ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Calinaga davidis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015480	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_015480	AATT	3	782	792	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33174689
3	NC_015480	TTTAA	3	1263	1277	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_015480	TAT	4	1327	1339	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_015480	TAT	4	2020	2031	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33174689
6	NC_015480	AGG	4	2111	2122	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	33174689
7	NC_015480	GAAA	3	2230	2241	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	33174689
8	NC_015480	ATTT	4	2471	2486	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	33174689
9	NC_015480	ATA	8	2835	2858	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33174689
10	NC_015480	AATT	3	3260	3272	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33174689
11	NC_015480	TTAA	3	3330	3342	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33174689
12	NC_015480	AATT	3	3710	3720	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33174689
13	NC_015480	TA	12	3798	3820	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_015480	TATTTT	4	3926	3949	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	33174689
15	NC_015480	TTATCT	3	4349	4366	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	33174689
16	NC_015480	ATTT	3	4841	4852	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33174689
17	NC_015480	TTTC	3	4995	5006	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	33174689
18	NC_015480	ATT	5	5601	5615	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33174690
19	NC_015480	TTTTA	5	5624	5648	25	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	33174690
20	NC_015480	TTTC	4	6201	6216	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
21	NC_015480	TA	17	6215	6247	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_015480	TAT	5	6368	6382	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	33174690
23	NC_015480	TAAA	3	6415	6426	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	33174690
24	NC_015480	TTAA	3	6871	6882	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33174690
25	NC_015480	AAAT	3	6961	6972	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	33174690
26	NC_015480	TTA	4	7240	7251	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	33174690
27	NC_015480	TAA	4	7346	7356	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33174690
28	NC_015480	AATT	3	7379	7390	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33174690
29	NC_015480	TAA	4	7783	7795	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33174690
30	NC_015480	TA	6	7873	7883	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33174690
31	NC_015480	AGA	4	7886	7896	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	33174690
32	NC_015480	AAAAAT	3	8055	8072	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	33174690
33	NC_015480	ATC	4	8464	8475	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	33174690
34	NC_015480	AAAAT	3	9160	9173	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33174690
35	NC_015480	ATTAA	3	9504	9518	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	33174690
36	NC_015480	ATA	5	9651	9665	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33174690
37	NC_015480	TTAT	3	9977	9987	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33174690
38	NC_015480	ATTTT	4	10075	10094	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	33174690
39	NC_015480	TTTA	3	10120	10131	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	33174690
40	NC_015480	AATA	3	10171	10181	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	33174690
41	NC_015480	AAT	4	10319	10330	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	33174690
42	NC_015480	ATTT	4	10382	10397	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	33174690
43	NC_015480	TA	6	10626	10636	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	33174690
44	NC_015480	TCTT	3	10732	10742	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	33174690
45	NC_015480	ATTT	3	11057	11067	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	33174690
46	NC_015480	AATTTT	3	11361	11378	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	33174690
47	NC_015480	TATT	3	11463	11474	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	33174690
48	NC_015480	TTA	4	11508	11518	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	33174690
49	NC_015480	TA	7	11885	11897	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	33174690
50	NC_015480	TTAA	3	12124	12135	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	33174690
51	NC_015480	AAT	4	12225	12237	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	33174690
52	NC_015480	TAAAA	3	12296	12309	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	33174690
53	NC_015480	TAA	4	12334	12344	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	33174690
54	NC_015480	AAT	5	12602	12617	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	33174690
55	NC_015480	TAAAA	4	13104	13124	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_015480	TAAA	3	13171	13181	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_015480	TTA	4	13441	13452	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_015480	ATTTT	3	13512	13525	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_015480	ATT	4	13893	13904	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_015480	TATT	3	14013	14024	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015480	AATT	5	14044	14062	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
62	NC_015480	AAATT	3	14215	14229	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_015480	AAATT	3	14598	14612	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_015480	TTTA	3	14874	14885	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015480	T	24	14905	14928	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_015480	TAA	7	14927	14947	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_015480	TAAA	3	15026	15036	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_015480	TA	12	15097	15120	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Calinaga davidis mitochondrion