ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Apatura ilia mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016062	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_016062	ATTTT	3	233	246	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_016062	TAT	4	530	541	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100014
4	NC_016062	ATTT	3	691	701	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35100014
5	NC_016062	T	14	848	861	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35100014
6	NC_016062	ATTT	3	863	873	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35100014
7	NC_016062	ATTA	4	1025	1039	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35100014
8	NC_016062	T	14	1247	1260	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35100014
9	NC_016062	GAG	4	2117	2127	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	35100014
10	NC_016062	ATA	4	2844	2855	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35100014
11	NC_016062	ATT	5	2850	2864	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	35100014
12	NC_016062	ATT	4	2889	2899	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35100014
13	NC_016062	AATT	3	3265	3277	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	35100014
14	NC_016062	TAA	4	3424	3435	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35100014
15	NC_016062	ATA	4	3851	3862	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_016062	T	17	3905	3921	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	35100014
17	NC_016062	ATT	4	3949	3959	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35100014
18	NC_016062	TAATT	3	4060	4073	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	35100014
19	NC_016062	TATTT	3	4242	4256	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	35100014
20	NC_016062	TCATTA	4	4319	4342	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	35100014
21	NC_016062	TAA	4	4695	4706	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35100014
22	NC_016062	ATT	5	5543	5556	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35100014
23	NC_016062	T	13	5821	5833	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35100014
24	NC_016062	TAAA	3	6324	6335	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	35100014
25	NC_016062	TA	6	6390	6400	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35100014
26	NC_016062	TAT	4	6631	6642	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100014
27	NC_016062	TAA	4	7258	7269	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35100014
28	NC_016062	ATAA	3	7618	7628	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35100014
29	NC_016062	ATA	5	7722	7736	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35100014
30	NC_016062	CAAA	3	7807	7818	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	35100014
31	NC_016062	AAAAAT	3	7964	7981	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	35100014
32	NC_016062	ATTAAT	3	8256	8273	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	35100014
33	NC_016062	ATCTA	3	8290	8303	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	35100014
34	NC_016062	TA	6	8861	8871	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35100014
35	NC_016062	AAAT	3	8981	8991	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	35100014
36	NC_016062	AAAAT	3	9070	9083	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	35100014
37	NC_016062	ATT	4	9390	9401	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100014
38	NC_016062	AT	7	9530	9544	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	35100014
39	NC_016062	A	13	9571	9583	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	35100014
40	NC_016062	AATT	3	9681	9692	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35100014
41	NC_016062	TAT	4	9945	9955	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35100015
42	NC_016062	ATTTT	4	9990	10009	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	35100015
43	NC_016062	TTA	4	10027	10038	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100015
44	NC_016062	T	12	10101	10112	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	35100015
45	NC_016062	TAA	4	10121	10132	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	35100015
46	NC_016062	ATTT	4	10294	10309	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	35100015
47	NC_016062	AT	29	10367	10422	56	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35100015
48	NC_016062	TAA	5	11001	11015	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	35100015
49	NC_016062	A	12	11782	11793	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	35100015
50	NC_016062	TAA	4	12181	12193	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	35100015
51	NC_016062	TA	7	12600	12612	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_016062	TA	6	12617	12628	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_016062	T	12	12878	12889	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_016062	TTTTA	3	13108	13123	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_016062	TAAT	4	13610	13625	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016062	AATT	3	13631	13642	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_016062	ATTT	3	13832	13844	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_016062	TAATTT	3	13845	13863	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
59	NC_016062	TAA	4	14537	14547	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_016062	TTAA	3	14739	14750	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_016062	T	26	14862	14887	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_016062	ATT	4	15016	15028	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_016062	ATTA	3	15039	15050	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016062	ATTA	4	15058	15073	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_016062	ATTA	4	15094	15109	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_016062	TA	12	15120	15142	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_016062	TA	11	15153	15174	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Apatura ilia mitochondrion