	4	18061	18072	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016304	CTT	4	18170	18180	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016304	AGGGTT	3	18212	18228	17	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
41	NC_016304	TCCA	3	18501	18512	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016304	TA	6	19684	19694	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016304	TCT	4	19896	19906	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016304	CTCTT	3	20215	20229	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
45	NC_016304	CTT	4	20252	20263	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016304	AG	6	20756	20767	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016304	CACT	3	20972	20983	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016304	AG	6	21422	21432	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016304	TTTC	3	21496	21506	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016304	CTA	5	21932	21945	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
51	NC_016304	GAG	4	22648	22659	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016304	AAAG	3	23522	23533	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016304	TAAAG	3	23852	23867	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_016304	CTA	4	23977	23987	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016304	CCTAT	3	24419	24433	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
56	NC_016304	AAAG	3	24710	24720	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016304	TA	6	25940	25950	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016304	TAGCA	3	26002	26015	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016304	CTT	4	26121	26131	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016304	GAG	4	26238	26249	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016304	AAGA	3	27000	27011	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016304	CCCT	3	27789	27800	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016304	CTCTT	3	28156	28170	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016304	GA	8	28502	28516	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016304	GTTA	3	28690	28700	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016304	AGG	4	29867	29878	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016304	TGAA	3	29917	29927	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016304	GAG	4	30423	30434	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016304	TATC	3	31331	31343	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016304	GTTA	3	31650	31660	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016304	CTTT	3	33302	33313	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016304	GGA	4	33449	33459	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016304	ACTT	3	33738	33749	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016304	AAGA	3	34377	34388	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016304	AAGA	3	35057	35069	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016304	GAT	4	35212	35223	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016304	TA	6	35578	35589	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016304	GA	8	37249	37263	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_016304	AAAGA	3	37397	37411	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016304	TA	6	37874	37885	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016304	TA	6	38207	38218	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016304	AG	6	38349	38359	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016304	CTT	5	39277	39291	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
84	NC_016304	TTC	4	39314	39325	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016304	TTC	4	39546	39556	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016304	CTT	4	40650	40660	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016304	AGA	4	41606	41617	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016304	AG	6	41953	41963	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016304	TA	6	42262	42273	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016304	TCT	4	42708	42718	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016304	CTT	4	42721	42731	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016304	GA	6	42950	42961	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016304	TTC	4	44492	44503	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016304	AT	6	44875	44886	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016304	CTT	5	45813	45826	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016304	AG	6	46451	46461	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016304	AAAG	3	46663	46673	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016304	AAGA	3	46718	46730	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016304	GAA	4	46836	46846	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016304	GTT	4	47105	47116	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016304	CTT	4	47463	47473	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016304	GGA	4	47700	47711	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016304	TCTTT	3	48743	48757	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016304	CTT	4	49322	49332	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016304	AG	6	50993	51003	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016304	CTT	4	51356	51367	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016304	TTA	4	51759	51770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016304	AG	6	52091	52101	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016304	CTC	4	52450	52461	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016304	CTT	5	52522	52536	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016304	CTT	5	52579	52593	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016304	GAA	4	52752	52763	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016304	AAATT	3	54736	54750	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_016304	TTTG	3	55689	55699	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016304	AGTA	3	58851	58861	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016304	TTTC	3	60398	60409	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016304	AGT	4	61276	61287	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016304	AT	6	61480	61490	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016304	TA	6	63198	63208	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016304	ATTG	3	63996	64008	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016304	TA	6	64869	64879	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016304	TCT	4	65572	65583	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016304	ATGG	3	65795	65806	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016304	CTTA	3	65969	65980	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016304	GAAA	3	66232	66242	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016304	AAAG	3	66879	66889	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016304	CTT	4	66921	66933	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
128	NC_016304	AGA	4	67719	67729	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016304	CTT	4	68260	68271	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016304	GTTAG	3	68339	68352	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016304	GGAA	3	68387	68397	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016304	TCT	4	69584	69594	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016304	TCT	4	69673	69683	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016304	TCTT	3	70094	70104	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016304	CTAAA	3	74083	74097	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
136	NC_016304	TCT	4	74868	74878	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016304	GA	6	75033	75044	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016304	CCTT	3	75832	75842	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016304	CTT	4	76488	76499	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
140	NC_016304	TCGC	3	76597	76608	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
141	NC_016304	AGA	5	76867	76880	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 76