ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 30

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016242	CTT	4	889	901	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
2	NC_016242	GAAA	3	1269	1281	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016242	GA	6	3308	3318	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_016242	AGC	4	3346	3357	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016242	TCT	4	3830	3840	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_016242	CTG	4	4068	4079	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016242	TA	7	4319	4331	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_016242	TA	7	7859	7871	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_016242	AAAG	3	7985	7995	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_016242	AAAG	3	8249	8261	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_016242	GGCT	3	8464	8474	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_016242	AAG	4	8577	8588	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016242	AGGG	3	8800	8810	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016242	TAAA	3	10394	10405	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016242	GAC	4	10549	10560	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016242	ATC	4	10855	10865	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
17	NC_016242	GCA	4	10892	10903	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_016242	GAA	4	10949	10960	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016242	TG	6	11430	11441	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_016242	ACGG	3	12131	12141	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
21	NC_016242	TAG	4	12452	12462	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_016242	CCCT	3	12646	12657	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016242	TTA	4	12738	12749	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016242	CTAAA	3	12967	12981	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
25	NC_016242	AT	6	15923	15933	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_016242	TTC	6	16802	16818	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
27	NC_016242	AGGT	3	17693	17704	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_016242	TTAA	3	17934	17945	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016242	TAA	4	17961	17973	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_016242	AGGC	3	18035	18045	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016242	TCGTAG	3	21853	21870	18	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
32	NC_016242	TAG	5	21931	21946	16	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_016242	TCA	4	22129	22139	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016242	CTA	4	22450	22461	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016242	CA	6	23152	23162	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
36	NC_016242	AGA	4	23268	23279	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016242	TTTC	3	26355	26366	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016242	CCTT	3	26432	26442	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
39	NC_016242	TATGA	3	26780	26793	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_016242	TCTT	3	26854	26864	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_016242	CTT	4	26888	26900	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
42	NC_016242	GTAG	3	27002	27012	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016242	TGG	4	27021	27032	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_016242	GTGC	3	27047	27057	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016242	CTA	5	27835	27848	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
46	NC_016242	CTA	4	28151	28162	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016242	TCTA	4	28377	28392	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016242	AAAGA	3	29933	29947	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_016242	TA	6	31256	31266	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016242	CT	6	31711	31721	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016242	AGG	4	32265	32276	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_016242	TTTC	3	32457	32467	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016242	CTA	4	32641	32652	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016242	CTA	4	33252	33262	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016242	CGAA	3	33647	33658	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016242	TAAA	3	33686	33696	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_016242	CTTT	3	33919	33930	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_016242	TGC	4	35008	35019	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016242	GTTT	3	35272	35282	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016242	GA	6	35497	35507	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_016242	ATC	4	35606	35617	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
62	NC_016242	AAGG	3	35795	35805	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_016242	ACTT	3	37244	37255	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
64	NC_016242	AGAA	4	37376	37391	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016242	GGAA	3	37593	37604	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016242	AG	6	38281	38292	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016242	ATT	4	38595	38607	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_016242	TTCTT	4	38864	38882	19	0 %	80 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
69	NC_016242	AAGA	3	39200	39211	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016242	ATG	4	39585	39595	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016242	AAGA	4	39684	39699	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_016242	AGA	4	40094	40105	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_016242	TATT	3	40319	40329	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016242	AG	6	41893	41903	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_016242	AGA	4	43436	43447	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_016242	TA	6	46091	46101	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016242	TA	6	46556	46566	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016242	AT	7	48408	48421	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_016242	GAAAGG	3	48736	48753	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
80	NC_016242	AG	8	49037	49051	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_016242	CTT	4	49121	49132	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
82	NC_016242	AGA	4	49203	49213	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_016242	CTATT	3	49418	49431	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
84	NC_016242	TA	6	51183	51194	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016242	CTT	5	52513	52528	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
86	NC_016242	TCT	5	52696	52709	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016242	GCGT	3	53661	53672	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_016242	AAG	4	53850	53860	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_016242	TGAA	3	54144	54154	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_016242	CTT	4	55017	55029	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
91	NC_016242	TGC	4	55508	55518	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
92	NC_016242	TCTT	3	55869	55880	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016242	TTGCT	3	56754	56767	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
94	NC_016242	CTC	4	57199	57209	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
95	NC_016242	CT	6	57256	57268	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016242	AG	9	57475	57491	17	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_016242	AATA	3	57688	57699	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_016242	CGGGA	3	57843	57856	14	20 %	0 %	60 %	20 %	7 %	Non-Coding
99	NC_016242	CT	6	58360	58370	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
100	NC_016242	TCTT	4	58495	58509	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
101	NC_016242	TC	6	59020	59030	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016242	AGA	4	59830	59842	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_016242	AAC	4	59868	59878	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016242	CCCG	3	60108	60118	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016242	TCT	4	60234	60245	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
106	NC_016242	TAAA	3	60685	60696	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016242	CTT	4	61116	61126	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
108	NC_016242	TTA	4	61804	61814	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016242	CCCT	3	65235	65246	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
110	NC_016242	ACT	5	65558	65572	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
111	NC_016242	AGA	4	65751	65761	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_016242	GTC	4	66087	66097	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016242	GAAC	3	66198	66208	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016242	CTTT	3	67356	67366	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
115	NC_016242	TTTC	3	68656	68667	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
116	NC_016242	TTTC	3	69035	69046	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_016242	GAT	4	69050	69061	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_016242	TA	6	69062	69073	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016242	AG	6	69712	69722	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016242	TTTATT	3	69914	69931	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
121	NC_016242	AACT	3	71096	71107	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
122	NC_016242	ATACAA	3	71282	71300	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
123	NC_016242	TGC	4	71822	71833	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
124	NC_016242	CTT	4	72241	72252	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_016242	GAG	4	72705	72715	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_016242	CATA	3	72747	72757	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
127	NC_016242	GAA	4	73131	73141	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_016242	TAG	4	73281	73292	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_016242	CT	6	73863	73873	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
130	NC_016242	TC	7	74481	74493	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
131	NC_016242	AAAGGT	3	75192	75208	17	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
132	NC_016242	TAAG	3	75554	75566	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_016242	GA	6	75680	75691	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_016242	AAGG	3	75753	75763	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016242	TA	6	76661	76671	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_016242	AAC	4	76807	76819	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
137	NC_016242	ATTC	3	77602	77614	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
138	NC_016242	CTTTA	3	78345	78359	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
139	NC_016242	AAAG	3	78825	78835	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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175	NC_016242	AAGC	3	101175	101185	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
176	NC_016242	GAAG	3	101825	101836	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_016242	GCTT	3	102029	102039	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
178	NC_016242	AT	7	102503	102515	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
179	NC_016242	AAAG	3	102570	102580	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 30