Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Nelumbo lutea chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015605CT694104110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
2NC_015605TAAAAA32012181883.33 %16.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
3NC_015605A1622824316100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
4NC_015605AAATA72723053480 %20 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_015605CAG49819921233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %33436192
6NC_015605TAAT4164616601550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
7NC_015605ATTA4169617101550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_015605TAA5173217471666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_015605TTCTT317851799150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
10NC_015605GAA4300430151266.67 %0 %33.33 %0 %8 %33436193
11NC_015605AAAT3354735581275 %25 %0 %0 %8 %33436193
12NC_015605ATAA4480448191675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
13NC_015605ATA4513051401166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_015605AATATG3515051681950 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
15NC_015605TCTCT354685481140 %60 %0 %40 %7 %33436193
16NC_015605TTTC387868797120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
17NC_015605T1296119622120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
18NC_015605A129975998612100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_015605TTGG31028310293110 %50 %50 %0 %9 %Non-Coding
20NC_015605TTA410326103361133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_015605T131173311745130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
22NC_015605TTA414256142671233.33 %66.67 %0 %0 %8 %33436193
23NC_015605AAGAA314676146891480 %0 %20 %0 %7 %33436193
24NC_015605AAAT315307153171175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_015605TTA517689177031533.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
26NC_015605T121843418445120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
27NC_015605A12184461845712100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_015605GTTAAA318606186221750 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
29NC_015605TGT41878418794110 %66.67 %33.33 %0 %9 %33436193
30NC_015605TCGC31903719049130 %25 %25 %50 %7 %33436193
31NC_015605CGAT320097201091325 %25 %25 %25 %7 %33436193
32NC_015605T142065820671140 %100 %0 %0 %7 %33436193
33NC_015605TTCA324758247691225 %50 %0 %25 %8 %33436194
34NC_015605GAAT324861248711150 %25 %25 %0 %9 %33436194
35NC_015605GTT42571925730120 %66.67 %33.33 %0 %8 %33436194
36NC_015605TCAT329025290351125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
37NC_015605ATTTGA329183292001833.33 %50 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
38NC_015605CAG430305303161233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
39NC_015605TAG430554305651233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
40NC_015605TTTTA330659306731520 %80 %0 %0 %0 %Non-Coding
41NC_015605T163070430719160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
42NC_015605TAT431101311111133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
43NC_015605CACAAA332862328791866.67 %0 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
44NC_015605AACA334025340361275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
45NC_015605ATTC334498345081125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
46NC_015605ATA534607346201466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
47NC_015605TAT834633346552333.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
48NC_015605TTATAT434652346752433.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
49NC_015605TATATT334685347011733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
50NC_015605AAT534704347181566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
51NC_015605ATA434738347501366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
52NC_015605TAA834739347652766.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
53NC_015605T123496934980120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
54NC_015605TAAATA335163351801866.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
55NC_015605TAAG335202352131250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
56NC_015605AT735251352641450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
57NC_015605AATGA335344353581560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
58NC_015605TAG535585355981433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
59NC_015605TTCA335714357241125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
60NC_015605A17358313584717100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
61NC_015605CTTT33638436394110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
62NC_015605ATT436521365321233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
63NC_015605GAAA338460384711275 %0 %25 %0 %8 %33436194
64NC_015605GGA438662386731233.33 %0 %66.67 %0 %8 %33436194
65NC_015605GCTT33886338873110 %50 %25 %25 %9 %33436194
66NC_015605AG639670396801150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
67NC_015605TC64028940299110 %50 %0 %50 %9 %33436194
68NC_015605A17404154043117100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
69NC_015605A14404744048714100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
70NC_015605TAA440509405191166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
71NC_015605AT740577405891350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
72NC_015605GTAAT340708407211440 %40 %20 %0 %7 %Non-Coding
73NC_015605AATT342756427661150 %50 %0 %0 %9 %33436194
74NC_015605ATG442910429201133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %33436194
75NC_015605AATG344403444141250 %25 %25 %0 %8 %33436194
76NC_015605CTA444473444841233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %33436194
77NC_015605GCA444808448191233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %33436194
78NC_015605TG64484544855110 %50 %50 %0 %9 %33436194
79NC_015605AAGG348215482261250 %0 %50 %0 %0 %33436195
80NC_015605TTG44825448264110 %66.67 %33.33 %0 %9 %33436195
81NC_015605A12488044881512100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
82NC_015605AATCCA348892489091850 %16.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
83NC_015605GTA448912489221133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
84NC_015605TAA449571495811166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
85NC_015605TGTA350785507961225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
86NC_015605AATAT651191512213160 %40 %0 %0 %9 %Non-Coding
87NC_015605TA751249512611350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
88NC_015605AATAT451424514442160 %40 %0 %0 %9 %Non-Coding
89NC_015605ATT451533515431133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_015605TTAT351634516451225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
91NC_015605ATATT351658516721540 %60 %0 %0 %0 %Non-Coding
92NC_015605A13518605187213100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
93NC_015605TTGA352197522091325 %50 %25 %0 %7 %Non-Coding
94NC_015605CAAA352301523111175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
95NC_015605TA652931529411150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
96NC_015605AT653400534111250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
97NC_015605CTTT35364453656130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
98NC_015605TCT45368053691120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
99NC_015605GTTT35583755849130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
100NC_015605CTTATA355956559721733.33 %50 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
101NC_015605T185616456181180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
102NC_015605GGGTT35727857292150 %40 %60 %0 %6 %Non-Coding
103NC_015605TTTAA357663576761440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
104NC_015605AAATT358726587401560 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
105NC_015605ATTT358742587531225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
106NC_015605T145875958772140 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
107NC_015605TGT46146761477110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
108NC_015605TGCA362398624101325 %25 %25 %25 %7 %33436195
109NC_015605TTC46332063331120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
110NC_015605GTTA363493635031125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
111NC_015605TAG464212642231233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33436195
112NC_015605AGA464279642891166.67 %0 %33.33 %0 %9 %33436195
113NC_015605AAAT365382653931275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
114NC_015605TTAT366153661641225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
115NC_015605TGAA366870668801150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
116NC_015605TCA567319673321433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
117NC_015605ATTT367527675381225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
118NC_015605TATTAG369927699441833.33 %50 %16.67 %0 %0 %Non-Coding
119NC_015605GAAT369951699621250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
120NC_015605ATTTA470210702281940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
121NC_015605AAATT470257702772160 %40 %0 %0 %4 %Non-Coding
122NC_015605CTT47038870399120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
123NC_015605CTA470960709711233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
124NC_015605AGT472094721061333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
125NC_015605AAT572129721421466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
126NC_015605AGAA372234722451275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
127NC_015605TCGT37243272442110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
128NC_015605ATTACT372581725971733.33 %50 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
129NC_015605TA673540735501150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
130NC_015605TTTC37427474284110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
131NC_015605ACA474397744071166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
132NC_015605AAAAT374457744701480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
133NC_015605TATTT574506745302520 %80 %0 %0 %8 %Non-Coding
134NC_015605TAT474573745831133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
135NC_015605TTGA374592746021125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
136NC_015605T137466074672130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
137NC_015605GT67495774968120 %50 %50 %0 %8 %Non-Coding
138NC_015605AT675007750171150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
139NC_015605ATAA375072750821175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
140NC_015605TAATAT375270752861750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
141NC_015605AT875337753511550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
142NC_015605AAGAA375853758671580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
143NC_015605GAA475873758841266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
144NC_015605ATTT376537765471125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
145NC_015605TTTA377915779261225 %75 %0 %0 %8 %33436197
146NC_015605T167799578010160 %100 %0 %0 %6 %33436197
147NC_015605CATAA378018780321560 %20 %0 %20 %6 %33436197
148NC_015605TAT478208782201333.33 %66.67 %0 %0 %7 %33436197
149NC_015605ATAA378794788051275 %25 %0 %0 %8 %33436197
150NC_015605CTTT37902079031120 %75 %0 %25 %8 %33436197
151NC_015605TCATGT379039790551716.67 %50 %16.67 %16.67 %5 %33436197
152NC_015605A12829048291512100 %0 %0 %0 %8 %33436197
153NC_015605AAAG384360843701175 %0 %25 %0 %9 %33436197
154NC_015605AAATA485239852582080 %20 %0 %0 %5 %33436197
155NC_015605A14853978541014100 %0 %0 %0 %7 %33436197
156NC_015605ATCT385496855061125 %50 %0 %25 %9 %33436197
157NC_015605GGA487539875511333.33 %0 %66.67 %0 %7 %33436197
158NC_015605T128808088091120 %100 %0 %0 %8 %33436197
159NC_015605T128858788598120 %100 %0 %0 %8 %33436197
160NC_015605GTTA390040900501125 %50 %25 %0 %9 %33436197
161NC_015605AAAG390228902391275 %0 %25 %0 %8 %33436197
162NC_015605CAAT390366903761150 %25 %0 %25 %9 %33436197
163NC_015605GTTCA390493905061420 %40 %20 %20 %7 %33436197
164NC_015605CTT49188491895120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33436197
165NC_015605GAT493748937581133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %33436197
166NC_015605TTCT39543495444110 %75 %0 %25 %9 %33436197
167NC_015605CTTT39662196631110 %75 %0 %25 %9 %33436197
168NC_015605GAT496776967871233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33436197
169NC_015605TGAT398452984641325 %50 %25 %0 %7 %33436197
170NC_015605TGA498503985141233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33436197
171NC_015605AATA399371993831375 %25 %0 %0 %7 %33436197
172NC_015605GAAGGA31001571001741850 %0 %50 %0 %5 %33436197
173NC_015605TTCT3100475100485110 %75 %0 %25 %9 %33436197
174NC_015605TCCGG3102364102378150 %20 %40 %40 %6 %33436197
175NC_015605TTTCG3104967104980140 %60 %20 %20 %7 %33436197
176NC_015605TTTGTT3105385105403190 %83.33 %16.67 %0 %10 %33436197
177NC_015605TTAT41067891068041625 %75 %0 %0 %6 %33436197
178NC_015605ATCC31106151106261225 %25 %0 %50 %8 %33436197
179NC_015605T12110780110791120 %100 %0 %0 %0 %33436197
180NC_015605AAGG31109601109701150 %0 %50 %0 %9 %33436197
181NC_015605GAGG31136791136901225 %0 %75 %0 %8 %33436197
182NC_015605AGGT31138911139021225 %25 %50 %0 %8 %33436197
183NC_015605TAAG31150111150211150 %25 %25 %0 %9 %33436197
184NC_015605ATTT31160901161001125 %75 %0 %0 %9 %33436197
185NC_015605GGAA31171081171181150 %0 %50 %0 %9 %33436197
186NC_015605AGA81178321178542366.67 %0 %33.33 %0 %4 %33436197
187NC_015605TCT4118045118055110 %66.67 %0 %33.33 %9 %33436197
188NC_015605ATTT31185691185791125 %75 %0 %0 %9 %33436197
189NC_015605AATT31186191186301250 %50 %0 %0 %0 %33436197
190NC_015605AAG41196701196811266.67 %0 %33.33 %0 %8 %33436197
191NC_015605TG6121132121143120 %50 %50 %0 %8 %33436197
192NC_015605TTAT41211561211721725 %75 %0 %0 %5 %33436197
193NC_015605T13121210121222130 %100 %0 %0 %7 %33436197
194NC_015605AAAC31214161214261175 %0 %0 %25 %9 %33436197
195NC_015605CTTT4122024122038150 %75 %0 %25 %6 %33436197
196NC_015605ACA41221091221201266.67 %0 %0 %33.33 %8 %33436197
197NC_015605TCT4122122122133120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33436197
198NC_015605AAAT31238721238821175 %25 %0 %0 %9 %33436197
199NC_015605AT71258161258291450 %50 %0 %0 %7 %33436197
200NC_015605AGAA31269871269981275 %0 %25 %0 %8 %33436197
201NC_015605TA111277791278012350 %50 %0 %0 %8 %33436197
202NC_015605A1512963412964815100 %0 %0 %0 %6 %33436197
203NC_015605TC6131300131311120 %50 %0 %50 %8 %33436197
204NC_015605TAA41321561321671266.67 %33.33 %0 %0 %8 %33436197
205NC_015605CTT4133409133420120 %66.67 %0 %33.33 %8 %33436197
206NC_015605AGT41336001336111233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33436197
207NC_015605AAT41339261339361166.67 %33.33 %0 %0 %9 %33436197
208NC_015605ATTC31343511343621225 %50 %0 %25 %0 %33436197
209NC_015605AAT41347481347591266.67 %33.33 %0 %0 %8 %33436197
210NC_015605GTAT31347701347811225 %50 %25 %0 %8 %33436197
211NC_015605CTT4134836134846110 %66.67 %0 %33.33 %9 %33436197
212NC_015605T15134941134955150 %100 %0 %0 %6 %33436197
213NC_015605TTTC3135428135439120 %75 %0 %25 %8 %33436197
214NC_015605TTTA31354411354511125 %75 %0 %0 %9 %33436197
215NC_015605T15135829135843150 %100 %0 %0 %6 %33436197
216NC_015605TCT4135958135968110 %66.67 %0 %33.33 %9 %33436197
217NC_015605TCA41361361361461133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %33436197
218NC_015605TAG41361601361711233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33436197
219NC_015605TTCC3137849137859110 %50 %0 %50 %9 %33436197
220NC_015605ATAA41388651388791575 %25 %0 %0 %6 %33436197
221NC_015605CTTA31399461399561125 %50 %0 %25 %9 %33436197
222NC_015605CCTT3143997144007110 %50 %0 %50 %9 %33436197
223NC_015605A1214417614418712100 %0 %0 %0 %0 %33436197
224NC_015605GGAT31443411443521225 %25 %50 %0 %8 %33436197
225NC_015605ACTAAT31476291476451750 %33.33 %0 %16.67 %5 %33436197
226NC_015605ATAA41481631481781675 %25 %0 %0 %6 %33436197
227NC_015605ACCGG31525881526021520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
228NC_015605CCT4153525153536120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
229NC_015605CATAC31539211539341440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
230NC_015605AGAA31544821544921175 %0 %25 %0 %9 %33436201
231NC_015605CTCCTT3154792154809180 %50 %0 %50 %5 %33436201
232NC_015605ATCA31565031565151350 %25 %0 %25 %7 %33436201
233NC_015605TGAT31565981566101325 %50 %25 %0 %7 %33436201
234NC_015605ATC41581801581911233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %33436201
235NC_015605AAAG31583361583461175 %0 %25 %0 %9 %33436201
236NC_015605ATTT31593961594071225 %75 %0 %0 %8 %33436201
237NC_015605ATC41612091612191133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
238NC_015605GAA51630711630851566.67 %0 %33.33 %0 %6 %33436201