ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Wolffiella lingulata chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015894AAT444551266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
2NC_015894CAG49119221233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %34231627
3NC_015894AAGT3101710271150 %25 %25 %0 %9 %34231627
4NC_015894TA8152315371550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
5NC_015894T1218241835120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
6NC_015894T1318491861130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_015894TTTCT330553068140 %80 %0 %20 %7 %34231627
8NC_015894TGT433783388110 %66.67 %33.33 %0 %9 %34231627
9NC_015894TTTC335813592120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
10NC_015894CATT3392839391225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
11NC_015894TA6450045101150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
12NC_015894TA6460146111150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
13NC_015894TCTCT348104823140 %60 %0 %40 %7 %34231627
14NC_015894GAAT3513351451350 %25 %25 %0 %7 %34231627
15NC_015894TTATAT3562556431933.33 %66.67 %0 %0 %5 %34231627
16NC_015894TAT5564156561633.33 %66.67 %0 %0 %6 %34231627
17NC_015894TA7566356751350 %50 %0 %0 %7 %34231627
18NC_015894AAAT3689569061275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_015894AT6710271121150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
20NC_015894TAT4742474361333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
21NC_015894TA8772077341550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
22NC_015894GGATTT3788078981916.67 %50 %33.33 %0 %10 %Non-Coding
23NC_015894ATT4833983511333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_015894TTATA3846984841640 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
25NC_015894AAGA3891489251275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
26NC_015894GA6896889791250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
27NC_015894TCTAA4938894061940 %40 %0 %20 %10 %Non-Coding
28NC_015894TAA4952495361366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_015894AT6991399241250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_015894TA7997799891350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
31NC_015894AAAT310075100861275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_015894A13101321014413100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_015894CTTT31028210292110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
34NC_015894TCTTTA311324113411816.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
35NC_015894AGTGC315659156721420 %20 %40 %20 %7 %Non-Coding
36NC_015894A13159021591413100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
37NC_015894ATTT316045160561225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
38NC_015894A12162281623912100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
39NC_015894AT616943169531150 %50 %0 %0 %9 %34231627
40NC_015894TA1317176172022750 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
41NC_015894TAA617235172521866.67 %33.33 %0 %0 %5 %34231627
42NC_015894TCAA318422184331250 %25 %0 %25 %8 %34231628
43NC_015894CAA419061190721266.67 %0 %0 %33.33 %8 %34231628
44NC_015894GTA419465194761233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %34231628
45NC_015894T132020120213130 %100 %0 %0 %7 %34231628
46NC_015894GA620814208251250 %0 %50 %0 %8 %34231628
47NC_015894ATG422062220731233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %34231628
48NC_015894CAAA324179241901275 %0 %0 %25 %8 %34231628
49NC_015894TTCA524284243021925 %50 %0 %25 %10 %34231628
50NC_015894T122440024411120 %100 %0 %0 %0 %34231628
51NC_015894AT724448244601350 %50 %0 %0 %7 %34231628
52NC_015894GTT42522025231120 %66.67 %33.33 %0 %8 %34231628
53NC_015894CTT42710227113120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34231628
54NC_015894TCA427579275891133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %34231628
55NC_015894TATAAT329557295731750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
56NC_015894AATATA329668296841766.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
57NC_015894TAT429725297351133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
58NC_015894TAAT330192302041350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
59NC_015894A17305493056517100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
60NC_015894ATAA330636306471275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_015894TTTG33076930779110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
62NC_015894AATA330932309431275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
63NC_015894ATCA330975309851150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
64NC_015894AAATAG331132311501966.67 %16.67 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
65NC_015894T133119531207130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
66NC_015894AAT431732317421166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
67NC_015894AT631841318511150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
68NC_015894TATAT332625326391540 %60 %0 %0 %0 %Non-Coding
69NC_015894AATT333272332841350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
70NC_015894ATA633285333031966.67 %33.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
71NC_015894TTAA333328333401350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
72NC_015894ATT433973339841233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
73NC_015894ATCAAT334504345211850 %33.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
74NC_015894TAATC334543345571540 %40 %0 %20 %6 %Non-Coding
75NC_015894ATAA334622346331275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
76NC_015894TATTAA334634346521950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
77NC_015894TA834672346881750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
78NC_015894TTA534689347041633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
79NC_015894AT734719347311350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
80NC_015894AT634882348921150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
81NC_015894ATA434898349081166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
82NC_015894TAA435151351621266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
83NC_015894TA635376353861150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
84NC_015894AATTAG335408354251850 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
85NC_015894TA635428354401350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
86NC_015894AATTT335470354841540 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
87NC_015894A14355893560214100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
88NC_015894GAG436307363171133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
89NC_015894GAAA338730387411275 %0 %25 %0 %8 %34231628
90NC_015894TTG43913539145110 %66.67 %33.33 %0 %9 %34231628
91NC_015894AG639818398281150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
92NC_015894TA640037400481250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
93NC_015894TC64041040420110 %50 %0 %50 %9 %34231628
94NC_015894AT1140696407152050 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
95NC_015894AAAAC340923409361480 %0 %0 %20 %7 %Non-Coding
96NC_015894TAT541614416271433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
97NC_015894CCAAT341822418351440 %20 %0 %40 %7 %34231628
98NC_015894ATG443122431321133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %34231628
99NC_015894AAG444216442261166.67 %0 %33.33 %0 %9 %34231629
100NC_015894AATG344615446261250 %25 %25 %0 %8 %34231629
101NC_015894CTA444685446961233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34231629
102NC_015894TTATT346884468981520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
103NC_015894T134773047742130 %100 %0 %0 %7 %34231629
104NC_015894A13488504886213100 %0 %0 %0 %0 %34231629
105NC_015894A16493154933016100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
106NC_015894AT749610496221350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
107NC_015894AT849632496461550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
108NC_015894TA649648496581150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
109NC_015894TATT349764497741125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
110NC_015894CT64998149991110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
111NC_015894ATA451315513251166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
112NC_015894AT651787517971150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
113NC_015894ATTA451851518651550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
114NC_015894TA652039520491150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
115NC_015894TAA452221522311166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
116NC_015894AAAGAT352433524501866.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
117NC_015894AGA452505525151166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
118NC_015894TAAAA352753527661480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
119NC_015894TTA453297533081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
120NC_015894AAAT353862538721175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
121NC_015894ATA554266542801566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
122NC_015894TAT554319543321433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
123NC_015894AT1154343543642250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
124NC_015894AAT454673546841266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
125NC_015894GAT455495555071333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %34231629
126NC_015894TAA457757577681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
127NC_015894TTAT458684586981525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
128NC_015894A12633626337312100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
129NC_015894TTAA365414654261350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
130NC_015894AT865543655571550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
131NC_015894TA665581655921250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
132NC_015894TTA466126661361133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
133NC_015894TAA766193662122066.67 %33.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
134NC_015894ATTT367888678981125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
135NC_015894ATGA369045690561250 %25 %25 %0 %0 %34231630
136NC_015894AAT469257692681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
137NC_015894TTGA370294703051225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
138NC_015894T127071870729120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
139NC_015894AG671028710381150 %0 %50 %0 %9 %34231630
140NC_015894TTTC37126071271120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
141NC_015894TTGT47208072095160 %75 %25 %0 %6 %Non-Coding
142NC_015894TATT372611726231325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
143NC_015894TAAG473265732791550 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
144NC_015894TAAA374444744551275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
145NC_015894AT874484745011850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
146NC_015894AT774506745191450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
147NC_015894ATTA374534745451250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
148NC_015894TATT375497755081225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
149NC_015894TA775663756751350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
150NC_015894ATTC376091761021225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
151NC_015894TAAA376238762481175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
152NC_015894ATTT376696767071225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
153NC_015894AAAT377808778181175 %25 %0 %0 %9 %34231631
154NC_015894TTA477939779511333.33 %66.67 %0 %0 %7 %34231631
155NC_015894ATTGT378447784611520 %60 %20 %0 %6 %34231631
156NC_015894TTCC37875378764120 %50 %0 %50 %8 %34231631
157NC_015894GTAA378856788671250 %25 %25 %0 %8 %34231631
158NC_015894ATTG378996790081325 %50 %25 %0 %7 %34231631
159NC_015894A18792017921818100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
160NC_015894TA879583795981650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
161NC_015894TTTC38209682107120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
162NC_015894TTTC38233982349110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
163NC_015894A14825588257114100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
164NC_015894TAA482569825801266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
165NC_015894TA683574835841150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
166NC_015894CATG383926839381325 %25 %25 %25 %7 %Non-Coding
167NC_015894ATAC384064840741150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
168NC_015894ATTTA384939849531540 %60 %0 %0 %0 %Non-Coding
169NC_015894ATGT385296853071225 %50 %25 %0 %0 %34231632
170NC_015894GAA488340883501166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
171NC_015894GGTTAT388835888531916.67 %50 %33.33 %0 %10 %34231632
172NC_015894CGAA388915889271350 %0 %25 %25 %7 %Non-Coding
173NC_015894ACAA389101891121275 %0 %0 %25 %0 %Non-Coding
174NC_015894TTTAA389314893281540 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
175NC_015894TTA589433894471533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
176NC_015894AAATA389462894761580 %20 %0 %0 %0 %Non-Coding
177NC_015894CTT49011090121120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
178NC_015894TTTA390310903201125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
179NC_015894TATT392059920711325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
180NC_015894GAT494003940131133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
181NC_015894TTCT39569795707110 %75 %0 %25 %9 %34231633
182NC_015894CTTT39684596855110 %75 %0 %25 %9 %34231633
183NC_015894GAT497000970111233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %34231633
184NC_015894TGAT398688987001325 %50 %25 %0 %7 %34231633
185NC_015894TGA498739987501233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %34231633
186NC_015894AATA399601996131375 %25 %0 %0 %7 %34231633
187NC_015894TTTC39966399674120 %75 %0 %25 %8 %34231633
188NC_015894A1710491210492817100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
189NC_015894TTTGTT3105499105517190 %83.33 %16.67 %0 %10 %34231633
190NC_015894TAC41063891064001233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
191NC_015894ATTTT31069381069521520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
192NC_015894TTCTT3107502107516150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
193NC_015894GAAA31081581081691275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
194NC_015894ATA41083371083471166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
195NC_015894ATCC31108451108561225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
196NC_015894TTCCC3111066111079140 %40 %0 %60 %7 %Non-Coding
197NC_015894GAGG31139581139691225 %0 %75 %0 %8 %Non-Coding
198NC_015894AGGT31141701141811225 %25 %50 %0 %0 %Non-Coding
199NC_015894TAAG31152901153001150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
200NC_015894TATATC31170281170441733.33 %50 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
201NC_015894TCTTT3117116117130150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
202NC_015894GGAA31173801173901150 %0 %50 %0 %9 %34231633
203NC_015894GAA41180801180911266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34231633
204NC_015894AAG41182251182361266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34231633
205NC_015894AGAA31182471182591375 %0 %25 %0 %7 %34231633
206NC_015894GGGT3119513119525130 %25 %75 %0 %7 %34231633
207NC_015894GAG41195561195671233.33 %0 %66.67 %0 %8 %34231633
208NC_015894A1812007912009618100 %0 %0 %0 %0 %34231633
209NC_015894ATCAA31207631207761460 %20 %0 %20 %7 %34231633
210NC_015894GAAT31210451210561250 %25 %25 %0 %0 %34231633
211NC_015894AAAC31216961217071275 %0 %0 %25 %8 %34231633
212NC_015894TC6122357122367110 %50 %0 %50 %9 %34231633
213NC_015894ATT41225391225501233.33 %66.67 %0 %0 %8 %34231633
214NC_015894GT6122925122935110 %50 %50 %0 %9 %Non-Coding
215NC_015894AGTG31229361229471225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
216NC_015894AAAT31231431231541275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
217NC_015894A1312326412327613100 %0 %0 %0 %0 %34231633
218NC_015894AGAT31237561237681350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
219NC_015894AAAT41239511239661675 %25 %0 %0 %6 %34231633
220NC_015894TCC4124008124019120 %33.33 %0 %66.67 %8 %34231633
221NC_015894AACT31240521240621150 %25 %0 %25 %9 %34231633
222NC_015894AATT31242591242701250 %50 %0 %0 %8 %34231633
223NC_015894AAG41253071253181266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34231633
224NC_015894TGTT3126044126054110 %75 %25 %0 %9 %34231633
225NC_015894TAT41264651264751133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
226NC_015894T25127527127551250 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
227NC_015894A1612757612759116100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
228NC_015894TGAA31280941281051250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
229NC_015894ATTT31281201281301125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
230NC_015894TCT4128798128809120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34231633
231NC_015894TAT41288631288741233.33 %66.67 %0 %0 %8 %34231633
232NC_015894ATTT31291581291681125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
233NC_015894TAA41291771291881266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
234NC_015894A1313146513147713100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
235NC_015894TA61315241315341150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
236NC_015894ATGA31320011320131350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
237NC_015894ATTG31321021321141325 %50 %25 %0 %7 %34231634
238NC_015894CGAT31321361321471225 %25 %25 %25 %8 %34231634
239NC_015894AT61328021328121150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
240NC_015894AT71337351337471350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
241NC_015894T14133803133816140 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
242NC_015894TTC5134813134827150 %66.67 %0 %33.33 %6 %34231634
243NC_015894TAA41351031351131166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34231634
244NC_015894TCTT5135339135358200 %75 %0 %25 %10 %34231634
245NC_015894TC6137238137249120 %50 %0 %50 %8 %34231634
246NC_015894T18138077138094180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
247NC_015894TA71384421384541350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
248NC_015894GTTT3139646139657120 %75 %25 %0 %8 %34231634
249NC_015894TAAT31401341401451250 %50 %0 %0 %8 %34231634
250NC_015894CATT31402961403071225 %50 %0 %25 %0 %34231634
251NC_015894T18141257141274180 %100 %0 %0 %0 %34231634
252NC_015894TTTC3141768141779120 %75 %0 %25 %8 %34231634
253NC_015894TTCT3142352142362110 %75 %0 %25 %9 %34231634
254NC_015894TTC4143118143129120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34231634
255NC_015894TCT4143260143271120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34231634
256NC_015894TTCC3143963143973110 %50 %0 %50 %9 %34231634
257NC_015894GATATA31443091443251750 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
258NC_015894GA61453641453741150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
259NC_015894ATTTT31454111454251520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
260NC_015894AAAG31456031456131175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
261NC_015894CTTA31460531460631125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
262NC_015894CTAC31471701471811225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
263NC_015894GGGAA31502741502871440 %0 %60 %0 %7 %Non-Coding
264NC_015894GGAT31504971505081225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
265NC_015894ACTAAT31538161538321750 %33.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
266NC_015894AGAAA31538331538471580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
267NC_015894GAAA31543791543901275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
268NC_015894AATAA31543931544071580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
269NC_015894AATA41544231544381675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
270NC_015894GTA41549531549641233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
271NC_015894T17156425156441170 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
272NC_015894CTA41586811586911133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %34231635
273NC_015894TGAA31616781616891250 %25 %25 %0 %8 %34231635
274NC_015894TTCT3162556162566110 %75 %0 %25 %9 %34231635
275NC_015894ATCA31626531626651350 %25 %0 %25 %7 %34231635
276NC_015894ATC41643421643531233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34231635
277NC_015894AAAG31644981645081175 %0 %25 %0 %9 %34231635
278NC_015894ATTT31655191655301225 %75 %0 %0 %8 %34231635
279NC_015894ATC41673401673501133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding