ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 67

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016256	AAAG	3	148	159	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016256	TCT	4	405	415	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016256	TCA	4	553	563	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016256	GTA	4	694	706	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_016256	AC	6	1082	1092	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016256	TA	6	1217	1227	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_016256	ACCATG	3	3933	3949	17	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
8	NC_016256	TAG	4	4330	4340	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016256	TA	6	5644	5654	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016256	TA	6	6349	6359	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016256	TAA	4	6510	6520	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016256	CAAT	3	7127	7137	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016256	AG	6	7563	7573	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016256	AT	6	7851	7862	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016256	CT	7	8079	8091	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
16	NC_016256	TCT	4	8233	8244	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016256	CTTT	3	9405	9415	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016256	TTTA	3	9418	9430	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016256	CT	6	9677	9687	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016256	TA	7	9885	9897	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_016256	AAGG	3	12282	12292	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016256	TA	6	14848	14859	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016256	CTTA	3	14980	14992	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016256	TCCTTT	3	15588	15606	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
25	NC_016256	TA	6	16768	16778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016256	TA	6	17222	17234	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_016256	TTG	4	17285	17295	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016256	CTTT	3	17447	17458	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016256	AG	7	17522	17534	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016256	CTT	4	17939	17950	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016256	AGTT	3	18122	18133	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016256	CTA	4	18354	18364	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016256	TTC	4	19360	19372	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016256	CTTA	3	19759	19770	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016256	CT	6	20895	20906	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
36	NC_016256	GTCC	3	21920	21930	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_016256	TCTCT	3	22235	22248	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016256	CGTT	3	22413	22423	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016256	AAC	4	23705	23715	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_016256	CTT	4	23853	23864	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016256	TAG	4	24131	24141	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016256	TAT	4	24265	24277	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_016256	CT	6	24904	24915	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016256	TA	7	24915	24928	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016256	CT	6	25603	25613	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016256	TTTC	3	25760	25771	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016256	AGAA	5	25858	25878	21	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_016256	CAG	4	26344	26354	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016256	GAAA	3	26712	26722	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016256	TGA	4	26955	26966	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016256	ACT	5	27155	27168	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016256	TTGC	3	28570	28580	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016256	GAG	4	28671	28682	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016256	CTA	4	29301	29312	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
55	NC_016256	CT	6	30330	30341	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016256	ATT	4	30397	30407	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016256	AAAC	3	30691	30701	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016256	TCT	4	31051	31062	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016256	GAAA	3	32050	32061	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016256	GA	6	32388	32398	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016256	TCTTTT	3	33449	33467	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
62	NC_016256	CA	7	33819	33831	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016256	CTT	4	33862	33874	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
64	NC_016256	AGC	4	34323	34334	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016256	AAGC	3	35076	35086	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016256	TTAA	3	35594	35605	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016256	AGAA	3	36442	36452	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016256	TTTA	3	37098	37109	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016256	ACTAT	3	38546	38560	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
70	NC_016256	ACCT	3	38806	38816	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016256	AGA	4	38977	38988	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_016256	TA	6	39169	39179	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016256	TAG	4	39786	39798	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016256	CTTT	3	41023	41033	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016256	ACTT	3	41699	41710	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016256	CT	6	42572	42582	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016256	AAAG	3	43419	43429	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016256	TAT	4	43482	43493	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016256	AAG	4	44059	44069	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016256	TAG	4	44406	44416	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016256	GAA	4	47264	47276	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016256	CT	6	48457	48467	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016256	CCTTCT	3	48514	48530	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016256	CCT	4	48696	48707	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016256	GAAA	3	48934	48944	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_016256	CTTTTT	3	49200	49218	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
87	NC_016256	CT	6	49296	49306	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
88	NC_016256	TC	6	49462	49472	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016256	TC	6	50150	50160	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016256	GGT	4	52996	53008	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016256	AGAA	3	53065	53076	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016256	TA	8	53379	53393	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_016256	TTAGG	3	54505	54518	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016256	TCT	4	54581	54591	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016256	TC	6	57116	57126	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016256	CCAG	3	57356	57368	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
97	NC_016256	CCT	4	57451	57462	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016256	TTCT	3	58096	58106	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016256	GA	6	58816	58826	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016256	CTT	4	59867	59878	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016256	TTC	4	59923	59933	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016256	GGAA	3	60374	60385	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016256	CTT	4	60761	60772	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016256	ATCC	3	61260	61272	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016256	CT	6	61884	61895	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016256	ATT	4	62636	62647	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016256	TACA	3	63021	63032	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
108	NC_016256	GTA	4	63211	63221	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016256	TCTT	3	63462	63473	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016256	TA	8	63564	63579	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016256	AT	6	64432	64443	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_016256	AT	6	64481	64492	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016256	TAGA	3	64612	64623	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016256	TCT	5	64918	64933	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016256	TA	6	64938	64948	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016256	AAG	4	65053	65063	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016256	AAT	4	65288	65298	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016256	TA	6	65377	65388	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016256	CTT	4	66171	66183	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016256	ACT	4	66202	66213	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
121	NC_016256	TA	9	66330	66347	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
122	NC_016256	GT	6	66467	66477	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_016256	CTTT	3	66503	66514	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016256	TC	7	66546	66558	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
125	NC_016256	AAGA	3	67679	67690	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016256	TCT	4	68874	68886	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
127	NC_016256	GGCT	3	68956	68967	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016256	TAG	4	69146	69158	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_016256	ACT	4	69427	69437	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016256	TGT	4	69742	69752	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016256	TTC	4	70507	70518	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016256	AT	8	71038	71053	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
133	NC_016256	GTA	4	71148	71158	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016256	AAAG	3	71373	71383	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016256	GCA	4	71772	71784	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
136	NC_016256	TA	6	71809	71819	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016256	GA	6	72333	72343	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_016256	TTAGAC	3	73323	73339	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
139	NC_016256	AG	6	73446	73456	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016256	CT	6	74426	74436	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016256	CT	6	74644	74655	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
142	NC_016256	GA	6	75223	75233	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_016256	AT	6	75680	75690	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016256	AAG	4	76029	76041	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_016256	CCTT	3	76987	76997	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016256	AAG	4	77020	77032	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
147	NC_016256	TCCC	4	79215	79230	16	0 %	25 %	0 %	75 %	6 %	Non-Coding
148	NC_016256	AAGG	3	79482	79493	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
149	NC_016256	TGCG	3	79674	79685	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016256	TGTT	3	79786	79797	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_016256	TTTTC	3	80572	80587	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 67