ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 66

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016255	GGAA	3	1773	1784	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016255	GAGG	3	2119	2131	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016255	CTTT	3	2770	2781	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016255	AAAG	3	3992	4003	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016255	TCTT	3	4669	4679	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016255	GTCT	3	4711	4722	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016255	AT	7	5371	5384	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016255	TTGAA	3	5403	5416	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016255	CTTT	3	6107	6118	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
10	NC_016255	TAAC	3	6202	6212	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016255	CTTT	3	8275	8287	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
12	NC_016255	GCTT	3	9309	9320	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016255	AGAA	4	9519	9533	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016255	TC	6	10008	10019	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016255	TA	6	10402	10413	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016255	TTAT	3	10540	10551	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016255	GAA	4	10730	10740	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016255	GCAAA	3	13210	13223	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
19	NC_016255	CTT	4	13477	13490	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016255	TCTT	3	14126	14136	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016255	TC	6	14915	14925	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016255	TCG	4	15728	15739	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016255	CTT	4	15747	15759	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
24	NC_016255	GAAA	3	16003	16013	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016255	GGTC	3	18671	18683	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016255	AAAG	4	18717	18731	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016255	GTA	4	18732	18742	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016255	CTTT	3	18764	18775	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016255	GCCTC	3	18932	18946	15	0 %	20 %	20 %	60 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016255	TC	7	18962	18974	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
31	NC_016255	CT	6	19565	19577	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016255	CTTA	3	19732	19743	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016255	CAAAG	3	20446	20459	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016255	AAG	4	21022	21033	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016255	TCA	4	21694	21704	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016255	CTT	4	22260	22271	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016255	GT	6	22376	22386	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_016255	TCT	4	23145	23155	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016255	AAG	4	23221	23233	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016255	AGAA	3	23293	23305	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_016255	TCT	4	24341	24352	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_016255	CTT	4	25373	25383	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016255	TTC	4	25944	25956	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016255	TA	6	26144	26155	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_016255	AAG	4	26594	26605	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016255	CCT	4	27165	27175	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
47	NC_016255	TC	6	28830	28842	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016255	TAT	4	29268	29278	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016255	CTAA	3	30648	30658	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016255	CCTT	3	30707	30718	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016255	CCTA	3	30986	30997	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016255	AG	6	33361	33371	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016255	AGT	4	36443	36453	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_016255	CT	7	36465	36477	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
55	NC_016255	AAGT	3	36801	36812	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016255	GTC	4	37803	37813	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016255	TA	6	38744	38754	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016255	GA	7	39320	39332	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_016255	AGTA	3	39569	39580	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016255	GACT	3	40857	40867	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016255	ACT	4	41137	41148	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016255	AAACAA	3	41247	41265	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
63	NC_016255	TTC	4	41621	41632	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016255	AGA	4	43298	43308	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_016255	TA	7	43554	43567	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_016255	TA	6	43644	43654	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_016255	TTCT	3	43779	43790	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016255	GAA	4	44227	44239	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_016255	AGA	4	44849	44859	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016255	AAG	4	46243	46254	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016255	TTA	4	46327	46337	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016255	GAA	4	47612	47622	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016255	AT	6	48497	48507	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016255	AG	6	49068	49078	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016255	GTAAAG	3	49317	49333	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_016255	TCT	4	49481	49492	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
77	NC_016255	AT	6	49742	49753	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_016255	AG	6	49918	49928	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_016255	TC	7	51515	51527	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
80	NC_016255	CTTT	3	52939	52949	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016255	CCTT	3	53490	53501	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016255	GACT	3	54149	54161	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
83	NC_016255	TTTC	3	54972	54983	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016255	AAG	4	55654	55666	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_016255	CT	6	55709	55720	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016255	TA	6	56533	56544	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016255	CTT	4	57233	57245	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
88	NC_016255	CT	6	57903	57913	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016255	AAAAGA	3	58156	58173	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
90	NC_016255	AAG	4	58447	58458	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_016255	AAG	4	59149	59159	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016255	CG	6	59248	59259	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016255	TGTCCT	3	59956	59973	18	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
94	NC_016255	CTT	4	60333	60344	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016255	GAA	4	60830	60841	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_016255	CT	6	61700	61711	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016255	GAA	4	61929	61940	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016255	TCTT	3	62323	62333	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016255	TA	11	63170	63190	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016255	TA	6	63628	63639	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_016255	TC	7	64054	64066	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
102	NC_016255	CTTT	3	64158	64168	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016255	CTTT	3	64708	64719	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016255	TACT	3	67327	67337	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016255	AAAG	4	67872	67887	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_016255	TCT	4	68764	68774	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016255	TTGTC	3	70059	70073	15	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
108	NC_016255	AG	8	70347	70361	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_016255	AG	6	71073	71084	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016255	CCTC	3	71833	71844	12	0 %	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016255	CTTT	3	72260	72270	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016255	GTCT	3	72820	72830	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016255	AG	6	73417	73427	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016255	AAAG	3	73470	73481	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016255	AGGG	3	73625	73635	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016255	CTTT	3	73969	73979	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016255	AG	6	74292	74303	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016255	GAG	4	74485	74496	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016255	AT	6	75478	75489	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_016255	TG	6	76262	76272	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016255	GAAT	3	77649	77659	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_016255	GAG	4	78020	78031	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016255	TA	6	78458	78468	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016255	TAA	4	78600	78610	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016255	TGCT	3	80107	80117	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding

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