ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 42

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016263	TA	6	990	1001	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016263	TA	6	2204	2214	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016263	GTT	4	2443	2454	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016263	TA	6	3831	3841	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016263	AAAG	3	4077	4088	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016263	TAAA	3	4929	4940	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016263	AAGA	3	5802	5812	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016263	GA	7	6083	6095	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016263	TA	6	6162	6173	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016263	AG	7	7037	7049	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016263	CA	6	7632	7644	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016263	GTA	4	8600	8610	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016263	CGAA	3	10622	10632	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016263	TA	9	13054	13070	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_016263	AG	6	13267	13277	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016263	TAAG	4	14071	14086	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_016263	TA	6	14585	14596	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016263	TA	6	14698	14709	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016263	TTCTC	3	15036	15050	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016263	CAA	4	15253	15264	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016263	TA	7	15272	15285	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016263	CAG	4	16460	16470	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016263	AAAC	3	17008	17019	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016263	CT	6	17589	17599	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016263	AAG	4	18092	18103	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016263	AAAG	3	18646	18657	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016263	TAAG	3	19425	19435	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016263	GACA	3	20515	20526	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016263	AGCT	3	21790	21800	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_016263	CT	6	22277	22288	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016263	GAC	4	23637	23648	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_016263	AAAG	3	26271	26282	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016263	TA	7	26431	26443	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016263	TTA	4	27396	27407	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016263	CTTC	3	27742	27753	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016263	AGAT	3	29265	29275	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016263	AG	6	29405	29415	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016263	TCT	4	30028	30038	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016263	AAGT	3	30649	30661	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016263	TCT	4	31212	31222	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016263	TA	12	33076	33099	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016263	CTTA	3	33226	33238	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016263	TCT	4	35597	35607	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016263	CTTT	3	36286	36296	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016263	CCT	4	36746	36757	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016263	AGGAA	3	38032	38046	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_016263	ACGA	3	38374	38386	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016263	CTT	4	38455	38466	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
49	NC_016263	CGAA	3	39224	39234	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016263	AGTC	3	39505	39515	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016263	GAAA	3	40766	40778	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016263	TACT	4	41219	41233	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
53	NC_016263	TAC	4	41735	41747	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016263	GCTA	3	44236	44247	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016263	ATTCTT	3	46052	46069	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
56	NC_016263	TA	7	46172	46185	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016263	CTAA	3	46897	46907	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016263	TA	7	47177	47189	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016263	AAAG	3	47207	47219	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_016263	CGTTA	3	47861	47874	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
61	NC_016263	GTTC	4	48885	48900	16	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
62	NC_016263	AGA	4	49508	49519	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016263	AGA	4	50836	50847	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016263	TAGA	3	51162	51172	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016263	AAAG	3	52478	52489	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016263	GATT	3	53166	53177	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016263	GCAG	3	53276	53286	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016263	CTTT	3	56523	56535	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016263	AG	6	56757	56767	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016263	CTT	4	57242	57253	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016263	GAC	4	57541	57552	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016263	GTA	4	57746	57756	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016263	TCA	4	58223	58234	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016263	TGCT	3	58824	58834	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016263	CTTGG	3	58945	58958	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016263	AGACC	3	59756	59769	14	40 %	0 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
77	NC_016263	GAAA	3	60440	60450	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016263	AAG	5	60495	60509	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_016263	AAAG	3	60814	60824	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016263	TGAC	3	62059	62069	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016263	TCT	4	62356	62367	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016263	TC	6	64089	64099	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016263	CTT	4	64336	64348	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016263	CT	6	64625	64638	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016263	AATT	3	64897	64908	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016263	AC	6	65546	65556	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016263	TTCC	3	66570	66580	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016263	GAAA	3	67205	67215	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016263	TTATCT	3	67346	67362	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
90	NC_016263	GTC	4	67513	67524	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016263	AGC	5	67684	67698	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
92	NC_016263	AG	6	68070	68080	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_016263	AT	8	68272	68286	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_016263	TAG	4	68439	68451	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016263	AG	6	69921	69931	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016263	TCTTTG	3	70231	70248	18	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
97	NC_016263	CTTT	3	70284	70294	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016263	CCT	4	70920	70931	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016263	C	12	70948	70959	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016263	TCTT	3	71105	71116	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016263	CT	6	71153	71164	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016263	TA	6	71277	71288	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016263	CT	6	72283	72293	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016263	TCT	4	72307	72317	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016263	CT	6	72468	72478	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016263	TTCT	3	72785	72796	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016263	AT	6	72917	72928	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016263	CG	6	74978	74989	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016263	GTTTG	3	75525	75539	15	0 %	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
110	NC_016263	TCTT	4	75751	75766	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016263	CTT	4	76601	76612	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016263	GA	7	76982	76995	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_016263	TGAA	3	77146	77156	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016263	AATC	3	77411	77422	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016263	ATC	4	78334	78344	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016263	ATTCTA	3	78418	78435	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
117	NC_016263	TAG	4	78529	78539	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016263	AAAG	3	78619	78630	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016263	AG	6	78833	78843	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016263	GA	7	79122	79134	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_016263	GAA	4	79623	79635	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016263	TA	7	79660	79672	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016263	AGA	4	79965	79976	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016263	TGAA	3	81677	81687	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016263	GAAAA	3	81905	81920	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016263	CCTCTC	3	81976	81994	19	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10 %	Non-Coding
127	NC_016263	AAGA	4	82987	83001	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
128	NC_016263	CAA	4	83868	83879	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016263	TCT	4	85367	85377	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016263	CCT	4	85610	85621	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
131	NC_016263	TCT	4	85688	85700	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
132	NC_016263	CCT	4	85901	85912	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016263	AAAAGA	3	86004	86022	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
134	NC_016263	TC	7	87961	87973	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016263	CTT	4	88634	88646	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016263	TA	8	89349	89363	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016263	GT	6	89442	89452	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016263	CTT	4	89722	89733	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016263	TA	6	90702	90715	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016263	AGGA	3	91160	91170	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016263	TGGA	3	91630	91640	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016263	AAGT	3	92694	92704	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016263	AG	6	92705	92716	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_016263	ATCAG	3	94306	94319	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
145	NC_016263	CAA	4	94489	94499	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016263	GTCT	3	94683	94693	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
147	NC_016263	CTTT	3	95682	95693	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016263	AAG	4	95715	95725	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016263	TC	6	96654	96664	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
150	NC_016263	GAAAG	3	97137	97150	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 42