ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 26

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016246	CTTT	3	375	386	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_016246	AT	7	933	946	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016246	TA	6	2163	2175	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_016246	AC	6	4525	4535	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016246	TA	7	5054	5066	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016246	CTT	4	5186	5197	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016246	TC	6	5878	5888	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_016246	AT	11	6142	6163	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_016246	CT	6	6628	6638	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016246	TGAA	3	7515	7526	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016246	GAA	4	7671	7682	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016246	TCT	4	7772	7784	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
13	NC_016246	CTTT	3	8978	8989	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016246	ACTC	3	9219	9230	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016246	CTT	4	9532	9542	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_016246	AG	6	10026	10037	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016246	CTT	4	11631	11642	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016246	AAAG	3	12298	12308	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_016246	TC	6	12407	12417	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016246	CTTA	3	13628	13639	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016246	CT	6	13961	13971	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016246	TTC	4	13987	13997	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016246	AG	6	14076	14086	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_016246	CT	6	14251	14261	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
25	NC_016246	AAAAGA	3	14459	14477	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_016246	AAAG	5	14813	14831	19	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
27	NC_016246	TC	6	15165	15176	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016246	CATT	3	15521	15531	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016246	TTTTC	3	16420	16434	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016246	CCT	4	17613	17624	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016246	GATC	3	18913	18923	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_016246	ACTTGG	3	18976	18992	17	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
33	NC_016246	AT	6	19267	19278	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_016246	GA	6	19505	19515	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_016246	AG	6	20080	20090	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016246	TC	7	21047	21059	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
37	NC_016246	CTT	4	21213	21224	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016246	AAG	4	21927	21938	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_016246	AAG	4	22911	22922	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016246	AGC	4	23643	23654	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016246	CT	6	25557	25567	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
42	NC_016246	TAA	4	26079	26089	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016246	TC	6	27107	27117	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_016246	TCCT	3	27156	27168	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
45	NC_016246	GAA	4	27499	27509	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_016246	GA	7	27821	27833	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_016246	TC	7	29131	29144	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
48	NC_016246	GA	6	29572	29582	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_016246	CGAA	3	29890	29900	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016246	CTCCTT	3	30531	30547	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
51	NC_016246	AAAAC	3	30631	30645	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
52	NC_016246	TCGG	3	30794	30805	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016246	CG	6	31017	31028	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016246	AT	6	31034	31044	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016246	GAA	6	31144	31161	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_016246	GA	7	31741	31753	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_016246	TCTG	3	31942	31952	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016246	AGA	4	32304	32314	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016246	AGA	4	32439	32450	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_016246	ATG	4	32604	32614	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016246	AT	6	33034	33045	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016246	TTCT	3	33237	33248	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_016246	AGC	4	33603	33614	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016246	TA	6	34155	34166	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_016246	AAG	5	34528	34542	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016246	GCT	4	35758	35769	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016246	CTTT	3	36559	36570	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016246	TCT	4	37221	37231	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_016246	AAAT	3	37401	37411	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016246	CG	6	37415	37426	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
71	NC_016246	AGACG	3	37768	37781	14	40 %	0 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
72	NC_016246	ATA	4	38221	38232	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016246	TCCC	3	39040	39051	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
74	NC_016246	TCT	4	40037	40049	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
75	NC_016246	CTT	5	40068	40081	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
76	NC_016246	TCCTT	3	40413	40427	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
77	NC_016246	CTTT	3	41623	41633	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016246	C	17	41782	41798	17	0 %	0 %	0 %	100 %	5 %	Non-Coding
79	NC_016246	AACT	3	42196	42206	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016246	CTTA	3	43284	43295	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016246	TA	6	43294	43305	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016246	GCG	4	43695	43705	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016246	TAAAAG	3	44257	44273	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_016246	AGAA	3	44447	44458	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016246	TA	7	46408	46420	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_016246	AAG	4	46812	46823	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_016246	GAAA	3	47305	47316	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016246	AAAG	3	47746	47756	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016246	ATAA	3	48510	48521	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_016246	GA	6	48651	48661	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016246	GTAGA	3	49507	49520	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016246	AATG	3	50417	50428	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016246	CCT	4	51852	51863	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
94	NC_016246	TA	7	52536	52549	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_016246	CT	6	53100	53110	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
96	NC_016246	CTTT	3	54199	54210	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
97	NC_016246	GAAA	3	54531	54542	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016246	CCAA	3	55200	55211	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
99	NC_016246	TCTT	3	56689	56699	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016246	T	13	57464	57476	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_016246	TA	6	57640	57651	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_016246	GCA	4	58163	58174	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
103	NC_016246	TACTT	3	58689	58702	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
104	NC_016246	GGAA	3	59094	59106	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_016246	ATA	4	59830	59841	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016246	CAG	4	60554	60564	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
107	NC_016246	TTCA	3	61306	61316	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016246	AT	6	62345	62356	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_016246	AT	6	63080	63091	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016246	GA	7	63403	63415	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_016246	GCAAA	3	63709	63722	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016246	AGA	4	64383	64394	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_016246	CCT	4	64953	64963	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016246	CTC	4	65225	65236	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
115	NC_016246	CCT	4	66252	66262	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016246	TGTT	3	67057	67068	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016246	CTTTCT	3	67417	67433	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
118	NC_016246	GGAGA	4	68030	68049	20	40 %	0 %	60 %	0 %	10 %	Non-Coding
119	NC_016246	AG	6	68572	68582	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016246	TGAA	3	68590	68600	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016246	AGGCT	3	68799	68812	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
122	NC_016246	CCT	4	69181	69192	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
123	NC_016246	CTT	4	69435	69445	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016246	TCT	5	69533	69547	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
125	NC_016246	CT	6	69575	69586	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016246	TC	6	69745	69755	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016246	TGAA	3	71095	71105	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016246	TGAA	3	71706	71716	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016246	TTTC	3	71952	71963	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016246	CTTTT	3	71969	71982	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016246	TTGT	3	72084	72095	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016246	GGCC	3	72612	72622	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016246	TC	6	72865	72875	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016246	CTTTT	3	73405	73418	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
135	NC_016246	AT	6	74655	74666	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016246	TCT	4	74743	74754	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
137	NC_016246	TAAT	3	74803	74814	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016246	GA	6	75268	75278	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016246	CTTT	3	75552	75563	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016246	TTCC	3	75730	75742	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
141	NC_016246	CCT	4	75951	75961	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
142	NC_016246	CTTT	3	76489	76501	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 26