ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Polylabris halichoeres mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_016057	ATT	4	605	616	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100008
2	NC_016057	AGT	4	1184	1195	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_016057	TA	8	1220	1234	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_016057	AGT	4	1278	1289	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_016057	TA	8	1314	1328	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_016057	AGT	4	1372	1383	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_016057	TA	8	1408	1422	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_016057	AGT	4	1466	1477	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_016057	TA	8	1502	1516	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_016057	AGT	4	1560	1571	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_016057	TA	8	1596	1610	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_016057	AGT	4	1654	1665	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_016057	TA	8	1690	1704	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_016057	AGT	4	1748	1759	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_016057	TA	8	1784	1798	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_016057	AGT	4	1842	1853	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_016057	TA	8	1878	1892	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_016057	AGT	4	1936	1947	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_016057	TA	8	1972	1986	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_016057	AGT	4	2030	2041	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_016057	TA	8	2066	2080	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_016057	AGT	4	2124	2135	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_016057	TA	8	2160	2174	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_016057	AGT	4	2218	2229	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_016057	TA	8	2254	2268	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_016057	AGT	4	2312	2323	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_016057	TA	8	2348	2362	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_016057	AGT	4	2406	2417	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_016057	TA	8	2442	2456	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_016057	AGT	4	2500	2511	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_016057	TA	8	2536	2550	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_016057	AGT	4	2594	2605	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_016057	TA	8	2630	2644	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_016057	AGT	4	2688	2699	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_016057	TA	8	2724	2738	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_016057	AGT	4	2782	2793	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_016057	AT	7	3054	3066	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_016057	TAT	4	3477	3488	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100008
39	NC_016057	T	15	4558	4572	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	35100008
40	NC_016057	AT	6	4612	4622	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35100008
41	NC_016057	TGTT	3	4669	4679	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	35100008
42	NC_016057	T	18	4720	4737	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	35100008
43	NC_016057	TGTT	4	5640	5655	16	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	35100008
44	NC_016057	TTTA	3	6073	6083	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	35100008
45	NC_016057	TTA	4	6530	6541	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100008
46	NC_016057	TAT	4	6612	6622	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35100008
47	NC_016057	GTAT	3	6719	6729	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	35100008
48	NC_016057	TATTGT	3	7139	7155	17	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	35100009
49	NC_016057	ATT	4	8519	8531	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	35100009
50	NC_016057	TGTTT	3	8918	8932	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	35100009
51	NC_016057	T	12	9094	9105	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	35100009
52	NC_016057	TTAT	3	9348	9359	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	35100009
53	NC_016057	TAT	4	9746	9758	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_016057	AT	6	9799	9809	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	35100009
55	NC_016057	T	12	10516	10527	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	35100009
56	NC_016057	TTTG	3	10615	10626	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	35100009
57	NC_016057	T	13	10649	10661	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35100009
58	NC_016057	ATA	4	10862	10872	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_016057	T	13	11093	11105	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	35100009
60	NC_016057	ATTT	3	11313	11324	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	35100009
61	NC_016057	TAT	4	11360	11370	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35100009
62	NC_016057	TAAT	3	11542	11553	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	35100009
63	NC_016057	ATT	4	11802	11813	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	35100009
64	NC_016057	TTA	4	11884	11894	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	35100009
65	NC_016057	TACT	3	11971	11981	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	35100009
66	NC_016057	TAG	4	12304	12315	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	35100009
67	NC_016057	TTGT	3	12721	12732	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	35100009
68	NC_016057	GGTA	3	12769	12779	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	35100009
69	NC_016057	TGT	4	12975	12986	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_016057	CTTT	3	13011	13021	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
71	NC_016057	TTA	4	14423	14433	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Polylabris halichoeres mitochondrion