ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016294	AGA	4	442	454	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016294	TA	8	1868	1882	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_016294	TC	6	2877	2887	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016294	CTTA	3	3185	3196	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016294	GTAAA	3	3393	3406	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016294	TTCTAT	3	3829	3846	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
7	NC_016294	AAAG	4	4528	4542	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016294	CTTGA	3	4618	4631	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016294	AGAA	3	4768	4779	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016294	GAAAA	3	4844	4858	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_016294	TCT	4	5144	5155	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016294	AAGT	3	5271	5282	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016294	GAAA	3	5285	5296	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_016294	TCA	4	5684	5695	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016294	AGA	4	6163	6174	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016294	TA	6	6356	6367	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016294	CTTT	3	6830	6842	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016294	AC	7	6909	6922	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016294	CG	6	6934	6945	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016294	AG	6	6944	6954	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016294	AG	7	6992	7004	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016294	TGAA	3	7221	7231	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016294	TA	6	7351	7362	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016294	TGAA	3	7744	7754	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016294	GA	7	7822	7834	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016294	TGAA	3	8336	8346	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016294	AG	6	8414	8424	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016294	ATG	4	8680	8691	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016294	GAG	4	10100	10111	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_016294	GA	6	10915	10926	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016294	AAAG	3	11002	11012	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016294	GA	6	11029	11039	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016294	AG	6	12584	12594	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016294	AGA	4	13429	13439	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016294	CCTTT	3	13769	13783	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016294	AG	6	14129	14139	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016294	CTT	4	14222	14232	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016294	AG	6	14790	14800	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016294	AAG	4	15047	15059	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016294	AAAG	3	15210	15222	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016294	TGAA	3	15353	15363	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016294	GA	7	15452	15464	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016294	CTT	4	15685	15696	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016294	TGAA	3	16217	16227	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016294	TC	6	17015	17025	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016294	CG	6	18040	18051	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016294	AGA	4	18058	18070	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016294	TA	6	19103	19113	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016294	TCTT	3	20064	20075	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016294	CTTT	4	20408	20422	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
51	NC_016294	GAA	4	21391	21402	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016294	CT	6	21667	21677	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016294	ACTT	3	21900	21910	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016294	TTCA	3	22269	22281	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016294	CT	6	23631	23642	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016294	TAAT	3	23650	23661	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016294	TA	6	24588	24601	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016294	TC	7	24946	24958	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016294	CTTT	3	25828	25838	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016294	AAAG	3	25871	25883	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016294	TTTC	3	26014	26024	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016294	AT	6	26637	26648	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016294	GCTT	3	27142	27152	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016294	AAGC	3	27751	27761	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016294	CTT	4	28002	28013	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016294	TTCT	3	28062	28072	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016294	ATA	5	28903	28917	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_016294	AAAG	3	29189	29199	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016294	CTTG	3	29215	29227	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
70	NC_016294	CT	6	29430	29440	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016294	CGCC	3	29508	29519	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016294	CTTG	3	30586	30596	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016294	TAG	4	30917	30928	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016294	TA	7	32809	32821	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016294	TA	6	34104	34115	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016294	TCT	4	34130	34142	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016294	CT	6	34653	34663	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016294	TA	6	35622	35632	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016294	CGAG	3	35900	35910	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016294	TA	7	36776	36789	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016294	TATAC	3	37423	37436	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016294	CTTC	3	37535	37546	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016294	CT	6	37910	37920	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016294	TGAGT	3	38637	38650	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016294	CT	6	39001	39011	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016294	GA	7	39647	39659	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016294	GGAAA	4	39940	39959	20	60 %	0 %	40 %	0 %	10 %	Non-Coding
88	NC_016294	TA	6	40377	40388	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016294	AG	6	40759	40770	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016294	AAAG	3	41910	41921	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016294	GAA	5	43466	43479	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016294	CCT	4	43972	43983	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016294	CTTTT	3	44281	44295	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016294	CAAG	3	44439	44449	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016294	TTC	4	45014	45025	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016294	CTT	4	46943	46955	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016294	CT	6	47521	47531	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016294	TAAG	3	48322	48333	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016294	CA	6	48341	48352	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016294	AAGA	3	48357	48368	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016294	CTA	4	48962	48972	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016294	TAT	5	48969	48984	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_016294	CGG	4	49501	49513	13	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016294	TA	6	51066	51077	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016294	AAGA	3	51953	51964	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016294	CTTA	3	51970	51980	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016294	AAAG	3	52596	52606	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016294	TAG	4	52753	52764	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016294	AG	6	52920	52930	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016294	CT	6	52936	52946	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016294	TG	7	52950	52962	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016294	CT	7	53200	53213	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016294	AGT	4	53877	53888	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016294	TA	7	54045	54057	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_016294	AGAA	3	54276	54287	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016294	CTT	5	54538	54553	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016294	GGAA	3	54625	54637	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016294	AGA	4	55380	55390	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_016294	CTTGT	3	55613	55626	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016294	ACAA	3	56070	56081	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016294	TC	7	56709	56721	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016294	TTCC	3	57042	57053	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016294	CCTT	3	57167	57177	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 119