ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 65

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016284	AAGA	3	443	455	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016284	AT	6	1284	1295	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016284	AAGA	3	1480	1491	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016284	TATC	3	1735	1746	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016284	CG	6	1957	1968	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
6	NC_016284	CAAAAG	3	2208	2224	17	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
7	NC_016284	ACGA	3	2478	2489	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016284	GGA	4	2809	2820	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016284	GAAA	3	3092	3104	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016284	AATT	3	3763	3774	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016284	CT	6	3835	3847	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016284	CTTT	3	3849	3859	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016284	CA	7	4077	4090	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
14	NC_016284	CG	6	4103	4114	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016284	GA	6	4484	4494	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016284	CTAG	3	5463	5473	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016284	CTT	5	5484	5497	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016284	AAGA	3	5758	5769	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016284	CCTG	4	6240	6254	15	0 %	25 %	25 %	50 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016284	AGTA	3	7661	7672	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016284	TTG	4	8256	8267	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016284	AGGA	3	8594	8605	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016284	ACT	4	8981	8991	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016284	TAAA	3	9774	9785	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016284	AGGA	3	9960	9971	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016284	AAAAGA	3	10184	10202	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
27	NC_016284	TATT	4	10605	10620	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016284	TAAA	3	10800	10811	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016284	AGC	4	10824	10834	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016284	TC	6	11591	11601	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016284	CCAC	3	11758	11769	12	25 %	0 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016284	ATTC	3	11776	11787	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016284	AG	6	11804	11815	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016284	TA	6	11870	11880	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016284	TTC	4	12779	12789	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016284	TAT	4	13105	13117	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016284	TAT	4	13499	13510	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016284	TTCT	3	13661	13671	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016284	AAG	4	14165	14176	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016284	GAAG	3	14721	14731	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016284	CTA	4	14822	14833	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016284	AAG	4	16259	16270	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016284	GAAG	3	18136	18147	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016284	AAAG	3	18425	18436	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016284	AGAA	3	18825	18836	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016284	TA	6	19710	19721	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016284	GA	8	20727	20741	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016284	GA	6	20804	20814	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016284	TCAAA	3	21184	21197	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016284	CTTT	3	22940	22950	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016284	AAAG	3	23083	23094	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016284	TCT	4	23311	23321	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016284	TTTC	3	23365	23375	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016284	CTT	5	23577	23591	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016284	TTTA	3	24469	24480	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016284	AG	6	25277	25287	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016284	GA	6	25343	25353	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016284	TA	8	25616	25630	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_016284	TA	6	26335	26346	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016284	AATT	4	27585	27600	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016284	AT	9	27715	27732	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_016284	CGA	4	28580	28590	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016284	TCTCT	3	30215	30229	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016284	TA	7	30637	30650	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016284	CTTTCT	3	30946	30962	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
66	NC_016284	AAG	4	31412	31424	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_016284	A	14	31669	31682	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016284	A	12	32237	32248	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016284	CAAA	3	32640	32650	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016284	AAAG	3	32951	32961	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016284	AAAG	3	33165	33176	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016284	TTGA	3	33221	33232	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016284	AT	7	33329	33343	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_016284	AAGA	3	34001	34011	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016284	AT	9	34339	34355	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_016284	CTG	4	35417	35427	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016284	CTTT	5	35448	35466	19	0 %	75 %	0 %	25 %	10 %	Non-Coding
78	NC_016284	CTT	4	36201	36211	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016284	CT	6	38440	38450	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016284	GGCAT	3	38597	38610	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016284	CTTT	3	41124	41135	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016284	TCT	4	41381	41391	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016284	CT	6	41728	41738	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
84	NC_016284	ATTT	3	41892	41903	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016284	GA	6	42045	42055	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016284	TA	8	42752	42767	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_016284	GT	7	43298	43311	14	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016284	AAAG	4	43394	43409	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_016284	ATA	4	43569	43580	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016284	AAAG	3	44538	44548	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016284	AAAG	3	44764	44774	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016284	AAAC	3	45196	45207	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016284	AAAG	3	45886	45897	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016284	AAAG	3	47164	47176	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016284	TC	6	47355	47365	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016284	CT	6	47387	47397	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016284	CT	6	47415	47425	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016284	GA	6	48456	48466	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016284	TGAA	3	48501	48511	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016284	AGA	4	49582	49595	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016284	TA	8	49971	49985	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_016284	AGA	4	50491	50502	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016284	AT	6	50958	50970	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016284	AAG	4	51235	51246	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016284	ATA	4	51374	51386	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016284	TGC	4	53319	53329	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016284	AAGG	3	54232	54243	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016284	TATG	3	56007	56017	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016284	TTTA	3	56324	56334	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016284	CAT	4	57742	57753	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016284	TC	7	57818	57830	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016284	G	16	58331	58346	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
113	NC_016284	TAAG	3	59314	59324	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016284	TAG	4	59401	59412	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016284	CT	6	59560	59570	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016284	CCCT	3	59853	59863	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016284	CTT	4	60581	60593	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
118	NC_016284	AAGA	3	61037	61049	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016284	CTT	4	61830	61840	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016284	CCTG	3	62181	62191	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016284	TA	6	62922	62934	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016284	ACCCT	3	63232	63245	14	20 %	20 %	0 %	60 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016284	ATCTAT	3	64175	64192	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
124	NC_016284	ATC	4	64454	64465	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016284	AAGAA	3	65253	65268	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016284	TC	7	65612	65624	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016284	AG	6	65762	65773	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016284	TA	6	65830	65840	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016284	AT	6	66591	66602	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016284	GGAT	3	68732	68743	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016284	GCT	4	69222	69232	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
132	NC_016284	ACAA	3	70657	70667	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016284	TA	6	71255	71266	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016284	CTT	4	72119	72131	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016284	CTTT	3	72685	72697	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016284	CTTT	3	72807	72819	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016284	GAAA	3	72984	72995	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_016284	TCT	5	73171	73184	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
139	NC_016284	TTTGTC	3	75419	75437	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
140	NC_016284	TA	7	75786	75798	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016284	TCT	4	76042	76054	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
142	NC_016284	TTC	4	76108	76118	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016284	ATGC	3	76493	76503	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016284	TTA	4	76933	76945	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_016284	TTC	4	77211	77223	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
146	NC_016284	TC	6	78042	78052	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016284	AAAG	4	78572	78587	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
148	NC_016284	AAGCAA	3	78609	78627	19	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
149	NC_016284	TA	6	79157	79170	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
150	NC_016284	TGAA	3	79636	79646	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
151	NC_016284	GA	6	79772	79783	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
152	NC_016284	GA	6	79881	79891	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_016284	AAAG	3	80750	80760	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
154	NC_016284	AG	8	80868	80882	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 65