ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 73

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016264	TA	7	146	158	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016264	CT	6	658	668	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016264	CTT	4	1484	1496	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016264	TTTC	3	1852	1862	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016264	ACTT	3	2150	2160	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016264	AG	6	2785	2795	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016264	CT	6	3214	3225	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016264	TA	6	6692	6702	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016264	AG	6	7000	7012	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_016264	TAC	4	8714	8726	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016264	CTT	4	9340	9350	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016264	GA	6	10256	10266	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016264	AAAG	3	10338	10349	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016264	ACTA	3	10606	10617	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016264	TA	6	10960	10970	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016264	CT	6	11518	11529	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016264	ATG	4	12472	12484	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_016264	TCCT	3	14141	14152	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016264	GAAAG	3	16177	16190	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016264	GCT	4	16404	16416	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016264	TA	6	16588	16599	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_016264	AAGC	3	17276	17288	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
23	NC_016264	AG	7	18078	18091	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016264	TC	6	18630	18641	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016264	AT	6	18731	18741	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016264	CTT	4	20013	20023	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016264	TCT	4	20131	20141	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016264	TCT	4	20197	20208	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016264	AAGT	3	21174	21184	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016264	GA	6	21186	21196	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016264	GAG	4	21445	21455	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016264	TGT	4	21811	21822	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016264	CTT	4	22235	22247	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016264	AT	6	22248	22259	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016264	CTT	5	23276	23290	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016264	TCT	4	23376	23387	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016264	AT	6	23783	23794	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016264	CTT	4	24214	24225	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016264	TACA	3	24402	24413	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016264	CTT	4	24529	24539	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016264	GAG	4	25023	25033	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016264	GAA	4	25687	25697	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016264	TCT	4	26099	26111	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016264	TC	6	26433	26443	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016264	GAATG	3	27051	27064	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016264	CTT	5	27193	27207	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016264	TTTG	3	27348	27359	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016264	GCGG	3	27814	27826	13	0 %	0 %	75 %	25 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016264	GGA	4	27875	27886	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_016264	AAG	4	29048	29059	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016264	GAA	4	29275	29287	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016264	CAA	4	29580	29591	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016264	GAA	4	29633	29643	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016264	GCATT	3	29718	29731	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016264	CT	7	30339	30351	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016264	GAA	4	30705	30716	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016264	TCAGTC	3	30933	30949	17	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
58	NC_016264	AGAA	3	31081	31092	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016264	CGG	4	33666	33676	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016264	TA	6	34888	34899	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016264	AGT	4	35206	35217	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016264	TAC	4	35489	35499	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016264	GCT	4	36130	36141	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016264	CCTTT	3	36849	36862	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016264	CGAA	3	36935	36945	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016264	AAG	4	37852	37863	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016264	AGAT	3	38424	38434	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016264	ACGG	3	38893	38905	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016264	TC	6	39318	39328	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016264	GGC	4	39416	39427	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016264	GGA	4	42202	42213	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016264	CT	6	42452	42462	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016264	GTA	4	42843	42855	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016264	CTT	4	43669	43680	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016264	TCT	4	43727	43739	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016264	CTTT	3	44137	44149	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016264	AG	6	45442	45453	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016264	CAAG	3	45486	45497	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016264	AGA	5	45660	45674	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_016264	AGT	4	45775	45786	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_016264	AT	6	45846	45857	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016264	CGGA	3	46290	46301	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016264	TCA	4	46306	46317	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016264	ACAAG	3	48772	48785	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016264	AACC	3	49092	49102	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016264	AG	7	49169	49182	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016264	AGA	4	49326	49337	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016264	TGA	4	49378	49389	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016264	AG	6	49609	49619	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016264	AGTC	3	51064	51074	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016264	GAAA	3	51235	51246	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_016264	TA	6	52037	52047	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016264	CATA	3	52771	52782	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016264	GGCA	3	52954	52964	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016264	AG	7	54484	54496	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016264	AAG	4	54784	54795	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016264	TA	7	55119	55132	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_016264	AG	6	56344	56354	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016264	ATCT	3	56405	56415	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016264	ACT	4	56988	57000	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016264	TC	7	58216	58229	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016264	TC	7	58418	58430	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016264	TAA	4	58588	58598	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016264	AGTA	3	59471	59481	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016264	AAAG	3	59529	59539	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016264	TCT	4	59961	59971	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016264	CTT	4	60782	60792	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016264	ACAAT	3	61256	61269	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
109	NC_016264	CT	6	61798	61808	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016264	AGC	4	62048	62059	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016264	TTCT	3	62085	62097	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016264	CTTG	3	63579	63591	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016264	AAAG	3	63794	63805	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016264	ATGT	3	64567	64577	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016264	CTTT	3	65193	65203	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016264	GACT	4	65548	65562	15	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016264	CTTT	3	65981	65991	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016264	GA	6	66678	66690	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016264	ACC	4	67299	67309	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016264	CCT	4	70081	70092	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016264	GAA	4	70321	70332	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016264	AAAG	3	70605	70616	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016264	CATG	3	72065	72076	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016264	AAG	4	72726	72736	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016264	TCCC	3	73227	73238	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016264	ATCC	3	73911	73922	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016264	CTA	4	74230	74241	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016264	ACT	4	75794	75807	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016264	AGT	5	75966	75979	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016264	GTA	4	76772	76782	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016264	TTC	4	76860	76871	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016264	CT	7	77231	77243	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016264	ATG	4	77371	77382	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

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