ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 63

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016259	TC	6	1228	1239	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016259	ACA	4	1375	1386	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016259	TC	6	2626	2636	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016259	TA	7	2915	2928	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016259	GAA	5	3471	3485	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016259	ACATT	4	3534	3552	19	40 %	40 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
7	NC_016259	TTCT	3	3575	3585	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016259	TCTTAT	3	4930	4947	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
9	NC_016259	GGA	4	5118	5129	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016259	GAA	4	6001	6012	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016259	CT	6	6862	6872	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016259	ATG	4	7246	7256	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016259	TC	6	8012	8022	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016259	TA	6	8298	8309	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016259	AAG	4	8482	8493	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016259	TTCG	3	9389	9399	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016259	TTG	4	9408	9419	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016259	AAAAG	3	11260	11275	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_016259	AGAA	3	11719	11729	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016259	AAGA	3	11762	11773	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016259	ACTTG	3	11834	11847	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
22	NC_016259	GCT	4	12729	12739	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016259	AAG	4	13038	13048	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016259	GCT	4	13050	13060	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016259	TA	7	13706	13720	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016259	CT	6	13933	13943	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016259	CTTT	3	14529	14539	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016259	AAG	4	14825	14835	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016259	TTCTC	3	15046	15059	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016259	GAAA	3	15180	15191	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016259	TGT	4	16028	16038	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016259	TTC	4	16380	16392	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
33	NC_016259	AT	8	17006	17020	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016259	GA	6	17432	17443	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016259	CG	6	18072	18083	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016259	TC	6	18775	18785	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016259	TA	6	19662	19673	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016259	AGC	4	19926	19938	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
39	NC_016259	TA	8	19993	20008	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_016259	CCTT	3	21638	21650	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016259	CTTTTT	3	22019	22037	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
42	NC_016259	TA	6	22802	22812	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016259	TTCT	3	23033	23044	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016259	TTCT	3	23114	23124	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016259	ACCTC	3	23764	23778	15	20 %	20 %	0 %	60 %	6 %	Non-Coding
46	NC_016259	TCTTA	4	23924	23944	21	20 %	60 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016259	AGAA	3	24304	24315	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016259	TA	6	24782	24792	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016259	GAA	4	25082	25094	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_016259	CAAT	3	25536	25547	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016259	CTT	4	25997	26007	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_016259	CTTT	3	27622	27632	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016259	TATAA	3	28075	28090	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_016259	AAG	4	28578	28588	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016259	AAAGAA	3	28976	28993	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_016259	AAGAA	3	29276	29289	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016259	CT	6	30199	30210	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016259	CTTT	3	30834	30845	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016259	GACA	4	30937	30951	15	50 %	0 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016259	TGAA	3	31496	31506	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016259	CT	6	33290	33300	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
62	NC_016259	TC	6	33941	33951	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016259	AT	7	34212	34227	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016259	ACGA	3	34436	34447	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016259	AAGT	4	35076	35091	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016259	GAAA	3	35094	35105	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016259	GAAG	3	35262	35273	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016259	AGAATA	3	35671	35689	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_016259	AG	6	35848	35858	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016259	GA	6	36854	36864	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016259	GAAG	3	36935	36946	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016259	ATTGA	3	39115	39128	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_016259	CT	6	39739	39751	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016259	GAA	4	41329	41340	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_016259	TGAA	3	42171	42181	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016259	GAG	4	42248	42258	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016259	AGA	4	42983	42994	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016259	AGA	4	43313	43325	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016259	TTCA	3	45573	45584	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_016259	TCGCTT	3	45715	45732	18	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016259	CTTT	3	46316	46327	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016259	AAAAG	4	46723	46741	19	80 %	0 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
83	NC_016259	TCCT	3	46792	46803	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016259	AAAG	3	47132	47143	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016259	TCT	4	47208	47219	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016259	TCAA	3	47513	47525	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016259	AT	7	47549	47561	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016259	CT	6	47716	47727	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
89	NC_016259	TCT	4	48027	48037	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016259	AAGA	3	48486	48496	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016259	TTC	4	49631	49643	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016259	CTA	4	50093	50104	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016259	AAGG	3	50105	50116	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016259	GCAT	3	50895	50905	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016259	AGAA	3	51019	51029	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016259	ATTC	3	52363	52375	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016259	TC	6	52712	52722	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016259	CCTT	3	52872	52882	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016259	AGA	4	53376	53386	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016259	AGAA	3	53718	53728	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016259	TCT	4	53918	53929	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016259	AAGA	3	54620	54630	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016259	CTC	4	54803	54815	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016259	CTTT	3	54958	54969	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
105	NC_016259	TTC	4	57134	57144	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
106	NC_016259	AGGA	3	57475	57486	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016259	TC	7	57691	57704	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016259	GAAA	3	58183	58194	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016259	TTA	4	58212	58222	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016259	CTTT	4	58233	58248	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016259	AAAG	3	58717	58728	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016259	CTG	4	59168	59179	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016259	AAAGG	3	59614	59628	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_016259	TA	6	60453	60464	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016259	AGAA	3	60612	60623	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016259	AGA	5	61084	61098	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_016259	GA	6	61554	61564	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016259	AAAG	3	62335	62347	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_016259	AAG	4	62556	62568	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016259	GA	6	62837	62847	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016259	GGA	4	63141	63151	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016259	TC	7	63403	63415	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
123	NC_016259	ACTT	3	64357	64367	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016259	CTT	4	64407	64419	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016259	CT	6	64982	64992	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016259	TGGC	3	65567	65578	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016259	AG	6	65938	65949	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016259	GAGAAG	3	66399	66415	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
129	NC_016259	CT	6	67264	67275	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016259	AG	6	67459	67469	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016259	AGA	4	68368	68379	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016259	GTTCT	3	68976	68990	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016259	CTTT	3	70088	70098	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016259	CTTTT	3	70718	70733	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
135	NC_016259	TA	7	71527	71539	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016259	TTGC	4	71881	71895	15	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
137	NC_016259	AAAG	3	71916	71926	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016259	TAA	4	72037	72048	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_016259	TTTCC	3	72170	72183	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
140	NC_016259	TA	7	72427	72439	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016259	GAAA	3	73084	73095	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016259	GA	8	73317	73331	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 63