ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 60

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016254	GCAT	3	844	854	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016254	GCT	4	947	958	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016254	AGTT	3	1096	1106	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016254	TA	6	1228	1239	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016254	AAC	4	2824	2836	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016254	GAA	5	4562	4576	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_016254	AG	6	5653	5664	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016254	TTTA	3	6697	6709	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016254	TTCA	3	8734	8744	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016254	CA	6	9124	9134	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016254	TTTG	3	12715	12726	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016254	TCTT	3	13142	13152	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016254	AT	6	13186	13196	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016254	ACTT	3	13275	13285	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
15	NC_016254	AAG	4	13908	13918	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016254	GCAT	3	14289	14301	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016254	TCT	4	16004	16015	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016254	AGG	4	16364	16375	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016254	TAAG	3	16771	16783	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_016254	AG	6	19350	19360	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016254	AG	6	20076	20086	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016254	GAGT	3	20396	20407	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016254	TA	6	20500	20511	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016254	GAA	4	20755	20766	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016254	GAT	4	20776	20787	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_016254	ATCC	3	20821	20831	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_016254	AT	6	21621	21631	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_016254	TAGA	3	23956	23966	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016254	TAG	4	24127	24138	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016254	AGA	4	24629	24640	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016254	TATAG	4	25399	25417	19	40 %	40 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
32	NC_016254	CAA	4	25621	25632	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016254	TA	7	25792	25805	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_016254	TC	6	25852	25863	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016254	AGT	4	26304	26314	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016254	TA	7	26344	26356	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016254	AAAGT	4	26720	26738	19	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
38	NC_016254	AGTC	3	27308	27318	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016254	TA	6	28283	28294	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016254	GAA	4	29586	29597	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016254	TA	7	30080	30092	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016254	GTAA	3	30787	30798	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_016254	TTC	4	31297	31308	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016254	AG	6	31911	31921	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016254	CGG	4	31965	31975	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016254	CTCCTT	4	32053	32076	24	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016254	GAA	4	32333	32344	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_016254	CTTT	3	32611	32621	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016254	AGAA	3	32971	32981	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016254	AGA	4	34138	34149	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_016254	ATTTT	3	34673	34687	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016254	AAAG	3	35341	35352	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016254	ATC	4	36195	36206	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016254	CTA	4	37889	37903	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016254	ATC	4	38371	38383	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
56	NC_016254	TTC	4	38609	38620	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016254	CTGA	3	38686	38697	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016254	TTAG	3	38757	38768	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016254	AGA	4	39168	39178	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016254	TGCC	3	39811	39822	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016254	TCT	4	39854	39865	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016254	CAAT	3	41154	41165	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016254	AAAG	3	44415	44425	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_016254	TAAAG	3	44601	44615	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016254	TTA	4	46066	46076	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_016254	GAA	4	46567	46578	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016254	TA	6	47480	47490	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_016254	CT	6	48512	48522	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016254	CACG	3	49769	49780	12	25 %	0 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016254	GGC	4	51019	51029	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016254	AAG	4	51062	51072	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016254	AGAC	3	51302	51312	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016254	CTT	4	51530	51542	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
74	NC_016254	AAAAG	3	52450	52463	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016254	TC	6	52644	52654	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
76	NC_016254	CTCGT	3	52721	52735	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016254	CTT	4	53513	53525	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
78	NC_016254	GA	6	53901	53912	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016254	TGAA	3	54167	54177	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016254	GA	6	54869	54879	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_016254	TA	7	55246	55259	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016254	AGAGGG	3	55470	55487	18	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_016254	GA	7	55631	55643	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016254	GGAA	3	56634	56645	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016254	AATT	3	56759	56770	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016254	GCCT	3	57721	57731	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
87	NC_016254	CTT	4	58348	58359	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016254	CTT	4	58997	59007	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016254	CTT	4	59227	59237	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016254	TC	6	59344	59354	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016254	AG	6	60213	60223	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016254	AAG	4	62096	62107	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016254	GAA	4	62141	62151	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016254	TC	7	62661	62673	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016254	TC	6	62706	62716	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016254	CT	6	62911	62922	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016254	TAGT	4	63041	63055	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_016254	TCC	4	63572	63583	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016254	AAAG	3	63731	63742	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016254	GAG	4	64063	64073	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016254	TA	6	64423	64434	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016254	GA	6	64473	64484	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016254	CTT	4	64807	64818	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
104	NC_016254	TCT	5	65239	65253	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
105	NC_016254	CTT	4	65357	65368	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016254	TTTC	3	65407	65417	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016254	CTTT	3	66140	66152	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016254	GA	6	66305	66315	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016254	AG	6	66353	66363	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016254	CTT	4	66712	66723	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_016254	GAGAG	3	66826	66840	15	40 %	0 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_016254	CTT	4	67353	67363	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016254	TTC	4	67387	67398	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
114	NC_016254	TCC	4	67538	67548	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016254	TTCTT	3	69510	69524	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016254	GGTG	3	69885	69895	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_016254	CT	6	70657	70667	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
118	NC_016254	GAA	4	70958	70969	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016254	CAGG	3	71450	71462	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
120	NC_016254	TC	6	71769	71779	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016254	TCT	4	72292	72303	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016254	AT	6	73073	73084	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016254	AG	6	73614	73624	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016254	CTT	4	73681	73691	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016254	TTGT	4	75839	75854	16	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
126	NC_016254	CAT	4	76621	76632	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016254	CTTG	3	76690	76701	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016254	CGAT	4	76809	76824	16	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	Non-Coding
129	NC_016254	TA	7	76964	76977	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_016254	CT	6	78035	78045	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016254	CTT	4	78633	78644	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016254	TGG	4	79111	79122	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_016254	GCT	4	81040	81051	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016254	TCA	4	81945	81955	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016254	TATC	3	83513	83523	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016254	AT	10	83642	83661	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 60