ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 55

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016236	AGGAG	4	185	205	21	40 %	0 %	60 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_016236	TGAG	3	1033	1043	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_016236	CT	6	1064	1075	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_016236	TCTT	3	1717	1727	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_016236	GGA	4	1839	1851	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_016236	CT	7	2545	2557	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
7	NC_016236	CT	6	3282	3293	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
8	NC_016236	CCG	4	3416	3427	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016236	TC	8	3542	3556	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016236	CT	6	3751	3761	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
11	NC_016236	GAA	4	3848	3859	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_016236	CTC	4	3993	4003	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
13	NC_016236	GTA	4	4411	4421	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_016236	AT	6	4948	4959	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016236	CTTT	3	5313	5324	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016236	TC	6	5342	5354	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
17	NC_016236	TC	6	5647	5657	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
18	NC_016236	TCTCCT	3	6032	6048	17	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
19	NC_016236	AGGG	3	6562	6572	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_016236	TA	6	7845	7856	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016236	AAAAGA	3	8029	8046	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_016236	TC	6	8196	8206	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
23	NC_016236	AT	6	8379	8390	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_016236	CTT	5	9805	9818	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
25	NC_016236	GAA	4	10052	10064	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_016236	TCT	5	10275	10289	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
27	NC_016236	TTTTC	3	11146	11161	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016236	AG	6	11399	11409	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_016236	AG	7	11495	11509	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016236	GA	6	11580	11590	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_016236	GA	7	11611	11623	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_016236	TCT	4	13802	13812	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_016236	AAGA	3	14124	14134	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_016236	GTA	4	14880	14891	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016236	ACTTA	3	15033	15047	15	40 %	40 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016236	CTTT	3	15960	15971	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016236	AT	6	16199	16210	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_016236	TA	10	18301	18319	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
39	NC_016236	AGA	4	18924	18935	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_016236	AT	6	19546	19557	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_016236	GAAA	3	20277	20288	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016236	TA	6	20367	20377	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_016236	CT	6	20673	20685	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
44	NC_016236	GCC	4	21637	21647	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
45	NC_016236	TA	6	21679	21690	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_016236	GAA	4	21992	22003	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_016236	AT	8	22495	22510	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_016236	GATAA	3	22548	22561	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_016236	TTTC	3	22728	22738	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_016236	TCCT	3	23161	23171	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
51	NC_016236	CAAGT	3	23477	23490	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016236	TC	6	24321	24331	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
53	NC_016236	GA	6	25985	25996	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016236	AAGG	3	28506	28516	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_016236	AT	6	29980	29991	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_016236	GAA	4	29998	30009	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016236	AGA	4	30345	30355	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_016236	AAGC	3	30513	30524	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_016236	GAAAA	3	31181	31195	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_016236	GAAA	3	31743	31754	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016236	TA	7	31797	31809	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016236	GAGAA	5	31812	31836	25	60 %	0 %	40 %	0 %	4 %	Non-Coding
63	NC_016236	AGAAA	3	32062	32076	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_016236	CTT	4	32393	32405	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
65	NC_016236	CTTT	3	32507	32518	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_016236	CTTA	3	32688	32699	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016236	CG	6	33109	33120	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	Non-Coding
68	NC_016236	GCA	4	33247	33258	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_016236	ACTT	3	33850	33860	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
70	NC_016236	AAAC	3	34129	34139	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016236	CCT	4	34203	34213	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
72	NC_016236	CT	6	34464	34474	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
73	NC_016236	TTCT	3	34691	34701	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_016236	CTTTA	3	34992	35006	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016236	AAAG	3	35525	35536	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016236	CT	6	35576	35586	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
77	NC_016236	CT	6	35609	35619	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
78	NC_016236	GAAA	3	36239	36250	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_016236	GA	6	36639	36649	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_016236	AGA	5	37567	37580	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_016236	AT	7	37937	37949	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_016236	AG	6	39544	39555	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_016236	TCT	4	39838	39849	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
84	NC_016236	TCCT	3	39917	39928	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
85	NC_016236	CT	6	40869	40880	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
86	NC_016236	TAT	4	41295	41307	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_016236	ACA	5	41700	41714	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
88	NC_016236	GAAA	3	41915	41926	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016236	ATCTT	3	43856	43869	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
90	NC_016236	AG	6	44211	44221	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_016236	AATG	3	44560	44572	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_016236	ATGT	3	44616	44627	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_016236	AG	6	44648	44658	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_016236	CTT	4	44753	44764	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_016236	AAGA	3	45075	45087	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_016236	CTT	4	45763	45773	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
97	NC_016236	TA	6	46056	46066	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_016236	AG	6	47957	47967	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_016236	AT	6	49120	49131	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_016236	GAAA	3	49195	49205	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_016236	TTCT	3	49926	49936	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_016236	TA	6	49937	49947	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_016236	TA	6	50555	50565	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_016236	ACT	4	52210	52220	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
105	NC_016236	ACT	4	53496	53508	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
106	NC_016236	TA	6	53511	53522	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_016236	ATCT	3	53753	53765	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
108	NC_016236	TAG	4	53767	53777	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_016236	GCAC	3	55582	55592	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
110	NC_016236	CT	6	57474	57484	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
111	NC_016236	AAGC	3	57787	57799	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
112	NC_016236	GT	6	58078	58088	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_016236	ACTT	3	59195	59205	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
114	NC_016236	ATCTT	3	59233	59247	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
115	NC_016236	AAGT	3	59262	59272	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_016236	GACTAT	3	60014	60030	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
117	NC_016236	TGAG	3	60515	60526	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016236	CTA	4	60793	60804	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
119	NC_016236	TC	6	61985	61995	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
120	NC_016236	CTAT	3	63586	63596	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
121	NC_016236	CTTT	4	64856	64871	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
122	NC_016236	TTTAC	3	65203	65217	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
123	NC_016236	AG	6	65363	65373	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_016236	CTA	4	66604	66614	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
125	NC_016236	ATA	4	67378	67389	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_016236	TCCC	3	67440	67451	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
127	NC_016236	GGCT	3	68308	68319	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
128	NC_016236	AG	6	70382	70392	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_016236	TCTT	3	70393	70404	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
130	NC_016236	CTT	4	70477	70487	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
131	NC_016236	TCT	4	70923	70934	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
132	NC_016236	TTCT	3	71136	71146	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
133	NC_016236	CATC	3	71389	71399	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
134	NC_016236	TC	6	71699	71709	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
135	NC_016236	CTTT	3	71779	71790	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_016236	TTTC	3	72048	72058	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
137	NC_016236	AAGA	3	72335	72346	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016236	GACT	3	74702	74712	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
139	NC_016236	CTTT	3	75197	75207	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
140	NC_016236	AGA	4	75460	75470	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_016236	AAGA	4	75659	75674	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
142	NC_016236	GAA	4	75703	75714	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
143	NC_016236	TGAA	3	76403	76413	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_016236	GTAA	4	77772	77788	17	50 %	25 %	25 %	0 %	5 %	Non-Coding
145	NC_016236	TA	6	77821	77831	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_016236	CTT	4	79200	79212	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
147	NC_016236	TC	6	79382	79392	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
148	NC_016236	TTTG	3	80679	80689	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_016236	CTTT	3	80793	80804	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
150	NC_016236	TTCT	3	81040	81051	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
151	NC_016236	TC	6	81773	81784	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
152	NC_016236	GCAAA	3	81977	81990	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
153	NC_016236	GGA	4	82329	82340	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
154	NC_016236	AGCG	3	82678	82688	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
155	NC_016236	GTC	4	83702	83712	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
156	NC_016236	TCT	4	83916	83926	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
157	NC_016236	GACAA	3	83973	83987	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
158	NC_016236	GTTT	3	84704	84715	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
159	NC_016236	GGAG	3	84966	84977	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
160	NC_016236	GCTTT	3	84981	84996	16	0 %	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
161	NC_016236	TC	7	85619	85631	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
162	NC_016236	AT	6	86226	86236	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Silene conica mitochondrion chromosome 55