ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Coptotermes formosanus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015800	ACT	4	2098	2108	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33990639
2	NC_015800	AGG	4	2148	2159	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	33990639
3	NC_015800	ATTA	3	3876	3887	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_015800	AAT	4	3912	3924	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_015800	ACT	4	4171	4182	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	33990639
6	NC_015800	TTAC	3	4601	4611	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	33990639
7	NC_015800	TCA	4	5027	5037	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33990639
8	NC_015800	TAA	5	5625	5640	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33990639
9	NC_015800	AAC	4	5645	5656	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33990639
10	NC_015800	CTA	4	5847	5858	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	33990639
11	NC_015800	TAA	4	6169	6179	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_015800	ACT	4	6477	6487	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	33990639
13	NC_015800	AAG	4	7112	7123	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33990639
14	NC_015800	CAA	4	7392	7402	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	33990639
15	NC_015800	AAG	4	7529	7540	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	33990639
16	NC_015800	AAAT	4	7624	7638	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	33990639
17	NC_015800	AAAC	3	8097	8108	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33990639
18	NC_015800	ACA	4	8285	8296	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33990639
19	NC_015800	AAAGA	3	9805	9818	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	33990640
20	NC_015800	AAC	4	10332	10343	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33990640
21	NC_015800	TA	6	10385	10395	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33990640
22	NC_015800	CAA	4	11560	11571	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33990640
23	NC_015800	CAAA	3	11821	11832	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	33990640
24	NC_015800	ACC	4	11958	11969	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	0 %	33990640
25	NC_015800	GAAAA	3	12077	12091	15	80 %	0 %	20 %	0 %	0 %	33990640
26	NC_015800	CAA	4	12588	12599	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	33990640
27	NC_015800	CAA	5	12714	12727	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
28	NC_015800	ACAA	8	13085	13115	31	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_015800	AATA	3	13465	13475	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_015800	ACA	4	13948	13959	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_015800	CAAA	3	14261	14271	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_015800	AAAT	3	15290	15301	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_015800	ATA	4	15405	15416	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_015800	AAAT	3	15852	15863	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_015800	ATA	4	15967	15978	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Coptotermes formosanus mitochondrion